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Teste de Conhecimento avalie sua aprendizagem A sigla NCBI vem do inglês National Center for Biotechnology Information, no português equivale a Centro Nacional de Informação em Biotecnologia. O NCBI nada mais é do que uma plataforma online que é responsável pela criação e administração de vários: Á respeito da temática "alinhamento genômico" marque a opção correta. BIOINFORMÁTICA Lupa Calc. SDE4449_A7_202004285718_V1 Aluno: WALTER PEREIRA DO NASCIMENTO SILVA Matr.: 202004285718 Disc.: BIOINFORMÁTICA 2022.1 - F (G) / EX Prezado (a) Aluno(a), Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha. Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS. 1. Banco de dados restritos a laboratórios Banco de dados forenses Banco de dados pagos Bancos de dados não confiáveis Bancos de dados públicos Explicação: A sigla NCBI vem do inglês National Center for Biotechnology Information, no português equivale a Centro Nacional de Informação em Biotecnologia. O NCBI nada mais é do que uma plataforma online que é responsável pela criação e administração de vários bancos de dados públicos. 2. Os alinhamentos multiplos globais são método que exigem pouca capacidade computacional e, dependendo da quantidade de sequências envolvidas, pode requerer tempos curtos para processamento. Os traços que podem aparecer nas sequencias após o alinhamento são os indels, que representam as translocações que foram realizadas naquele genoma. Os alinhamentos genômicos são técnicas de comparação entre sequências biológicas, que utilizam algoritmos computacionais apenas para apontar as diferenças localizadas na mesma posição das sequências analisadas Softwares de alinhamento genômico analisam os diferentes tipos de alinhamentos e nos sugerem o ¿alinhamento ótimo¿ no final do processo. O BLAST é uma ferramenta de busca por alinhamento global básico par-a-par javascript:voltar(); javascript:voltar(); javascript:diminui(); javascript:aumenta(); javascript:calculadora_on(); O blast é um software de alinhamento local básico gerenciado pelo NCBI e muito utilizado nos estudos em bioinformática. A respeito desta ferramenta, marque a alternativa correta. Para isolar um determinado gene, podemos utilizar uma técnica de Biologia Molecular chamada de PCR (Polymerase chain reaction). Para realizar ua PCR, nós necessitamos de nucleotídeos, da enzima DNA polimerase, do cofator enzimático e de um par de____________. Complete a lacuna com a alternativa correta: A respeito da confecção dos primers, marque a resposta correta. Explicação: Resposta correta letra C 3. É uma ferramenta que compara uma sequência desconhecida com aquelas depositadas no computador do usuário. O blastp usa uma sequência de nucleotídeo de entrada e da como resultado uma sequência de proteína É um algoritmo capaz de realizar buscas baseadas em alinhamento que, apesar serem exatas apresentam um tempo de processamento alto. O blastn usa uma sequência de nucleotídeo de entrada e da como resultado uma sequência de proteína É um algoritmo capaz de realizar buscas baseadas em alinhamento que, apesar de não serem exatas, são confiáveis e muito rápidas. Explicação: Resposta letra A. O blast é uma ferramenta confiavel para análises rápidas e iniciais de um trabalho. 4. Helicases Primers Genomas Polimerases nucleotídeos Explicação: Para realizar ua PCR, nós necessitamos de nucleotídeos, da enzima DNA polimerase, do cofator enzimático e de um par de primers. 5. O programa PRIMER 3 é utilizado de forma customizada para a confecção de primers para uma sequência dada. O primer deve ter um conteúdo de GC de cerca de 75%. O primer deve apresentar temperatura de melt inferior a 50ºC. Primers devem apresentar hompolinucleotídeos na sua sequência. Primers são iniciados específicos confeccionados com tamanho variando de 50 a 100 pares de bases Explicação: Resposta correta letra C. A respeito dos alinhamentos genômicos, marque a alternativa correta. Com relação aos bancos de dados genômicos e alinhamento de sequências, marque a (s) alternativas que você julga como CORRETA(S) com V e a(S) INCORRETA(S) com F. O BLAST permite um alinhamento localizado de fragmentos de sequência a partir da seleção das sequências mais similares. O resultado da busca é apresentado em valores de score que expressam a significância do alinhamento.Em relação ao algortimo blast assinale a alternatica correta: 6. O alinhamento global busca o maior número de matches do início ao final das sequências O ClustalW é programas de alinhamento local do genoma. O alinhamento global buscam pequenas regiões de similaridade. O alinhamento local é aquele que levam em consideração toda a extensão das sequências. Nos alinhamentos busca-se a menor quantidade de similaridade Explicação: O alinhamento global analisa toda a extensão da sequência, buscando o maior número de matches. 7. V O NCBI (National Center for Biotechnology Information) mantém o GenBank, que é uma coleção anotada de sequências de DNA disponíveis publicamente. V O CLUSTALW é uma das ferramentas mais comuns para alinhamento múltiplo de sequências. V A análise filogenética usa geralmente o alinhamento múltiplo de sequências. V O alinhamento múltiplo de sequências pode ser local ou global F Os métodos progressivos de alinhamento múltiplo de n sequências possibilitam calcular, na última fase, o alinhamento de todos os possíveis pares de sequências. Explicação: A unica incorreta é a letra C . Nos alinhamentos progressivos são Inicialmente realizados alinhamentos par-a-par de todos os possíveis pares. Nesta comparação, verifica-se apenas o número de caracteres diferentes entre as duas sequências (distância evolutiva).O algoritmo construirá um alinhamento através de programação dinâmica para estas duas sequências. A partir deste primeiro alinhamento, estas duas sequências serão agora tratadas como uma, e serão alinhadas à próxima sequência filogeneticamente relacionada. Todo o restante das sequências será alinhado baseando-se neste primeiro par. É um método rápido e amplamente utilizado para alinhar um grande número de sequências. 8. O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos que não são tão fidedignos, porém são confiáveis e rápidos. Isto faz com que o programa não ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento. O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos que não são tão fidedignos, porém são confiáveis mas não são rápidos. Isto faz com que o programa não ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento. O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos que não são tão fidedignos, porém não confiáveis e nem rápidos. Isto faz com que o programa ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento. O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos que não são tão fidedignos, porém são confiáveis e rápidos. Isto faz com que o programa ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento. O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos são fidedignos, porém são confiáveis e rápidos. Isto faz com que o programa ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento. Explicação: O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos que não são tão fidedignos, porém são confiáveis e rápidos. Isto faz com que o programa ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento. Não Respondida Não Gravada Gravada Exercício inciado em 15/06/2022 20:14:58. javascript:abre_colabore('35904','288726393','5528863508');
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