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Genética Microbiana Universidade Federal Rural do Semi-Árido Microbiologia para Ecólogos – ANI0238 Raphaela V .G. Barreto 13/05/2015 Considerações gerais • Genoma bacteriano – “geralmente” possui apenas um cromossomo circular (Nucleóide) e um ou mais de um plasmídeos circulares. • Recentemente com os projetos genomas, tem-se visto que cresce cada vez mais o número de procariotos com genoma linear. Células de E. coli mostrando nucleóides. Proteína da capa do bacteriófago T2 cercada por sua molécula de DNA linear e única. Considerações gerais • O tamanho médio dos genes bacterianos é de cerca de 900 a 1.000 pb. • Possui pouco espaço entre genes. • Possuem poucas sequências repetidas. • Os genes estão organizados em operons. • Acredita-se que este tipo de organização lhes confiram uma alta adaptabilidade. O comprimento do cromossomo da E. coli (1,7 mm) desenhado em uma forma linear relativamente ao comprimento de uma célula típica da E. coli (2 μm). Quase 850 vezes o tamanho da célula! cromossomo Plasmídeos • Descobertos nos anos 50 (Japão): genes de resistência em epidemia de disenteria por Shigella dysenteriae; • Molécula de DNA de fita dupla, circular e super- enovelada; • Alguns estão presentes em múltiplas cópias; Podem integrar-se ao cromossomo; Tamanho: 2Kb a 500 Kb até 1.600 Kb Plasmídeos • Carregam genes considerados não essenciais, embora sejam muito úteis. • Replicação autônoma (independente do cromossomo) Plasmídeos - funções Estrutura não essencial, mas que pode conferir vantagens ecológicas Exemplos: • Resistência a drogas e outros agentes antimicrobianos • Produção de fatores de virulência (toxinas, adesinas) • Degradação de substâncias inusitadas (ex. petróleo) • Alguns conferem mecanismos adicionais de transferência genética (conjugação) > plasmídios conjugativos São importantes ferramentas em Engenharia Genética!!! Tipos de plasmídeos e importância biológica • Plasmídeos conjugativos – controlam sua própria transferência pelo contato célula-célula (genes região tra – transferência): – Região tra – apresenta genes que codificam proteínas que atuam na transferência e replicação do DNA; – Caso o plasmídeo integre-se ao cromossomo, há a possibilidade de transferência do DNA cromossomal de uma célula para outra. Tipos de plasmídeos e importância biológica • Plasmídeos R - plasmídeos de resistência à antibióticos e vários inibidores de crescimento; • São facilmente transferidos entre as células; – R100 – confere resistência múltipla a sulfonamidas, estreptomicina, espectinomicina, ácido fusídico, cloranfenicol e tetraciclina; – Pode ser transferido entre Escherichia, Klebsiella, Proteus, Salmonella e Shigella. Tipos de plasmídeos e importância biológica • Plasmídeos que codificam para a produção de toxinas – Fornecem aos micro-organismos características relacionadas à virulência; – Podem ser ainda responsáveis pela produção de bacteriocinas Tipos de plasmídeos e importância biológica • Epissomos - Plasmídeos que são capazes de se integrar ao cromossomo e multiplicar-se com ele; Plasmídeos F (fertilidade) - controla o cruzamento e a troca de genes entre células de E. coli Regulação da expressão gênica • Controle negativo - mecanismo regulatório que interrompe a transcrição de genes. • Repressão enzimática – ocorre quando o produto está presente no meio inibindo a síntese pela célula Economia de energia!!! Regulação da expressão gênica - indução • Indução enzimática – a enzima é sintetizada somente quando o substrato encontra- se presente. Operon argCBH – repressão enzimática Indutores x correpressores • Indutor – induz à síntese enzimática; • Correpressor – reprime a síntese; • Moléculas pequenas, coletivamente chamadas de efetores. Podem ser artificiais (análogos estruturais) ou naturais. Modelo do operon lac • Modelo proposto por Jacob e Monod em 1961, para explicar a regulação da síntese de proteínas. • Genes da β-galactosidase, permease (envolvida no transporte da lactose para dentro da célula) e transacetilase (metabolisa outros açúcares). São todos genes estruturais. • Na presença de lactose os genes são todos transcritos e traduzidos simultaneamente. Operon lac – indução enzimática Alolactose (Indutor) INDUÇÃO REPRESSÃO Mutações Alterações de natureza herdável que ocorrem na sequência de bases de um ácido nucléico contido no genoma de um organismo Recombinação genética Recombinação genética é o processo pelo qual os elementos genéticos contidos em dois genomas distintos são reunidos em uma unidade. Novas combinações de genes podem surgir, mesmo não ocorrendo mutações e podem favorecer a adaptação a ambientes que sofrem variações. Mutações x recombinações • Mutação: pequenas alterações genéticas de uma célula; • Recombinação envolve geralmente alterações mais significativas. Genes completos, conjuntos de genes ou cromossomos inteiros podem ser transferidos de um organismo para outro. Procariotos: não apresentam qualquer tipo de reprodução sexuada. Possuem mecanismos de troca genética que permitem tanto a transferência de genes quanto sua recombinação. Mutações e mutantes • Mutante diferencia-se de sua linhagem parental quanto ao seu genótipo. • Fenótipo do mutante também pode apresentar- se alterado. Fenótipo mutante. (Fenótipo selvagem – linhagem natural, não mutada). Nomenclatura de genótipo e fenótipo mutante Genótipo: gene hisC de E. coli codifica uma proteína HisC (histidinol-fosfato aminotransferase). Ex. de mutantes de hisC: hisC1, hisC2 Fenótipo: His+ ou His- Isolamento de mutantes • Qualquer característica de um organismo pode ser modificada por meio de mutações. • Algumas mutações são selecionáveis: conferem vantagens ao organismo que a possui, enquanto outras são não selecionáveis, mesmo que promovam claras alterações no fenótipo do organismo. Diferentes tipos de mutação • Ex. de mutação não selecionável: perda de coloração de uma colônia (Detecção visual do aspecto diferente). • Ex. de mutação selecionável: Resistência às drogas. Confere vantagem ao organismo. A progênie pode crescer em abundância, podendo até substituir a linhagem parental. Mutantes nutricionais • Mutante nutricional (requer algum fator de crescimento): Auxotrófico • Linhagem parental: Prototrófica. • E. coli His- são auxotróficos para histidina. Seleção de mutantes nutricionais Seleção de mutantes na placa réplica Não tem enzimas necessárias ↓ metabolismo de nutrientes ou síntese de moléculas essenciais Bactérias prototróficas auxotróficas Ingredientes simples ↓ sintetizar todos nutrientes que necessitam para crescer e se reproduzir Meio mínimo meio suplementado com um ou mais nutrientes Meio mínimo: contem apenas nutrientes necessários para bactérias prototróficas. Meio completo: contem todas as substâncias necessárias para crescimento bacteriano. Fenótipo Tipo de alteração Detecção do mutante Auxotrofia Perda de enzima de uma via biossintética Incapacidade de crescimento em meios desprovidos do nutriente Resistência à droga Alteração da permeabilidade celular à droga, modificação do alvo ou detoxificação Crescimento em meio contendo a droga em concentrações inibitórias ao crescimento Ausência de cápsula Perda ou modificação da cápsula Surgimento de colônias pequenas e rugosas em vez de lisas e grandes Sensibilidade ao frio Alteração de uma proteína essencial Incapacidade de crescimento em temperaturas baixas Resistência aos vírus Perda de receptores Capacidade de crescer na presença de vírus Tipos de mutantes Bases moleculares das mutações • Mutações podem ser espontâneas (ação de radiação natural; erros de pareamento de bases) ou induzidas. • Mutações podem ser pontuais (substituições de bases, inserções ou deleções) • A alteração fenotípica decorrente deuma mutação depende do local exato do gene onde ocorreu a mutação, de qual nucleotídeo foi alterado e qual o produto codificado por aquele gene. Substituições de pares de bases Ex: Mutação pontual dentro de um gene de proteína. Troca de fase de leitura • Deleção ou inserção de alguns pares de nucleotídeos no DNA, alterando a fase de leitura de tradução. • As substituições de base e mutações de troca de fase de leitura podem ocorrer espontaneamente devido a erros ocasionais feitos durante a replicação do DNA. Mutações envolvendo muitos pb • Deleções: uma região do DNA é eliminada. Pode significar a remoção de vários genes! Pode ser letal, caso um desses genes exerça uma função essencial à célula. • Essas deleções não podem ser revertidas por novas mutações. O fenótipo pode ser restaurado apenas por recombinação gênica. Taxas de mutação • Frequência de erros durante a replicação do DNA varia de 10-7a 10-11 por par de base durante um único ciclo de replicação. • 1 gene= 1000 pares de bases - frequência de mutação de 10-4 a 10-8 por geração. • Vírus podem apresentar taxas de erros de 100 a 1000 vezes superiores!!!! Agentes mutagênicos • Ácido nitroso – pode converter a adenina em uma forma que não permite o pareamento com a timina. • Análogos de base – moléculas estruturalmente similares às bases nitrogenadas, mas possuem propriedades de pareamento de bases levemente alteradas. Bromouracil=Guanina 2-Aminopurina=Citosina Radiações mutagênicas • Ionizantes • Não ionizantes • Bases nitrogenadas absorvem radiação ultravioleta: pico em 260 nm. • Proteínas absorvem com pico em 280 nm (triptofano, fenilalanina e tirosina). Radiação ionizante • Forma mais poderosa de radiação: raios X, raios cósmicos e raios gama. • Provocam a ionização da água e de outras substâncias. Formação de radicais livres (OH-) que inativam macromoléculas celulares. Mutações decorrentes do reparo do DNA • Dímero de pirimidina – não for removido – célula morre! Alterações na taxa de mutação • Alterações na taxa de mutação Deinococcus radiodurans é 20 vezes mais resistente à radiação UV e 200 vezes mais resistente à radiação ionizante que a E. coli! Sistemas redundantes de reparo de DNA! Sobrevive onde outros organismos são incapazes de sobreviver. Transferência genética • Transformação – captação do DNA livre por uma célula receptora; • Conjugação – mediada por plasmídio (fragmento circular do DNA que tem replicação independente). Requer contato de célula a célula. As células devem apresentar padrões distintos para a presença de plasmídio. • Transdução – transferência do DNA por intermédio de um vírus. Experimento de Griffth - TRANSFORMAÇÃO Etapas da transformação • Competência – determinada geneticamente; regulada; envolve proteínas na captação e processamento do DNA (autolisinas, nucleases, etc). Bacillus: quorum sensing. • Captação do DNA – DNA de fita simples X fita dupla. • Integração do DNA transformante – recombinação. • Gêneros de bactérias naturalmente competentes – Acinetobacter, Azotobacter, Bacillus, Streptococcus, Haemophilus, Neisseria, Thermus. Conjugação
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