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ESTUDO DIRIGIDO – ENZIMAS 1. As enzimas são vantajosas porque possuem especificidade com o substrato que as permite possuir uma maior eficiência, além de trabalharem em soluções aquosas em condições de temperatura e pH adequados. 2. As enzimas regulatórias recebem sinais regulatórios e têm a capacidade de controlar o ciclo das vias metabólicas, o que organiza essa via e a torna mais objetiva, permitindo que ela não atue de maneira aleatória, estabelecendo uma ordem. Ex: glicose-6- fosfato liga-se a outra enzima e essa enzima participa da via de metabolização da glicose, até chegar a piruvato. 3. A energia de ativação de uma reação é a energia mínima que deve ser atingida para que a reação aconteça (diferença na energia das moléculas no estado fundamental e no estado de ligação das moléculas com a enzima). Os catalisadores, ao propor uma nova via na reação, fazem com que haja uma diminuição na energia de ativação da reação. 4. As energias de ativação são barreiras energéticas que devem ser transpostas para que moléculas mais complexas tornem-se moléculas mais simples. Caso não houvesse energia de ativação, a estabilidade das macromoléculas não seria mantida, e nenhuma das vias de anabolismo e catabolismo seria viável para a manutenção da vida. 10. A vantagem de as enzimas serem proteínas está no fato de que, por serem moléculas orgânicas, isso as permite ser sintetizadas pelas células sempre que necessário, tendo sua produção sempre controlada pelo DNA. Outra vantagem é que as proteínas são muito variadas, o que lhes permite atuar em diversas situações de temperatura, pH. A especificidade trazida pelo fato de a enzima ser uma molécula biológica também é algo que torna esse fato vantajoso. 13. O modelo de chave-fechadura diz que as enzimas possuem uma forma rígida que as permite associar-se de maneira perfeita ao substrato, sendo perfeitamente complementar a ele. Por não permitir o modelamento da enzima, esse modelo possui a falha de não dar a ela um espaço para que ele “se acomode” (margem de manobra) e promover mais ligações com o substrato. No modelo de encaixe induzido, há um modelamento da enzima ao substrato ao qual ela deve se ligar, o que traz a vantagem de a enzima poder atuar em substratos semelhantes, mas não necessariamente sendo os mesmos, participando de mais de um tipo de reação, aumentando sua eficiência. Além disso, facilita o processo permitindo ao substrato fazer mais ligações com a enzima, por ter uma maior superfície de contato com ela. 5 e 11. A inibição competitiva é aquela em que o inibidor se liga ao mesmo sítio de ligação da enzima, o que irá alterar o Km, pois será necessária uma maior quantidade de substrato para que ele se ligue à enzima e ocorra a reação. O aumento do Km é dado pela fórmula: Km. (1+[I]/Ki) , o que irá alterar toda a equação de cálculo da velocidade, alterando o ponto de encontro da reta do gráfico com o eixo do X e a inclinação do gráfico, mas não há alteração alguma na velocidade máxima. A inibição não-competitiva é aquela que irá alterar a Vmáx da reação. Nela, o inibidor não irá se ligar ao mesmo sítio de ligação do substrato, mas, ao ligar-se em outro sítio, irá gerar uma modificação na estrutura da enzima, o que irá fazer com que o substrato precise de mais tempo para realizar suas ligações com o substrato, fazendo com que a eficiência da reação seja diminuída. No gráfico, ocorre mudança no ponto em que a reta intercepta o eixo Y. Na inibição acompetiviva (ou mista), são levadas em consideração enzimas que possuem mais de um sítio de ligação da enzima com o substrato e só funciona se todos estiverem ocupados. Caso o inibidor ocupe um dos sítios, isso irá alterar o desempenho da enzima, alterando tanto o Km (aumenta) quando a Vmáx (diminui) da reação. Graficamente, isso altera os pontos em que a reta intercepta tanto o eixo X quanto o eixo Y. OBS: na questão 11, é só fazer o desenho dos gráficos de acordo com a explicação. 14. V = Vmax.[S] / Km + [S]; Esse novo método gráfico permite um estudo mais eficiente das reações, além de tornar mais precisas as informações sobre as reações, o que permitirá chegar a determinados sem que sejam promovidas reações. 12. O metanol é tóxico para as células pois, após ser convertido em formaldeído e, posteriormente, em ácido fórmico, acumula-se nas células, o que irá gerar uma acidez metabólica. O etanol é utilizado nesse caso porque ele irá competir com o metanol, o que irá evitar que o ácido fórmico se acumule nas células. 7. Não pode ser considerado Km, pois a enzima não segue o comportamento hiperbólico de Michaelis-Menten. Isso acontece porque ocorrem interações cooperativas entre múltiplas subunidades proteicas. A mudança em uma subunidade é traduzida em mudanças estruturais nas unidades subjacentes, facilitando a ligação enzima-substrato. 9. Com o efetor ligado à enzima, isso irá facilitar a ligação da enzima com o substrato, o que irá fazer com que seja necessária uma menor quantidade desse substrato. O inibidor alostérico fará o oposto, pois, ao ligar-se à subunidade, irá dificultar a ligação do substrato, sendo necessárias quantidades maiores dele. 6. Inibidores suicidas são compostos relativamente pouco reativos até se ligarem aos sítios ativos da enzima, e são feitos para participar dos primeiros passos da reação. Entretanto, em vez de a reação química produzir o produto normal, o inibidor é convertido em um produto muito reativo que irá se ligar a outras enzimas impedindo que o restante das reações ocorra. Assim, as drogas baseadas nessa estratégia apresentam a vantagem de apresentar poucos efeitos colaterais. 8. Porque as enzimas alostéricas, por possuírem mais de um sítio ativo, não obedecem à relação de Michaelis-Menten.
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