Os vertebrados tradicionalmente incluem o peixe - bruxa , que não tem vértebras adequadas devido à sua perda na evolução, embora seus parentes vivos mais próximos, as lampreias , façam. Hagfish, no entanto, possui um crânio . Por esta razão, o subfilo de vertebrados é por vezes referido como " Craniata " quando se discute morfologia.
A análise molecular desde 1992 sugeriu que o peixe-bruxa está mais relacionado com as lampreias, e também os vertebrados em um sentido monofilético . Outros os consideram um grupo irmão de vertebrados no táxon comum dos craniata.
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