Boa noite. Você quis dizer: classificação genotípica das bactérias?
1 - TAMANHO DE DNA
2 - ÍNDICE CITOSINA-GUANINA (C/G)
3 - HIBRIDIZAÇÃO DE DNA
4 - SONDAS MOLECULARES: 50 - 100 pb (pares de bases)
5 - SEQUENCIAMENTO DE DNA
6 - RIBOTIPAGEM: RNAr 16S
7 - ANÁLISE PLASMIDIAL.
CARACTERÍSTICAS GENOTÍPICAS:
Genética bacteriana
O genoma bacteriano é composto por apenas um cromossomo. Esse cromossomo é apenas uma molécula de DNA de dupla fita e circular. Se encontra enovelado no centro da célula, chamado assim de nucléoide. Algumas bactérias podem apresentar dois cromossomos, mas são poucas; esse único cromossomo contém todos os genes necessários a sobrevivência da bactéria.
- Gene: trecho de DNA que codifica uma determinada proteína com uma função específica.
- Genótipo: é a seqüência de bases de um gene.
- Fenótipo: é uma proteína que exerce determinada função fisiológica.
- DNA: se esticado, teria em torno de 1mm de comprimento, para caber na célula bacteriana, ele se enovela. É uma estrutura em dupla hélice, formado por pares de bases nitrogenadas (adenosina, timina, citosina e guanina). Esses pares de base são unidos por pontes de hidrogênio (duas entre A-T e três entre C-G). Essas pontes são as responsáveis por dar resistência ao DNA.
O DNA bacteriano apresenta em torno de 4500 genes e por volta de 4 milhões de bases nitrogenadas.
- Replicação do DNA: é semi-conservativa e bidirecional. Por ação da DNA polimerase, uma das fitas é usada como molde, que ocorre em ambas as direções, sempre no sentido 5´3´. A replicação se inicia na origem de replicação, e termina no ponto de termino. Antes de iniciar a replicação, a topoisomerase desfaz a tensão na fita, que em seguida é aberta pela helicase. Por fim, a primase adiciona um primer para que a DNA polimerase possa iniciar a replicação. Essa replicação ocorre de forma continua no sentido 5´3´ e descontinua no sentido 3´5´ (isso gera os fragmentos de okasaki, blocos de nucleotídeos que depois são unidos pela ligase.
- Tradução: feita nos ribossomos, como nos eucariotos.
- Plasmídeos: são pequenas moléculas circulares de DNA extra-cromossômicos que podem ser compartilhados entre as bactérias, e são responsáveis por funções não essenciais a célula, como por exemplo a resistência a anti-bióticos e a produção de toxinas (a E.coli que produz a colicina, que mata outras E.coli mas de outras cepas, ajudando assim na sua instalação).
São pequenos, contendo entre mil e 30 mil pares de bases. Podem ser presentes ou não, em uma ou em várias espécies bacterianas.
- Variabilidade genética bacteriana: pode acontecer por meio de mutações, por recombinação ou por transferência de DNA.
- Mutações: é qualquer alteração no código genético, que pode até levar a uma mudança de fenótipo. Sempre muda o genótipo. As mutações acontecem raramente, e de forma espontânea, onde por erro da DNA polimerase, uma base é posta aonde não devia. Pode-se aumentar essa freqüência de mutabilidade usando-se agentes mutagênicos (como raios ultra-violeta, raios-x e raios-gama)
- Tipos de mutações: podem ocorrer por substituição de uma base nitrogenada, por inserção de uma nova base ou por deleção de uma já existente.
Elas podem ser misense ou nonsense: na primeira, se altera o aminoácido inserido mas não altera o fenótipo e na segunda, a alteração no aminoácido causa uma mudança de fenótipo.
- Recombinação: é a troca de fragmentos de DNA entre genomas. Essas recombinações podem ser homólogas ou não-homólogas.
- Recombinações homólogas: a troca ocorre entre regiões com seqüências semelhantes.
- Recombinações não-homólogas: a troca ocorre entre regiões com seqüências diferentes, com pouca homologia. Ex.: um vírus (um bacteriófago) com uma bactéria.
- Transferência de DNA: pode ser por transformação, conjugação ou transdução.
- Transformação: a bactéria capta DNA livre direto do ambiente, mas somente bactérias com a membrana permeável ao DNA o fazem (bactérias competentes). Ex.: Streptococcus pneumoniae
- Conjugação: Através de suas fimbrias, duas bactérias trocam material genético. O que não se sabe é se esse material genético passa por dentro da fimbria, ou se este serve apenas para aproximar as bactérias e a passagem se dá realmente por contato de membranas. Esse material genético é o plasmídeo.
- Transdução: é a codificação de toxinas bacterianas por genoma viral. Os bacteriófagos podem ser de dois tipos. Os fagos líticos, que fazem seu ciclo normalmente, que termina com a lise da célula, e os fagos lisogênicos, onde seu material genético ao entrar na célula fica em um estado quiescente se o meio não estiver favorável a sua reprodução. Ao voltar a ativa, por erro na hora da separação do material genético, esses vírus carreiam com eles pedaços de material genético bacteriano. Dessa forma, eles disseminam material genético de uma bactéria a outra.
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