Relatório BioInf 1

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Explorando bancos de dados de nucleotídeos
· Qual o título do artigo referente ao tutorial do Entrez citado acima?	
 Entrez: making use of its power.
· Mostre um screenshot da página de busca do Entrez fazendo uma busca por human colon cancer
Figura 1 – Print screen da página de busca do Entrez com todos os resultados para a pesquisa de “human colon cancer”
· Quantas sequências nucleotídicas existem relacionadas a este tema?
	Existem 42,856 de nucleotídeos para esse tema
· Abra em uma nova aba o link das sequências nucleotídicas do item 3 acima. Clique no link advanced e construa no builder uma busca por sequências onde o título contenha colon cancer e o organismo reflita humanos. Execute a busca. Mostre o termo de busca e o número de resultados
Termo de busca: (colon cancer[Title]) AND homo sapiens[Organism] Número de resultados: 22999
· Qual a definição do RefSeq? Por esta definição conseguiríamos atender os quesitos de qualidade e redundância?
	A definição de RefSeq de acordo com o site é “The Reference Sequence (RefSeq) collection provides a comprehensive, integrated, non-redundant, well-annotated set of sequences, including genomic DNA, transcripts, and proteins.” Acredito que por essa definição conseguiríamos atender os quesitos de qualidade e redundância, pois as sequências nesse banco de dados são curadas por especialistas.
· Aplicar o filtro RefSeq, aos filtros anteriores. Quantas sequências foram obtidas com todos os filtros?
	Foram obtidas 26 sequências.
· Para finalizar, perceba que os accession numbers começam com XM_ ou NM_. Explique a diferença entre estes?
	Os que começam com XM_ são sequências geradas por modelos computacionais enquanto que os NM_ são sequências geradas por métodos experimentais depositados no GenBank e curados pelo grupo do RefSeq.
	
· Qual destes você escolheria para satisfazer o critério de alta qualidade?
	Escolheria os NM_, pois eles possuem maior acurácia pelo fato de serem gerados por métodos experimentais. 
· Quantos registros de alta qualidade existem?
	Existem 6 registros de alta qualidade.
· Quais seus accession numbers?
	Seus accession numbers são:
NM_001350246.1
NM_001350247.1
NM_001350248.1
NM_001350249.1
NM_001350251.1
NM_006642.5