Para o princípio da segregação, cada organismo possui dois alelos que codificam uma característica. Esses alelos segregam quando são formados os gametas, e um alelo vai para cada gameta. Como Mendel sabia que suas plantas de ervilhas tinham dois alelos codificando uma característica?
Através das reproduções das plantas, ele foi capaz de perceber os alelos se dividindo de forma igual. Sendo que na primeira geração as plantas exibiam um só fenótipo (embora carregassem os alelos heterozigotos) e na segunda geração foi possível reparar em mais genótipos sendo expressos (fenótipos).
Dois alelos, que codificam para cada característica, são segregados durante a produção de gametas por uma divisão celular meiótica. Isso significa que cada gameta conterá um único alelo para cada gene. O que permite que os alelos materno e paterno se combinem na prole, garantindo variação. Para cada característica, um organismo herda dois alelos, um de cada pai e isso significa que, nas células somáticas, um alelo vem da mãe e outro do pai. Estes podem ser homozigotos ou heterozigotos.
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