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AMINOÁCIDOS BIOQUÍMICA 2. Pilar Negreros 2 Estructura general Un aminoácido es una molécula orgánica con un carbono central, un grupo amino (-NH2), un grupo carboxilo (-COOH) y una cadena (habitualmente denominada cadena lateral o radical R) de estructura variable, que determina la identidad y las propiedades de cada uno de los diferentes aminoácidos. Los aminoácidos más frecuentes y de mayor interés son aquéllos que forman parte de las proteínas. Todos los aminoácidos componentes de las proteínas son L- alfa-aminoácidos. Esto significa que el grupo amino está unido al carbono contiguo al grupo carboxilo (carbono alfa) o, dicho de otro modo, que tanto el carboxilo como el amino están unidos al mismo carbono. Clasificación ◂ Existen cientos de radicales por lo que se conocen cientos de aminoácidos diferentes. ◂ Pero sólo 22 (los dos últimos fueron descubiertos en los años 1986 –Selenocisteína- y 2002 –Pirrolisina-) forman parte de las proteínas y tienen codones específicos en el código genético. ◂ Los aminoácidos protéicos, canónicos o naturales son aquellos que están codificados en el genoma y forman las proteínas de los seres vivos. ◂ Para los humanos y la mayoría de los seres vivos, los aminoácidos que forman sus proteínas son 20: ◂ Alanina, Arginina, Asparagina, Aspartato, Cisteína, Fenilalanina, Glicina, Glutamato, Glutamina, Histidina, Isoleucina, Leucina, Lisina, Metionina, Prolina, Serina, Tirosina, Treonina, Triptófano y Valina. ◂ El aminoácido número 21 es la Selenocistenína, que aparece tanto en eucariotas como procariotas arqueas, y el número 22 es la Pirrolisina que aparece solo en arqueas. Principales aminoácidos Existen muchas formas de clasificar los aminoácidos; las tres que se presentan a continuación son las más comunes: Según las propiedades de su cadena: Los aminoácidos se clasifican habitualmente según las propiedades de su cadena lateral: ◂ Neutros polares, polares o hidrófilos: serina (Ser, S), treonina (Thr, T), glutamina (Gln, Q), asparagina (Asn, N), tirosina (Tyr, Y). ◂ Neutros no polares, apolares o hidrófobos: alanina (Ala, A), cisteína (Cys, C), valina (Val, V), leucina (Leu, L), isoleucina (Ile, I), metionina (Met, M), prolina (Pro, P), fenilalanina (Phe, F), triptófano (Trp, W) y glicina (Gly, G). ◂ Con carga negativa o ácidos: ácido aspártico (Asp, D) y ácido glutámico (Glu, E). ◂ Con carga positiva o básicos: lisina (Lys, K), arginina (Arg, R) e histidina (His, H). ◂ A algunos también se les conoce como Aromáticos: fenilalanina (Phe, F), tirosina (Tyr, Y), triptófano (Trp, W) y prolina (Pro, P) (estos ya están incluidos en los grupos neutros polares y neutros no polares). Según su obtención: A los aminoácidos que deben ser captados como parte de los alimentos se los llama esenciales; la carencia de estos aminoácidos en la dieta limita el desarrollo del organismo, ya que no es posible reponer las células de los tejidos que mueren o crear tejidos nuevos, en el caso del crecimiento. Para el ser humano, los aminoácidos esenciales son: ◂ Valina (Val, V) ◂ Leucina (Leu, L) ◂ Treonina (Thr, T) ◂ Lisina (Lys, K) ◂ Triptófano (Trp, W) ◂ Histidina (His, H) ◂ Fenilalanina (Phe, F) ◂ Isoleucina (Ile, I) ◂ Arginina (Arg, R) ◂ Metionina (Met, M) A los aminoácidos que se pueden sintetizar en el propio organismo se los conoce como no esenciales y son: ◂ Alanina(Ala, A) ◂ Prolina (Pro, P) ◂ Glicina (Gly, G) ◂ Serina (Ser, S) ◂ Cisteína (Cys, C) ◂ Asparagina (Asn, N) ◂ Glutamina (Gln, Q) ◂ Tirosina (Tyr, Y) ◂ Ácido aspártico (Asp, D) ◂ Ácido glutámico (Glu, E) Estas clasificaciones varían según la especie e incluso, para algunos aminoácidos, según los autores. Se han aislado cepas de bacterias con requerimientos diferentes de cada tipo de aminoácido. Según la ubicación del grupo amino ◂ Alfa-aminoácidos: El grupo amino está ubicado en el carbono n.º 2 de la cadena, es decir el primer carbono a continuación del grupo carboxilo (históricamente este carbono se denomina carbono alfa). La mayoría de las proteínas están compuestas por residuos de alfa-aminoácidos enlazados mediante enlaces amida (enlaces peptídicos). ◂ Beta-aminoácidos: El grupo amino está ubicado en el carbono n.º 3 de la cadena, es decir en el segundo carbono a continuación del grupo carboxilo. Según la ubicación del grupo amino… ◂ Gamma-aminoácidos: El grupo amino está ubicado en el carbono n.º 4 de la cadena, es decir en el tercer carbono a continuación del grupo carboxilo. ◂ Delta-aminoácidos: El grupo amino está ubicado en el carbono n.º 5 de la cadena, es decir en el cuarto carbono a continuación del grupo carboxilo. 14 Algunos aminoácidos no protéicos tienen función propia, por ejemplo como neurotransmisores o vitaminas. Por ejemplo, la beta-alanina (utilizado por los deportistas para mejorar la resistencia) o el ácido gamma-aminobutírico (GABA) (neurotransmisor en mamíferos). Existen muchos aminoácidos no protéicos que juegan papeles distintos en la naturaleza. Ejemplos de estos aminoácidos no proteínicos son (hay muchos más): ◂ Sarcosina Etilglicina ◂ Ácido djencólico Hipoglicinas A y B ◂ Mimosina Aliina ◂ Canalina Canavanina ◂ Ornitina Homometionina ◂ Homoserina Homoarginina ◂ Homofenilalanina Homocisteína ◂ Homoleucina Cistationina ◂ Norvalina Ionización ◂ Tanto el carboxilo como el amino son grupos funcionales susceptibles de ionización dependiendo de los cambios de pH, por eso ningún aminoácido en disolución se encuentra realmente en la forma representada en la figura, sino que se encuentra ionizado ◂ A pH bajo (ácido), los aminoácidos se encuentran mayoritariamente en su forma catiónica (con carga positiva), mientras que a pH alto (básico) se encuentran en su forma aniónica (con carga negativa). Para valores de pH intermedios, como los propios de los medios biológicos, los aminoácidos se encuentran habitualmente en una forma de ion dipolar o zwitterión (con un grupo catiónico y otro aniónico). Propiedades De Ácido-base: Cuando los aminoácidos se ionizan. Cualquier aminoácido puede comportarse como ácido o como base, por lo que son sustancias anfóteras. Cuando una molécula presenta carga neta cero, está en su punto isoeléctrico. Si un aminoácido tiene un punto isoeléctrico de 6.1, su carga eléctrica será cero, cuando el pH sea 6.1 Los aminoácidos y las proteínas se comportan como sustancias Tampón. Propiedades ópticas: ◂ Todos los aminoácidos excepto la glicina tienen 4 sustituyentes distintos sobre su carbono alfa (carbono asimétrico o quiral), lo que les confiere actividad óptica; esto es, sus disoluciones desvían el plano de polarización cuando un rayo de luz polarizada las atraviesa. ◂ Si el desvío del plano de polarización es hacia la derecha (en sentido horario), el compuesto se denomina dextrógiro, mientras que si se desvía a la izquierda (sentido antihorario) se denomina levógiro. ◂ En la naturaleza es habitual encontrar solo una de ellas. ◂ Todos los aminoácidos protéicos son L-aminoácidos Propiedades químicas: ◂ Las que afectan al grupo carboxilo, como la descarboxilación. ◂ Las que afectan al grupo amino, como la desaminación. ◂ Las que afectan al grupo R o cadena lateral. Descarboxilación Desaminación “ 19 Solubilidad: No todos los aminoácidos son igualmente solubles en agua debido a la diferente naturaleza de su cadena lateral, por ejemplo si ésta es ionizable el aminoácido será más soluble. 20 Derivados El metabolismo de los aminoácidos produce muchísimas sustancias importantes en el cuerpo, por ejemplo: Las porfirinas que se forman a partir de la glicina, son la base estructural del grupo hemo- de la hemoglobina y la mioglobina A partir de glicina y arginina se sintetiza creatina y fosfocreatina la cual es una forma de almacenamiento de energía en los músculos. La histamina se origina de la histidina, esta involucrada en la inflamación, desencadenavasodilatación, vasoconstricción y movilización de células. La Tirosina es el precursor de la melanina, las catecolaminas y las hormonas de la tiroides. La Melanina es un pigmento del la piel y el pelo, que protege de los rayos ultravioleta; Las Catecolaminas son un grupo de compuestos como la Dopamina, neurotransmisor cerebral relacionado con las funciones motrices; La Adrenalina, hormona secretada en situaciones de alerta que aumenta la glucemia, el ritmo cardíaco y la presión arterial; y la Noradrenalina que desempeña funciones contrarias a la adrenalina. Las hormonas Tiroxina y Triyodotironina estimulan el metabolismo de los carbohidratos, lípidos y aminoácidos. Melanina Adrenalina Tiroxina La Serotonina y la Melatonina se forman a partir de Triptófano. La Serotonina es un neurotransmisor, induce el sueño, controla el apetito, inhibe la secreción gástrica, aumenta el peristaltismo, estimula la secreción de hormonas de la hipófisis, produce vasoconstricción, disminuye la contracción del corazón, aumenta la agregación plaquetaria y es bronco constrictor. La Melatonina tiene funciones similares, modula el sueño, además controla los ciclos reproductivos de acuerdo al fotoperiodo, recientemente se ha relacionado con el ciclo biológico.y el envejecimiento. Serotonina Melatonina 25
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