Uma de suas contribuições foi a revelação de que os fungos não pertencem ao Reino Plantae. Para tanto, os cientistas perceberam que os fungos não produziam clorofila, que é um pigmento fundamental na fotossíntese realizada pelas plantas. Outras divergências foram as descobertas de que a parede celular dos fungos não contêm celulose e que eles não reservam amido para servir de fonte energética.
Portanto, a invenção do microscópio possibilitou aos cientistas perceber que os fungos não produzem clorofila, não têm a celulose como constituinte da parede celular e não utilizam o amido como reserva de alimento, mostrando que os fungos não fazem parte do Reino Plantae.
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