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Farmácia Disciplina: Genética e Biologia Molecular Docente: Luciana Machado Guaberto (quatro aulas semanais) DNA??? RNA??? Biologia Molecular??? BIOTECNOLOGIA??? Genética Cromossomos???? Genes ???? Plano de Ensino da Disciplina EMENTA disciplina visa: • Ministrar aos acadêmicos, inicialmente, os principais conceitos da tecnologia do DNA recombinante fazendo uma revisão da estrutura, função e manipulação dos ácidos nucléicos. • Serão descritas as metodologias de Southern Blot, Northern Blot e Western Blot, PCR, RAPD, RFLP, eletroforese em géis de agarose e poliacrilamida, bem como as principais metodologias de extração de ácidos nucléicos, análise de citogenética , identificando as anomalias a nível cromossomal (cariotipagem). • A disciplina se propõe a discutir a crescente utilização da BIOMOL na profissão farmacêutica abordando temas como farmacogenômica, produção de imunobiológicos e clonagem gênica. • I-OBJETIVOS GERAL Fornecer aos acadêmicos conhecimentos básicos sobre tópicos de Genética e Biologia Molecular de interesse profissional sendo aplicada ao diagnóstico clínico e laboratorial e em situações do cotidiano. • II OBJETIVOS ESPECÍFICOS • Com a finalidade de preparar o acadêmico para exercer profissionalmente na pesquisa e desenvolvimento, seleção, produção e controle de qualidade de produtos obtidos por biotecnologia, a disciplina de Genética e Biologia Molecular apresenta os seguintes objetivos específicos: I) Desenvolver nos alunos a capacidade de interpretar processos biológicos em nível molecular; II) Proporcionar aos alunos o conhecimento a respeito de técnicas básicas de Biologia Molecular e da sua aplicabilidade; II) Capacitar os alunos para a análise e interpretação de resultados de experimentos que utilizam técnicas de Biologia Molecular; IV) Aplicar conceitos fundamentais da Genética Humana na resolução de problemas relacionados com: diagnóstico, padrões de herança, riscos de recorrência, aconselhamento genético; V) Capacitar os alunos para o conhecimento básico sobre Citogenética Humana, Genética Bioquímica, Farmacogenética, Farmacogenômica, Imunogenética, Agentes Mutagênicos e Evolução. VI) Reconhecer a importância de aspectos evolutivos no auxílio à compreensão de problemas em Saúde Pública. CONTEÚDO PROGRAMÁTICO • Conteúdo teórico: • 1.GENÉTICA E O ORGANISMO 1.1 Aberrações Cromossômicas numéricas e estruturais; 1.2 Cromossomos sexuais e determinação do sexo 1.3 Mutações, agentes mutagênicos, Teratogênese; 1.4 Citogénetica médica e clínica; 1.5 Genética do câncer 2. ESTRUTURA, FUNÇÃO E PROPRIEDADE DOS ACIDOS NUCLÉICOS 2.1 Os Ácidos Nucléicos; 2.2 DNA; 2.3 RNA; 2.4 Proteínas histonas 3. DOGMA CENTRAL DA BIOLOGIA MOLECULAR 3.1 Mecanismo de duplicação; 3.2 Mecanismo de transcrição 3.3 Mecanismo de tradução; 3.4 Mecanismo de reparo 4. REGULAÇÃO DA EXPRESSAO GÊNICA 4.1 Procariotos; 4.2 Controle da expressão gênica de procariotos; • 4.3 Operons 4.4 Eucariotos; 4.5 Aspectos básicos da regulação da expressão gênica em eucariotos 4.6 Cromossomos eucarióticos e expressão gênica CONTEÚDO PROGRAMÁTICO • 5. BIOLOGIA MOLECULAR: TECNOLOGIA DO DNA RECOMBINANTE 5.1 DNA recombinante (DNAr); 5.2 Investigação fundamental; 5.3 DNA complementar (DNAc); 5.4 Principio da Terapia gênica germinativa e somática. • 6. Técnicas de Biologia Molecular: Marcadores Moleculares. 6.1 Reação em cadeia da Polimerase; 6.2 Polimorfismo no comprimento de fragmentos de restrição – RFLP; 6.3 Eletroforese;6.4 Polimorfismo de DNA amplificado ao acaso – RAPD; 6.5 Marcadores Baseados na amplificação de microssatélites;6.6 Polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados – AFLP.; 6.7Sequeciamento; 6.8 PCR em tempo real. • 7. Biotecnologia 7.1. Importância e Aplicações da Biotecnologia.; 7.2 Obtenção de Organismos Geneticamente Modificados; 7.3 Animais e plantas transgênicas e suas aplicações na produção.; 7.4 Clonagem: fundamentos e aplicações; 7.7 Agentes mutagênicos como fonte de variabilidade genética em plantas e Duplicação do número de cromossomos.; 7.8. Engenharia Genética e suas aplicações. CONTEÚDO PROGRAMÁTICO Conteúdo prático: 1. Procedimento adequado para a coleta de material para análise citogenética. 2. Lançamento da cultura, retirado da cultura, preparo das laminas para analise do cariótipo. 3.Noções de Pipetagem. 4.Extração DNA (sangue periférico, vegetal e bactérias). 5.Preparo dos géis de agarose e poliacrilamida. 6.Eletroforese. 7.Visualização da Integridade do DNA em gel de agarose. 8.Quantificação do DNA. 9. Digestão do DNA com diferentes enzimas de restrição. 10. Preparo da Reação em cadeia da polimerase. 11.Digestão do produto da PCR com enzimas de restrição. 12.Estudo do polimorfismo com Marcadores Moleculares. 13.Extração do RNA para estudo da expressão gênica. 14.Obtenção do cDNA utilizando RT-PCR. 15. Estudo dirigido: Artigos científicos sobre: Técnicas laboratoriais aplicadas à biologia molecular. DATA ATIVIDADES 02/02 Introdução à disciplina/Plano de ensino. Apresentação do laboratório/Normas de Biossegurança. Técnicas de pipetagem. 09/02 • Feriado: Carnaval 16/02 Genética e o Organismo. Cariotipagem: Lançamento e retirada das culturas de linfócitos. Preparo coloração das lâminas. 23/02 Genética: agentes Mutagênico, Teratogênico. Análise das lâminas /Cariotipagem. 01/03 Apresentação de Artigos Científicos em forma de seminário. Cariótipos com anomalias / Citogenética médica, clinica e do Câncer. Análise Citogenética. Cariótipos normais. 08/03 Apresentação de Artigos Científicos em forma de seminário. Cariótipos com anomalias / Citogenética médica, clinica e do Câncer. Análise Citogenética. Cariótipos normais. 15/03 Os Ácidos Nucléicos DNA/ RNA/ Proteínas histonas. Extração DNA de sangue periférico pelo método de Iodeto. 22/03 Dogma Central da Biologia Molecular. Regulação da Expressão Gênica. Preparo dos géis de agarose e poliacrilamida. 29/03 Técnica de Eletroforese. Visualização da Integridade do DNA em gel de agarose. 05/04 Técnicas de Biologia Molecular aplicadas ao diagnóstico. Quantificação do DNA. 12/04 1a Avaliação Teórica-Prática. 19/04 Vista da prova. Revisão e discussão do conteúdo abordado na prova. Extração de DNA vegetal. 26/04 Introdução do uso de Marcadores Moleculares. Quantificação do DNA. 03/05 Digestão do Produto da PCR com enzimas de restrição para o estudo do polimorfismo do gene. Preparo da Reação em cadeia da polimerase. 10/05 Conceitos e princípios básicos da Engenharia Genética. Terapia gênica. Obtenção de Organismos Geneticamente Modificados. Clonagem. Visualização do produto da PCR. Interpretação dos resultados. 17/05 Legislação Profissional. Atividade: Métodos de extração de DNA. 24/05 Pesquisa Bibliográfica: Artigos científicos sobre: Técnicas laboratoriais aplicadas à biologia molecular. Importância da Biologia molecular na área farmacêutica. 31/05 Apresentação de Seminários. Parte I. Extração de RNA de tecido adiposo. 07/06 Apresentação de Seminários. Parte II. Análise da Qualidade e Integridade do RNA. RT-PCR. 14/06 2 a Avaliação Teórica Prática. 17/06 Vista da prova 2ª Chamada 21/06 Exame 28/06 Vista do Exame DATA ATIVIDADES -Turma B 13/02 Aula 1-Introdução à disciplina/Plano de ensino. Apresentação do laboratório/Normas de Biossegurança. Técnicas de pipetagem. 20/02 Aula 2-Genética e o Organismo. Cariotipagem: Lançamentoe retirada das culturas de linfócitos. Preparo coloração das lâminas. 27/02 Aula 3-Genética: agentes Mutagênico, Teratogênico. Análise das lâminas/Cariotipagem. 05/03 Aula 4- Apresentação de Artigos Científicos em forma de seminário. Citogenética médica e clinica/ Genética do Câncer. 12/03 Aula 5- Os Ácidos Nucléicos DNA/ RNA/ Proteínas histonas. Extração DNA de sangue periférico pelo método de Iodeto. 19/03 Aula 6- Dogma Central da Biologia Molecular. Regulação da Expressão. Preparo dos géis de agarose e poliacrilamida. 26/03 Feriado: Paixão de Cristo/Páscoa (Suspensão das Aulas) 02/04 1a Avaliação Teórica –Prática. 09/04 Aula 7- Vista da prova. Revisão e discussão do conteúdo abordado. Extração de DNA vegetal. 16/04 Aula 8-Técnica de Eletroforese. Visualização da Integridade do DNA em gel de agarose. Quantificação do DNA em espectrofotômetro. 23/04 Feriado: Tiradentes (Suspensão das Aulas) 30/04 Aula 9- Técnicas de Biologia Molecular aplicada no diagnostico. Introdução do uso de Marcadores Moleculares. Preparo da Reação em cadeia da polimerase. 07/05 Aula 10- Conceitos e princípios básicos da Engenharia Genética. Terapia gênica. Visualização do produto da PCR. Interpretação dos resultados. 14/05 Aula 11- Obtenção de Organismos Geneticamente Modificados. Digestão do Produto da PCR com enzimas de restrição para o estudo do polimorfismo do gene. 21/05 Aula 12- Legislação Profissional. Importância da Biologia molecular na área farmacêutica. Pesquisa Bibliográfica: Artigos científicos sobre: Técnicas laboratoriais aplicadas à biologia molecular. Atividade. Extração de RNA: estudo de expressão gênica. (RT-PCR) 28/05 Aula 13- Apresentação dos Seminários 04/06 2 a Avaliação Teórica Prática 11/06 Vista da prova 17/06 2ª Chamada 25/06 Exame • - Atividades Discentes - Seminários - Pesquisa em biblioteca - Trabalho em grupo - Assistir eventuais palestras sobre os assuntos abordados em sala - Realizar provas teóricas e práticas sobre os conteúdos ministrados - Metodologia de Ensino Aulas teóricas acompanhadas de recursos audio-visuais (slides, vídeos e projetores) Pesquisas bibliográficas Leitura de textos e artigos científicos Aulas Práticas Seminários - Forma de Avaliação Serão realizadas atividades práticas no laboratório semanalmente. O cálculo da média do 1º bimestre (M1) e do 2o bimestre (M2) será realizado da seguinte maneira: O cálculo da média do 1º bimestre (M1) será feito da seguinte maneira: M1 = Prova bimestral (valor 7,0) + Atividades* (valor 3,0). O cálculo da média do 2º bimestre (M2) será feito da seguinte maneira: M2 = Prova bimestral (valor 7,0) + Atividades* (valor 3,0). Bibliografia Básica • Básica: • Turner, P. C., Biologia molecular. • Editora(s) Guanabara Koogan • Eça, Lilian Piñero, • Biologia molecular : guia prático e didático. • Editora(s) Revinter • Malacinski, George M., • Fundamentos de biologia molecular. • Editora(s) Guanabara Koogan Bibliogarafia Complementar: • Turner, P. C., Biologia molecular. Editora(s) Guanabara Koogan • • Ulrich, Henning; Trujillo, Cleber Augusto, Bases moleculares da biotecnologia. Editora(s) Roca • Watson, James D., Biologia molecular do gene. Editora(s) Artmed • Alberts, Bruce; Vanz, Ana Letícia de Souza , Biologia molecular da celula. Editora(s) Artmed Watson, James D., Biologia molecular do gene. Editora(s) Artmed Cooper, Geoffrey M.; Hausman, Robert E., A célula : uma abordagem molecular. Editora(s) Artmed Farah, Solange Bento, DNA : segredo & mistérios. Editora(s) Sarvier Jorde, Lynn B.; Motta, Paulo Armando; Pontes, Luciane Faria de Souza; Gomes, Giselle Guimarães , Genética médica. Editora(s) Elsevier Ferreira, Márcio Elias; Grattapaglia, Dario, Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética. Editora(s) Embrapa É importante estudar o DNA? Por que? Avaliando o seu conhecimento 1. Os ácidos nucléicos 2. Gene 3. Dogma da genética molecular. 4. Proteína. 5. Enzima. 6. Cromossomo. 7. Código genético. 8. Fenótipo 9. Biotecnologia A utilização do DNA Biotecnologia Teste de paternidade Passos para inclusão e exclusão de paternidade pelo DNA: 1) Compare as bandas da mãe (M), criança (C) e possíveis pais (P). 2) Identifique quais bandas da criança vieram da mãe. As bandas restantes (bandas- teste) vieram do pai. 3) As bandas-teste estão presentes no possível pai? Identifique-o. Biotecnologia Alimentos transgênicos São alimentos cujas sementes tiveram seu material genético modificado em laboratório. Essas sementes são modificadas para que as plantas possam resistir às pragas de insetos e à grandes quantidades de pesticida. Biotecnologia Clonagem da ovelha Dolly •Tipo e conformação MELHORAMENTO GENÉTICO DE BOVINOS Características a serem selecionadas Biotecnologia Terapia gênica • Selecionam-se vetores potencialmente nocivos “in vivo”. • Modifica-se o DNA do vetor introduzindo o gene defeituoso no ser humano (2). • Retira-se, do ser humano, uma colônia de células para que os vírus possam se multiplicar e passar para gene normal (1). • Separam-se as células portadoras do gene normal e injetam-nas no ser humano (3 e 4). Genética Forense • Resolução de casos criminais envolvendo: • Estupro; • Homicídio; • Rapto; • Troca ou abandono de crianças. Quem é a vítima? Quem é o pai dessa criança? A quem pertence a mancha de sangue deixada em um local de crime? Quem deixou os espermatozóides no corpo da vítima? Aborto em Turner Ginecomastia (xxy) Aborto em Patau Ginecomastia (xxy) Turner (X0) Diagnóstico de doenças e síndromes Farmacogenômica & Farmacogenética E no futuro... • Bancos completos de perfil de criminosos OBS: – Inglaterra – CODIS – Combined DNA Index System (1994) • Amostra de DNA “retrato falado” De onde pode ser extraído o DNA? • Sangue padrão-ouro; • células epiteliais da mucosa oral: saliva, pontas de cigarro, selos e envelopes, gomas de mascar, copos, tampas de caneta mordidas,...; • Pelos e fios de cabelo ( bulbo capilar); • Unhas; • Esfregaços; De onde pode ser extraído o DNA? • Manchas de material biológico: líquido seminal, urina, saliva, sangue; • Tecidos de biópsias cirúrgicas; • Ossadas (carbonizadas ou não); • Tecidos mumificados ou congelados; • Células deixadas por impressão digital; • Dentes; • outras Como é feito o diagnostico com técnicas Moleculares? 2. Extração do DNA 3. Amplificação do DNA 1. Coleta do sangue 3. Digestão do DNA 4. Eletroforese Instruções Gerais Para Laboratório Avental de manga longa Calçado fechado Calça comprida Cabelos permanentes presos na sua totalidade. Luvas de procedimentos Materiais utilizados Micropipetadores são dosadores de medida volumétrica. Ponteiras são complemento do micropipetador para aspirar material. Micro tubos, recipiente de plástico para armazenar os materiais, e realizar reações. Provetas são frascos de medida graduada. Erlenmayer são frascos de forma cônica, com gargalho para facilitar a agitação de substâncias. Usado para aquecimentos de líquidos, dissolver substâncias e realizar reações. Equipamentos Balança Analítica Agitadores magnéticos Capela Banho seco MicroondasCubas de Eletroforese Fonte de Eletroforese Microcentrifuga Maquina de gelo Thermociclador Analisador de imagem( Computador conectado com câmera CCD). Centrifuga Refrigerada Diluições Preparo dos reagentes vamos usar concentrações em: Molaridade Partes (ppM) Porcentagem Obs: Não mexer nos materiais antes da autorização da professora. Técnicas de Pipetagem Por: Luciana M Guaberto, MSc X X X X X X X X X Pipetmans: Pipetadores automáticos Cobrem uma faixa de 0.1 μl até 10 ml, adequadas a várias aplicações: a) P2 e P10: medida e transferência de microvolumes, sequenciamento de DNA e ensaios enzimáticos; b) P20, P100, P200 e P1000: medida e transferência de soluções aquosas em geral, ácidos e bases. c) P5000 e P10 ml: medida e transferência de grandes volumes. A)Botão com código de cores B)Corpo da pipeta ou handle C)Porca de conexão D)Ponteira Diamond E)Ejetor de ponteiras F) Botão de ejeção G)Porta cone H)Tambor de ajuste volumétrico V) Volúmetro Prevenção é a melhor solução A má conservação e o uso inadequado prejudicam o desempenho e a vida útil da pipeta. Com cuidados adequados, as pipetas, garantem exatidão e precisão durante muitos e muitos anos. ATENÇÃO! Enquanto aspirar o líquido , mantenha a ponteira a uma profundidade constante abaixo da superfície do líquido; Cada nova ponteira deve ser pré-rinsada com o líquido a ser aspirado, antes do início da pipetagem; O líquido nunca deve entrar no porta-cone. Para reduzir tal risco, deve-se: • Pressionar e soltar o botão de modo lento e constante; • Nunca virar a pipeta de “cabeça para baixo”; • Nunca deitar a pipeta enquanto houver líquido na ponteira; • Sempre utilizar filtros nas pipetas P5000 e P10ml. Nunca pipete líquidos que estejam com temperatura acima de 70°C ou abaixo de 4°C A pipeta pode ser utilizada em temperaturas entre +4C e +40C Ponteiras com filtro Devem ser utilizadas quando o risco de contaminação amostra/ amostra, pipeta/amostra ou pipeta/operador precisa ser evitado. Solventes voláteis Deve-se saturar a atmosfera de ar presente no interior da pipeta, e desta forma, evitar vazamentos. Para isto, basta aspirar e dispensar algumas vezes o solvente antes de aspirar a alíquota da amostra. Cada micropipetador tem sua respectiva ponteira, sendo identificadas por cor : Para P02 ,P10 ponteira branca Para P20 , P100 , P200 ponteira amarela Para P1000 ponteira azul Para P 5000 ponteira branca Pipeta monocanal de alta precisão, marca Gilson, modelo Pipetman P2, com intervalo de uso de 0,1 a 2 µL e incrementos de escala de 0,001 µL. Ejetor metálico de ponteiras destacável do corpo da pipeta e adaptador dois estágios para ejeção de ponteiras de colar curto ou longo. Precisão de ≤ 0,012µL e 0,70 % e exatidão de ± 0,024µL e 1,5 %. Pipeta monocanal de alta precisão, marca Gilson, modelo Pipetman P10, com intervalo de uso de 1 a 10µL e incrementos de escala de 0,01 µL. Ejetor metálico de ponteiras destacável do corpo da pipeta e adaptador dois estágios para ejeção de ponteiras de colar curto ou longo. Precisão menor ou igual a 0,012µL e 0,40 % e exatidão de ± 0,025µL e 1,0 %. Pipeta monocanal de alta precisão, modelo Pipetman P20, com intervalo de uso de 2 a 20 µL e incrementos de escala de 0,01 µL. Ejetor metálico de ponteiras destacável do corpo da pipeta. Precisão menor ou igual a 0,03µL e 0,30 % e exatidão de ± 0,10µL e ± 1,0 %. Pipeta monocanal de alta precisão, marca Gilson, modelo Pipetman P100, com intervalo de uso de 10 a 100 µL e incrementos de escala de 0,1 µL. Ejetor metálico de ponteiras destacável do corpo da pipeta. Precisão menor ou igual a ≤ 0,10µL e 0,15 % e exatidão de ± 0,35µL e ± 0,8 %. Pipeta monocanal de alta precisão, marca Gilson, modelo Pipetman P200, com intervalo de uso de 20 a 200 µL e incrementos de escala de 0,1 µL. Ejetor metálico de ponteiras destacável do corpo da pipeta. Precisão menor ou igual a 0,20µL e 0,15 % e exatidão de ± 0,50µL ou ± 0,8 %. Pipeta monocanal de alta precisão, marca Gilson, modelo Pipetman P1000, com intervalo de uso de 100 a 1000 µL e incrementos de escala de 1,0 µL. Ejetor metálico de ponteiras destacável do corpo da pipeta. Precisão menor ou igual a 0,6µL e 0,15% e exatidão de ± 3µL e ± 0,8%. Pipeta monocanal de precisão, marca Gilson, modelo Pipetman P5000, com intervalo de uso de 1 a 5 mL e incrementos de escala de 1 µL. Precisão menor ou igual a 3µL e 0,16% e exatidão de ± 12µL e ± 0,6%. Pipeta monocanal de precisão, marca Gilson, modelo Pipetman P10mL, com intervalo de uso de 1 a 10 mL e incrementos de escala de 10µL. Precisão menor ou igual a 6µL e 0,16% e exatidão de ± 30µL e ± 0,6%. OBRIGADA! guaberto@unoeste.br Sejam Bem vindos a Disciplina Genética e Biologia Molecular 1 semestre de 2016
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