As bactérias se modificam para se adaptar aos ambientes?

Sim. Já é sabido inclusive que bactérias podem aproveitar sequências previsíveis de sinais ambientais, como variações de temperatura ou de oxigênio, para antecipar necessidades futuras e imediatamente se preparar para um novo cenário.

Sim, para sobreviver algumas bacterias se adpatam em meio aonde vivem assim ficam praticamente imune.