Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
GENÉTICA BACTERIANA TORTORA CAP 08 Microbiologia – Formação Geral 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Importância 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Genótipo e Fenótipo Genótipo ◦ Composição genética ◦ Propriedades potenciais Fenótipo ◦ Manifestação do genótipo ◦ Propriedades reais 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Genótipo: Estrutura do DNA 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto 2. Bases nitrogenadas 1. acúcar 3. fosfato Compactaçao do cromossomo depende de proteinas chamadas histonas 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto genoma cromossomo gene Pares de base Código genético 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Definições Genoma: toda a informação genética de uma célula Cromossomo: estrutura que contém o DNA e os genes Genes: DNA que codificam produtos funcionais Pares de base: unidades do DNA (nucleotídeos) Código genético: conjunto de regras que transforma a informação no DNA em proteína 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto CÓDON CÓDON CÓDON CÓDON CÓDON CÓDON CÓDON CÓDON GENE GENE GENE GENE CROMOSSOMO MATERIAL GENÉTICO EXTRACROMOSSÔMICO + GENOMA = Bases Nitrogenadas A T C G A T C G A T C G A T C G A T C G A T C G T A G C T A G C T A G C T A G C T A G C T A G C 5’ 3’ 3’ 5’ (letras) (palavras) (parágrafos) (capítulo) (livro) 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Organização do genoma de procariotos e eucariotos 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto cromossomo Ribossomos Grânulos Flagelo Plasmídio Pili(fímbria) Cápsula Parede Celular Membrana Citoplasmática Citoplasma Genoma bacteriano Geralmente um único cromossomo Geralmente circular Localizado no nucleóide 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Neisseria E. coli - cromossomo Genoma bacteriano tem DNA extracromosomal Plasmídeos: moléculas extracromossomais de DNA de fita dupla que podem replicar-se independentemente do cromossomo. Carregam genes que codificam funções não-essenciais (vantagens seletivas); ◦ Plasmídeos F : síntese de proteínas que se arranjam em pili de conjugação; ◦ Plasmídeos R : síntese de enzimas (resistência a antibióticos e metais pesados); ◦ Plasmídeos bacteriocinogênico: produção de colicinas por E. coli (Plasmídeos col); ◦ Plasmídeos de virulência: favorecem a virulência durante a infecção (Salmonella sp); ◦ Plasmídeos indutor de tumor em plantas: A. tumefaciens (plasmídeo Ti); ◦ Plasmídeo de degradação: síntese de enzimas catabólicas (Pseudomonas sp) 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto A informação genética Tradução Transcrição Replicação DNA RNA proteína 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto https://www.youtube.com/watch?v=yq ESR7E4b_8#aid=P-lUQeVW8fs Replicação Possibilita o fluxo de informação genética entre gerações; É semi-conservativa; ◦ Uma fita do DNA parental é conservada durante o processo (semiconservativa) ◦ A fita complementar é sintetizada novamente; 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Antibióticos que interferem na replicação Quinolonas (ácido nalidíxico, nofloxacina) ◦ Inibem as proteínas envolvidas em separar as fitas do DNA (girases e topoisomerases) 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Aplicação do conhecimento: • PCR – Reação em cadeia da polimerase A informação genética Tradução Transcrição Replicação DNA RNA proteína 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto O RNA 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Transcrição Produção de RNA a partir do DNA. Ocorre na presença da RNA polimerase Etapas: ◦ RNA polimerase se liga a fita de DNA (promotor) ◦ Síntese do mRNA ◦ RNA polimerase se desliga da fita de DNA ◦ O mRNA se desliga do DNA e ribossomos se ligam ao mRNA 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Antibióticos que interferem na transcrição Rifamicinas: se liga à RNA polimerase impedindo o elongamento da cadeia de mRNA. (tratamento de tuberculose - Mycobacterium) 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto A informação genética Tradução Transcrição Replicação DNA RNA proteína 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Tradução Síntese de proteínas a partir do mRNA Tipos de RNA: 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto rRNA tRNA mRNA Tradução O RNAm possui a informação para a síntese de proteínas; Moléculas de tRNA, se ligam cada uma a um determinado aminoácido; O RNAr se liga ao mRNA expondo o 1° e 2° códons; Um tRNA se liga ao primeiro códon do mRNA; Outro tRNA específico se liga ao 2° códon do RNAm; Os aa se ligam (ligação peptídica) e o 1° RNAt se desliga do mRNA; O RNAr se desloca sobre o mRNA, formando uma cadeia polipepitídica; O último códon no mRNA (códon terminal) determina que a proteína recém-formada se desligue do mRNA mRNA rRNA tRNA 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto https://www.youtube.com/watch?v=ETVEWEOPYNk Tradução Direção da Tradução (5´ 3´ no RNAm) Polipeptídeo Nucleotídeos Direção da Transcrição Promotor Fita molde RNA polimerase Ribossomo DNA RNAm mRNA rRNA tRNA aminoácidos 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Antibióticos que interferem na síntese proteica Macrolídeos e aminoglicosídeos: se ligam de forma irreversível ao ribossomo 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Streptomicina aminoglicosideo Eritromicina Macrolídeo Exercício Desenhar as três etapas do chamado “dogma da biologia” Colocar em cada etapa as classes de antibióticos que tem o mecanismo de ação correspondente: macrolideos, quinolonas, tetraciclinas, aminoglicosideos, e rifampicina. Mostre o mecanismo de ação (ou escreva) Dê um exemplo comercial desse antibiótico Essa atividade é individual! Cada um deve usar sua criatividade para fazer esse esquema. 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Mutações São alterações na estrutura química ou física do DNA Pode causar alteração no produto codificado pelo gene; Pode ser ocasionada por agentes físicos ou químicos (agentes mutagênicos); Mutante = organismo resultante da ação destes agentes; É fonte de variabilidade genética (matéria-prima para a evolução); Mutações Espontâneas: ◦ Causadas por erros durante a replicação do DNA ◦ Exposição do organismos a influências do meio ambiente (ex UV) ◦ Eventos raros 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Resistência aos antibióticos 1. mutações 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Resistência aos antibióticos 2. Transferência Genética 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Transformação Processo no qual o DNA livre no meio é tomado pela célula, resultando em alterações genotípicas desta01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Célula geneticamente transformada A recombinação ocorre entre o DNA doador e DNA receptor DNA não recombinado degradado Fragmentos de DNA de células doadoras DNA cromossômicos Célula receptora capta o DNA doador Célula receptora Transformação •Eletroporação •Choque térmico •DNA & sais Trasnformação pode ser feita artificialmente no laboratório 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Conjugação Mecanismo de transferência de informação genética; Requer contato entre as células (pili sexual- Fator F); Transferência de molécula de DNA extracromossômico (Plasmídeos); Transferência do DNA cromossômico total/segmentos (rara); 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Transdução O DNA bacteriano é transferido entre células mediado por um vírus; Os vírus transportadores são os bacteriófagos (fagos); Um bacteriófago virulento: Capaz de causar lise celular (lisogênico). Um bacteriófago temperado: Incorpora seu DNA ao DNA da bactéria (profago) e se replica com ele; Ciclo lisogênico. 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Genoma do Bacteriófago Profago nucleóide bacteriano DNA do fago Nucleóide bacteriano Nucleóide bacteriano Nucleóide DNA do fago + DNA bacteriano Nucleóide da bactéria receptora DNA do fago + DNA bacteriano DNA do fago + DNA bacteriano Nucleóide da bactéria receptora 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Plasmídeos Importância para interação com o meio ambiente ◦ Plasmídeos de degradação. ◦ Plasmídeos que codificam para enzimas catabólicas (capazes de utilizar compostos como tolueno, hidrocarbonetos de petróleo, etc). Importância para o estudo de doenças humanas ◦ Plasmídeos que codificam proteínas que aumentam a patogenicidade (fixação ou produção de toxinas). ◦ Plasmídeos que conferem resistência à antibióticos. Importância na biotecnologia ◦ Plasmídeos servem como VEICULOS para transportar genes entre células em engenheira genética 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Plasmídeos e resistência aos antibióticos 1. Seleção das bactérias mutantes 2. A característica pode ser passada para outras bactérias 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Resistência aos antibióticos 1. Mutação 2. Transferência para outras bactérias (ex, por conjugação) 3. Resistência natural: degradação do antibiótico; sistemas de transporte(entrada e saída), polissacarídeos externos 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Exemplo: resistência a Eritromicina (macrolideo) Mecanismo de ação: se liga ao RNA ribossomal de bactérias no sítio de ligação do tRNA -> impede a tradução Uma mutação apenas causa alteração no sítio que o antibiótico se liga -> não há ligação -> síntese proteica normal -> resistência APLICAÇÃO DO CONHECIMENTO 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Identificando agentes mutagênicos pelo teste de AMES Usa bactérias como indicadores criado por Bruce Ames ◦ Salmonella – mutante que não consegue crescer em meio de cultura sem o aminoácido histidina ◦ Inocula-se a bactéria em meio sem histidina ◦ Adiciona-se o agente mutagênico ◦ Se houver alteração no DNA (mutação) a bactéria reverte no fenótipo e passa a crescer no meio = agente mutagênico! 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Teste de Ames 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Identificação molecular de microrganismos Vantagens ◦ Sensitividade ◦ Especificidade ◦ Segurança ◦ Tempo Desvantagens ◦ Custo ◦ Profissionais treinados 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Aplicação: PCR Reação em cadeia da Polimerase Uma técnica que multiplica fragmentos de DNA ◦ Reação enzimática visando a amplificação seletiva in vitro de fragmentos específicos de DNA (ou RNA) de quantidades muito pequenas a partir de material complexo, gerando microgramas do DNA alvo. Produz quantidade de DNA suficiente para estudo Desenvolvido em 1983 (Saiki et al., 1985; Mullis et al., 1986; Mullis & Faloona, 1987) (Cetus corporation) Inventado por Kary Mullis – ganhou prêmio Nobel em química em 1993 !! Aplicado em pesquisa biológica em todas as classes de organismos Ferramenta de biologia molecular muito importante (mais de 40,000 publicações usando PCR (White, 1996)) 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Eletroforese 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto RAPD Random Amplification of Polymorphic DNA Amplificação de DNA polimórfico de forma randomica Não precisa de análise prévia Primers arbritários Mostram se as bactérias são iguais ou diferentes em relação ao genótipo A B 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto O presente trabalho descreve a emergência de cepas mucoides do complexo B. cepacia em um paciente com Fibrose Cística dentro de um acompanhamento bacteriológico prospectivo de nove anos. Os dados clínicos sugerem a associação entre o isolamento do morfotipo mucoide e a deterioração clínica do paciente. Apesar da variação fenotípica, os testes moleculares mostraram que o paciente manteve-se cronicamente infectado por cepas de mesma origem clonal (mesmo genótipo) 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Filogenia usando o gene do RNAr 16S Lineage: domain Bacteria (1) phylum Firmicutes (1) class "Clostridia" (1) order Clostridiales (1) family "Ruminococcaceae" (1) genus Ruminococcus (1) 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto Engenharia genética Plantas transgênicas 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto 01/10/2015 Microbiologia - Prof Cristine Barreto
Compartilhar