O ciclo krebs começa a acetilcoenzima A , produzia a partir do piruvato, que é produto da glicose, ou da oxidação de ácidos graxos pela B-oxidação. A coenzima reage com o ácido oxalacético formando o citrato, sendo que a reação é catalisado pela enzima citrato sintase. Apoia isso, o citrato perde água pela desidratação catalisa da pela enzima aconitase gerando o isocitrato.
A regulação delas se dá pelo acúmulo ou disponibilidade dos substratos, NADH para as reações de desidrogenação e ATP para as duas primeiras, sendo que a disponibilidade de Ca2+ nos músculos atua ativando a citrato sintase e a α-cetoglutarato desidrogenase, assim como o complexo da piruvato desidrogenase.
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