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Universidade Federal de Uberlândia Instituto de Genética e Bioquímica Profa. Msc. Bruna Barbosa de Sousa TRANSCRIÇÃO Funções do material genético Transferir as informações genéticas para os descendentes e coordenar a síntese de proteínas e enzimas determinando as características dos indivíduos. Expressão gênica A grande maioria das estruturas em uma célula ou é ou foi feita de proteínas. ETAPAS PARA EXPRESSÃO DE UM GENE: 1- Transcrição 2- Processamento do pré-mRNA 3- Tradução 4- Produto final: proteína Intermediário na síntese proteica 1- Transcrição em procariotos 2- Transcrição em eucariotos 3- Processamento do transcrito primário CONTEÚDO Estrutura do RNA Cadeia simples de ribonucleotídeos - Fita simples; - Ribonucleotídeos ligados por ligação fosfodiéster; - Orientação: 5’ 3’ - Ribonucleotídeos são adicionados na extremidade 3’OH C Tipos de RNA mRNA – transfere as informações do DNA para os ribossomos (citoplasma), onde será traduzido. tRNA – leva os aminoácidos até os ribossomos. rRNA – parte funcional e estrutural do ribossomo. snRNA – núcleo de células eucariotas (splicing). Replicação Transcrição Tradução - Síntese de uma molécula de RNA à partir de uma molécula de DNA (cadeia de DNA fornece informação para síntese da cadeia de RNA) TRANSCRIÇÃO Ocorre no núcleo Propriedades da transcrição Complementaridade - DNA e RNA são complementares (híbrido DNA-RNA). A T G C C G U A Assimetria - a transcrição ocorre em apenas um filamento de DNA. DNA RNA Única enzima responsável: RNA polimerase - Reconhece e liga-se a sequências específicas do DNA; - Desnatura o DNA expondo a sequência de nucleotídeos a ser copiada; - Mantem as fitas separadas na região da síntese; - Sintetiza RNA; - Crescimento da cadeia do RNA: 5’ 3’; - Não precisa de um primer; - Renatura o DNA após a síntese. Transcrição pela RNA polimerase • Ribonucleotídeos trifosfatos são adicionados liberação de pirofosfato (energia); • Ligação fosfodiéster; • Adiciona na extremidade 3’OH (5’ 3’); • Híbrido DNA/RNA são antiparalelos. Transcrição pela RNA polimerase Filamento molde (não-codificante) (3’ 5’): complementar ao RNA Filamento não-molde (codificante) (5’ 3’): tem a mesma sequência que RNA (com U substituindo T) Híbrido DNA/RNA são antiparalelos Transcrição pela RNA polimerase Transcrição em procariotos (mRNA) RNA polimerase: • Único tipo; Realiza a polimerização Reconhecimento dos sinais de iniciação de transcrição no DNA • A transcrição não é um processo contínuo, como a replicação. • RNA polimerase: reconhece sequências de iniciação e terminação e também a fita correta que deve ser transcrita. Promotor (fator sigma) Sequência terminadora RNA polimerase de procariotos Transcrição em procariotos Transcreve apenas genes cujos produtos são necessários para a célula naquele momento. ESTRUTURA GERAL DE UM GENE Promotor: sequência específica do DNA reconhecida pela RNA polimerase (início da transcrição). Região transcrita: região do DNA que serve de molde para a síntese do mRNA. Finalizador: sequência específicas do DNA que sinalizam o produto da RNA polimerase. FITA NÃO-MOLDE: Transcrição em procariotos INÍCIO Reconhecimento de sequências específicas no DNA ALONGAMENTO Incorporação dos ribonucleotídeos TERMINAÇÃO Sequências no DNA são reconhecidas e a transcrição é interrompida Transcrição em procariotos Regiões do DNA no início dos genes com sinais que permitem a RNA polimerase se ligar e iniciar a transcrição. INÍCIO - Promotor Região promotora: sítio de ligação da RNA polimerase; Unidade transcricional: sequência transcrita em mRNA. Marcam o início da transcrição sequências consenso -10, -35 e elementos UP (-50). Sequência -10 ou caixa de Pribnow: consenso TATAAT (desnaturação) Sequência -35: consenso TTGTCA Elemento upstream (-50): rico em A e T Mutações diminuem a eficiência do promotor e a taxa de transcrição do gene Transcrição em procariotos RNA polimerase FITA NÃO-MOLDE: PROMOTOR: Transcrição em procariotos Próximo da sequência consenso Taxa de transcrição PROMOTOR Transcrição em procariotos Transcrição de 5 – 10 bases Bolha de transcrição Início da transcrição Início da transcrição Transcrição em procariotos ALONGAMENTO Transcrição em procariotos Ligação fosfodiéster (5’ 3’) 1. Abertura da bolha de transcrição no DNA dupla fita 2. Ribonucleotídeos são adicionados a partir de um sítio específico (iniciação) 3. Bolha de transcrição tem 10 a 12 nucleotídeos de cada vez 4. Formação de ligações fosfodiéster unindo os ribonucleotídeos do mRNA Alongamento da transcrição TÉRMINO - Terminadores Reconhecimento da sequência terminadora: liberação do mRNA e da RNA polimerase. Rho-independente Rho-dependente ausência de rho provoca leitura ininterrupta (read-through) Cauda 3’ poli-U (independente de rô) Transcrição em procariotos Terminadores rho-independentes: os pares de base U-A (RNA-DNA) se desnaturam espontaneamente, liberando o mRNA e a RNA polimerase. Terminadores rho-dependentes: a proteína rho (helicase dependente de ATP) se liga a um sítio específico no mRNA (rut), translocando ao longo do mRNA, e liberado o mRNA e a polimerase. Transcrição em procariotos Terminadores rho-dependentes Transcrição em procariotos A RNA polimerase transcreve o DNA. Rho se liga ao sítio de reconhecimento do RNA. Rho se move ao longo do RNA, seguindo a RNA polimerase. A RNA polimerase faz uma pausa no terminador e é alcançada por Rho. Rho desenrola o híbrido DNA-RNA na bolha de transcrição. Terminação: a RNA polimerase, Rho e o RNA são liberados. Estrutura do gene de um procarioto Transcrição em procariotos Promotor Região transcrita Terminador 3’ 5’ Estrutura do DNA de um procarioto Promotor Terminador Transcrição em procariotos Ausência de íntrons 3’ 5’ Região transcrita Estrutura do DNA de um procarioto Promotor Terminador Transcrição em procariotos 3’ 5’ Região transcrita Transcrição em eucariotos Transcrição em procarioto Transcrição em eucarioto RNA POLIMERASE PROMOTOR PROCESSAMENTO DO mRNA Transcrição em eucariotos RNA polimerase dos eucariotos possui três tipos (I, II e III) snRNA, segmento 5S do rRNA RNA polimerase dos eucariotos - Não conseguem localizar os promotores e se ligar de modo estável ao DNA; - Precisa interagir com proteínas fatores gerais de transcrição. Transcrição em eucariotos 1 2 3 4 5 6 Transcrição em eucariotos RNA polimerase de procarioto RNA polimerase de eucarioto Não tem atividade exonuclease Tem atividade exonuclease 3’ 5’ Dano não é permanente: - Vida curta; - Várias cópias. Transcrição em procarioto Transcrição em eucarioto RNA POLIMERASE PROMOTOR PROCESSAMENTO DO mRNA Transcrição em eucariotos Promotores - Sequência consenso: TATAAAA; - Localizada cerca de 30 bases antes do início da transcrição (-30 / direção upstream); - Semelhante à sequência -10 dos procariotos (TATAAT). TATA box - Início da transcrição: Fatores gerais de transcrição Transcrição em eucariotos INÍCIO Reconhecimento de sequências específicas no DNA ALONGAMENTO Incorporação dos ribonucleotídeos TERMINAÇÃO Sequências no DNA são reconhecidas e a transcrição é interrompida Transcrição em eucariotos INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO EM EUCARIOTOS TBP (TATA binding protein - subunidade do TFIID): - reconhece promotor (TATA box); - provoca alteração estrutural no DNA Estimula a ligação de outros fatores de transcrição à regiãopromotora Transcrição em eucariotos INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO EM EUCARIOTOS TFIIB: - Se liga ao TBP; - Recruta a RNA polimerase II ao complexo. Complexo TBP – TFIIB: sinaliza para a ligação da RNA polimerase II na região promotora do gene Transcrição em eucariotos INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO EM EUCARIOTOS RNA Polimerase II: - Se liga ao promotor no seu estado desfosforilado. TFIIF: - Se liga fortemente à RNA polimerase II; - Previne interações não-específicas da RNA polimerase II. Transcrição em eucariotos INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO EM EUCARIOTOS TFIIH: - Provoca desnaturação do promotor (helicase); - Ativa a RNA polimerase II (quinase). TFIIH Transcrição em eucariotos INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO EM EUCARIOTOS TFIIE TFIIE: - Controla função do TFIIH; - Intensifica desnaturação do promotor. Transcrição em eucariotos INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO EM EUCARIOTOS TFIIH: - Fosforila a RNA polimerase II ativa Complexo de alongamento Complexo de alongamento (RNA polimerase ativada alonga a fita de RNA) Liberação da maioria dos fatores de transcrição (exceto TBP) Transcrição em eucariotos ALONGAMENTO DA TRANSCRIÇÃO EM EUCARIOTOS • RNA polimerase desloca sobre fita molde adicionando ribonucleotídeos no RNA nascente no sentido 5’ 3’ TERMINAÇÃO DA TRANSCRIÇÃO EM EUCARIOTOS Transcrição em eucariotos • RNA polimerase reconhece sequência de terminação (semelhante ao Rho independente de procariotos – rica em par de bases A-T e A-U); • RNA polimerase é liberada da fita molde; • mRNA é liberado (endonuclease corta cerca de 20 nucleotídeos após sequência de terminação); • DNA renatura. Transcrição em eucariotos Transcrição em eucariotos Fatores de transcrição específicos Para que a transcrição ocorra em alta taxa de transcrição são necessários os fatores de transcrição específicos: ativadores Intensificadores Ativadores Fatores gerais de transcrição (enhancers) Transcrição ativada Transcrição a taxa basal Transcrição em eucariotos silencer Ativam transcrição Reprimem transcrição Modular a velocidade de transcrição RNA polimerase - Reconhece o ponto de início da transcrição (fatores de transcrição); - Reconhece qual das fitas deve ser usada como molde; - Percorre a dupla hélice de DNA separando-a em fitas simples e iniciando a transcrição em um ponto específico; - Utiliza uma das fitas do DNA como molde para produzir o polímero de ribonucleotídeos (a fita que permitir a produção de um RNA no sentido de 5' para 3'); - Identifica na fita de DNA o sinal (sequência especial de nucleotídeos) de fim de transcrição e abandona o DNA, deixando um RNA contendo a informação do gene transcrito. - Renatura o DNA imediatamento após a síntese. DNA polimerase RNA polimerase - Sintetiza uma cadeia de DNA complementar (5’ 3’); - Utilizam como substrato nucleotídeos trifosfatados; - Necessitam de enzima para provocar desnaturação; - Necessitam de sequências iniciadoras (primers). - Sintetiza uma cadeia de RNA complementar (5’ 3’); - Utilizam como substrato nucleotídeos trifosfatados; - Provocam desnaturação do DNA; - Não necessitam de sequências iniciadoras (primers). Vídeo transcrição: https://www.youtube.com/watch?v=jwKtoJF6fGg https://www.youtube.com/watch?v=fynGKohVYHw Vídeo transcrição computador https://www.youtube.com/watch?v=jwKtoJF6fGg https://www.youtube.com/watch?v=jwKtoJF6fGg https://www.youtube.com/watch?v=fynGKohVYHw https://www.youtube.com/watch?v=fynGKohVYHw Transcrição em procarioto Transcrição em eucarioto RNA POLIMERASE PROMOTOR PROCESSAMENTO DO mRNA Transcrição em eucariotos Processamento do mRNA “Transcrição acoplada à tradução” mRNA sofre processamento DNA Transcrito primário, hnRNA ou pré-mRNA mRNA Transcrição Processamento - Modificação no terminal 5’ adição de 7-metilguanosina (cap) - Modificação no terminal 3’ adição de cauda poli-A - Remoção de sequências intermediárias (íntrons) Splicing 5’ 3’ 3’ 5’ 5’ 3’ 5’ 3’ Processamento do mRNA Transcrição em eucariotos A- Transcrição B- Início da transcrição: adição de 7-metilguanosina (cap) no terminal 5’ (guaniltransferase) - Evita que o mRNA seja degradado - Permite ribossomo reconhecer o começo do mRNA C- Fim da transcrição D- Endonuclease corta o mRNA 20 nucleotídeos após o sinal de terminação E- Adição de cauda poli-A (20 a 200 nucleotídeos com adenina) catalisada pela polimerase poli-A - Evita que o mRNA seja degradado - Ajuda no transporte do mRNA do núcleo para citoplasma F- Transcrito primário completo MODIFICAÇÕES NOS TERMINAIS 5’ E 3’ Adição de 7-metilguanosina (cap) no terminal 5’ ligação trifosfato (5’ 5’) Transcrição em eucariotos REMOÇÃO DAS SEQUÊNCIAS INTERMEDIÁRIAS (ÍNTRONS): SPLICING Íntrons Regiões não-codificantes (são removidas antes de irem para o citoplasma). Também ocorrem em rRNA e tRNA de eucariotos. Éxons Regiões codificantes (são exportadas para o citoplasma). mRNA 5’ 3’ Splicing: remoção dos íntrons e conecção das duas pontas dos éxons Autoprocessamento Spliceossomo Transcrição em eucariotos Splicing pré-mRNA ou hnRNA DNA Transcrição 3’ 5’ 5’ 3’ 5’ 3’ Transcrição em eucariotos Autoprocessamento Os próprios íntrons promovem o splicing RNA possui atividade catalítica (enzima) Ribozimas (RNA enzimático) Íntrons do grupo I associam-se com guanosina externa e são liberados. Íntrons com atividade enzimática: - Grupo I - Grupo II Transcrição em eucariotos Íntrons do grupo II associam-se com adenina interna e são liberados. Transcrição em eucariotos Spliceossomo snRNP = snRNA + proteínas Spliceossomo: máquina de excisão de íntrons + pré-mRNA O spliceossomo é capaz de reconhecer regiões específicas dos íntrons e formar ligações com as bases. Transcrição em eucariotos Alça em lariot Transcrição em eucariotos Transcrição em eucariotos - Diferentes tipos celulares - Diferentes estágios do desenvolvimento - Proteínas não-funcionais Splicing alternativo - Os éxons se ligam de maneira diferente durante o splicing splicing alternativo - Devido ao splicing alternativo, um único mRNA pode produzir diferentes proteínas Transcrito primário mRNA mRNA Plantas raro Humanos 70% dos genes sofrem splicing alternativo Transcrição em eucariotos Splicing alternativo Transcrição em eucariotos Processamento do mRNA em eucariotos Estrutura do gene de um eucarioto Transcrição em eucariotos Promotor Região transcrita Terminador 3’ 5’ TATA box Estrutura do DNA de um eucarioto Promotor Terminador Transcrição em eucarioto 3’ 5’ Íntron Íntron Íntron Éxon Éxon Região transcrita Estrutura do DNA de um eucariotoPromotor Terminador Transcrição em eucarioto 3’ 5’ Região transcrita Vídeo splicing: https://www.youtube.com/watch?v=A3u-CzP6pg8 https://www.youtube.com/watch?v=A3u-CzP6pg8 https://www.youtube.com/watch?v=A3u-CzP6pg8 https://www.youtube.com/watch?v=A3u-CzP6pg8 https://www.youtube.com/watch?v=A3u-CzP6pg8 Transcrição e processamento do tRNA e rRNA RNA polimerase I: síntese do rRNA (segmento 45S) RNA polimerase II: síntese do mRNA RNA polimerase III: síntese dos tRNAs, snRNA e segmento 5S do rRNA Transcrição em eucariotos rRNA rRNA 28S 18S 5,8S 5S 45S RNA polimerase I (nucléolo) 5S RNA polimerase III Transcrição em eucariotos Transcrição em eucariotos Transcrição do rRNA Transcrição do rRNA 45S ocorre no nucléolo e é catalisada pela RNA polimerase I Transcrição do rRNA 5S não ocorre no nucléolo e é catalisada pela pol III Transcrição em eucariotos 1 - Formação do transcrito primário rRNA 45S (nucléolo – poli I) e rRNA 5S (poli III); 2 - Associação do rRNA 45S com proteínas ribossomais; 3 - Remoção dos íntrons (45S 41S); 4 – Remoção dos íntrons e formação da subunidade menor (rRNA 18S); 5 - Remoção dos íntrons, formação da subunidade maior (rRNA 28S, 5,8S e 5S), emparelhamento de bases; 6 – Subunidades vão para citoplasma onde são finalizadas. Processamento do rRNA • Genes do 5S ficam fora do nucléolo, • Não ocorre formação de cap e cauda poli-A. Transcrição em eucariotos Transcrição do tRNA Transcrição em eucariotos 1-Formação do tRNA precurssor (núcleo); 2- Remoção de íntrons e pareamento de sequências complementares; 3- Em cada tipo de tRNA determinado grupo de nucleotídeos sofre alterações químicas e adição do trinucleotídeo CCA. 4- Transferência para o citoplasma. Processamento do tRNA • Não ocorre formação de cap e cauda poli-A. Nem sempre um gene codifica uma proteína. Os genes codificam tanto tRNA e rRNA, que são os produtos finais do gene, e nenhum deles é traduzido em proteína. ETAPAS PARA EXPRESSÃO DE UM GENE: 1- Transcrição 2- Processamento do pré-mRNA 3- Tradução 4- Produto final: proteína