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UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ CAMPUS DE PARNAÍBA CURSO DE BIOMEDICINA Disciplina: BIOINFORMÁTICA Prof. Jefferson Soares de Oliveira Roteiro de atividades da Aula Pratica – Bancos de Dados – Parte 02 De posse do número de acesso NG_008937.1 que está relacionado a uma sequência de nucleotídeos do gene CD44 de humanos e utilizando o Banco de Dados do National Center for Biotecnology Information (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) realize as atividades descritas a seguir. 1- O código de acesso refere-se a uma sequência de DNA ou mRNA? 2- Qual a função desempenhada pelo produto do gene em questão? 3- Este gene é composto por quantos nucleotídeos? 4- Quantos éxons o gene identificado apresenta? Indique a posição de início e fim de cada um dos éxons nesta sequência de nucleotídeos. 5- Informe o número de acesso de um mRNA associado a este gene. 6- Informe, no formato FASTA, a sequência de mRNA associada a este gene. O que caracteriza uma sequência no formato FASTA? 7- Indique no mRNA selecionado a posição dos nucleotídeos relacionados aos prováveis sinais e pontos de adição da cauda poliA. 8- A partir da sequência do mRNA selecionada, informe qual o número de acesso da proteína relacionada e apresente sua sequência de aminoácidos no formato FASTA. 10 – Que informação encontramos nas guias: gene, mRNA, exon, CDs, regulatory (polyA_signal_sequence), PolyA_site?
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