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SERVIÇO PÚBLICO FEDERAL UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ CURSO: NUTRIÇÃO Prof. Me. João Marcelo Castro Genética e Biologia molecular j.marcelo@ufpi.edu.br Transcrição e Processamento do rna O Dogma Central Desde meados da década de 50 já se pensava na hipótese do DNA constituir-se num molde para a síntese de moléculas de RNA Os RNAs, por sua vez, devido a sua mobilidade e flexibilidade acoplar-se-iam aos ribossomos e dirigiriam a síntese de proteínas Baseado neste raciocínio, Francis Crick propôs em 1956 o dogma central da biologia, salientando o fluxo unidirecional da informação: do DNA à proteína Transcrição: Síntese de uma molécula de RNA a partir da fita molde de DNA. Novos conhecimentos permitiram que o dogma central se ampliasse sem, contudo, perder a unidirecionalidade, ou seja, de ácido nucléico para proteína Transcrição: Antecedentes Históricos Ao se desvendar a estrutura da molécula de DNA o princípio da replicação pôde ser visualizado sem dificuldades. No entanto, a forma com que as proteínas eram geradas a partir desta molécula informacional ainda constituía um mistério. Em 1954, o astrofísico George Gamow, tomando conhecimento dos trabalhos de Watson & Crick, sobre estrutura e replicação do DNA, propôs que os quatro tipos de bases seqüencialmente dispostos na molécula de DNA constituiriam as letras de um código. – Este código comandaria a seqüência dos aminoácidos nas proteínas. A questão inicial era descobrir como o sistema de 4 bases estava organizado para sinalizar aos 20 tipos de aminoácidos que participam das proteínas De 1954 a 1966, intensas discussões e experimentações foram realizadas por todos aqueles que se interessavam pelo assunto. – Particularmente Crick, que já postulava a existência de uma molécula intermediária para estabelecer a complementaridade necessária entre as bases dos ácidos nucléicos e os aminoácidos das proteínas. Finalmente, os trabalhos realizados por Nirenberg & Leder (1964) e por Khorana e colaboradores (1966), desvendaram por completo o código genético. – Cada aminoácido correspondia a um ou mais códons (cada uma das possíveis combinações das quatro bases, três a três). RNA e Síntese de Proteínas Apesar de já estar claramente demonstrado que o material genético era o DNA. – Inicialmente não havia conhecimento sobre qualquer conexão entre o processo de síntese protéica que ocorre no citoplasma e a molécula de DNA presente no núcleo. Paulatinamente sedimentava-se a idéia de que o molde para a síntese de proteínas era RNA e não DNA, baseado em evidências tais como: – Existência de um tipo de RNA que transportava aminoácidos (tRNA). – Ocorrência de síntese protéica nos ribossomos localizados no citoplasma da célula eucariótica, portanto, separado do DNA, que se encontra no núcleo. mRNA, Genes e Ribossomos Em trabalho publicado em 1961, Brenner et al. assumiu, definitivamente, que uma espécie instável de RNA, era responsável por carregar a mensagem contida na molécula de DNA até os ribossomos. – Denominada RNA mensageiro (mRNA) Finalmente estabelecia-se uma conexão entre genes e proteínas. – Via uma molécula instável de RNA, cuja síntese e degradação podia ser perfeitamente regulada pela célula em resposta a suas necessidades. Transcrição Complementaridade e antiparalelismo ( T = U) Síntese 5' 3' RNA Polimerase (RNAP) Transcrição 5´ 3´ “bolha de transcrição” Transcrição do DNA A síntese dos diferentes tipos de RNA, a partir de um molde de DNA, usando as regras da complementaridade, é um processo denominado Transcrição do DNA. – A informação genética contida num segmento do DNA, é reescrita em uma fita simples de RNA. – Esta fita apresenta uma seqüência de ribonucleotídios complementar a uma das fitas da dupla hélice de DNA (fita molde) e idêntica à seqüência da outra fita (fita codificadora), com substituição de T por U. Transcrição RNA´s Polimerases: - Reconhecem e ligam-se - Desnaturam DNA - Mantém estável a dupla fita aberta - Mantém estável DNA:RNA - Terminam síntese - Restauram o DNA Etapas da transcrição: - Iniciação - Alongamento - Término A Unidade de Transcrição A síntese de qualquer dos tipos de molécula de RNA é catalisada pela enzima RNA polimerase. RNA polimerase de E. coli As RNA polimerases não tem mecanismo de correção de erro (taxa de erro 10-5). A Unidade de Transcrição A transcrição de um segmento se inicia quando a RNA polimerase reconhece e liga-se a seqüências específicas de nucleotídeos em uma região especial, no início do gene, denominada promotor. Além destas seqüências, o promotor engloba o ponto de início. – Primeiro par de bases a ser transcrito em RNA. A partir daí a RNA polimerase move-se ao longo do molde, sintetizando RNA, até alcançar uma outra seqüência específica que sinaliza o término da transcrição. Assim, a unidade de transcrição estende-se do ponto de início (+1) no promotor, até o terminador (região de término). A Unidade de Transcrição Diz-se que as seqüências que antecedem o ponto de início localizam-se à montante (upstream) e as que o sucedem localizam-se à jusante (downstream). A posição das bases é numerada nos dois sentidos, a partir do ponto de início, ao qual se atribui o valor +1. Os valores aumentam (valor positivo) à jusante e diminuem (valor negativo) à montante. Etapa de Iniciação: reconhecimento do TATA Box O que é o TATA box? RNA Polimerase da E. Coli • Massa molecular cerca de 500.000Da; • 4 diferentes tipos de subunidades: (Alfa), (Beta), ’ (Beta linha) e (Sigma); • o núcleo da enzima é 2’; • a holoenzima é 2’; • a importância da subunidade é o reconhecimento do promotor local, local, a subunidade é liberada depois do início da transcrição; • das 2 cadeias do DNA, uma delas que serve como o modelo da síntese do RNA é chamado de cadeia modelo ou antisentido, o outro é chamado de cadeia de codificação ou de sentido; • a holoenzima liga-se e transcreve somente a cadeia modelo ou molde. Etapa de Alongamento Etapa de Término Tipos de RNA polimerase Procarioto: apenas uma RNA polimerase. Eucarioto: Pelo menos três RNA polimerases. RNAr: estrutura dos ribossomos – tradução. RNAm: molécula informacional (leitura da proteína) (códon). RNAt: tradução (anticódon). RNA nucleares pequenos: splicing (retirada dos introns). Transcrição em Eucariotos RNA polymerase I: rRNA (28S, 18S, 5.8S); RNA polymerase II: RNA de genes de proteínas, snRNA; RNA polymerase III: tRNA, 5S RNA, U6 snRNA. RNA Polimerase II associada ao DNA Transcrição RNA - Polimerases: Eucariotos - Proteínas acessórias = fatores de transcrição - Sítio de início da transcrição - Seqüências regulatórias (promotor e enhancer) * Cada RNAPol utiliza promotores e fatores transcricionais diferentes. Transcrição Iniciação – ligação do complexo RNAPol II ao DNA Alongamento – adição de nt ao mRNA crescente Terminação – liberação de mRNA e RNAP II Transcrição pela RNA polimerase II Elementos Regulatórios da Transcrição: Promotores Elementos Regulatórios Eucarióticos Iniciação da transcrição dos RNAs da classe II (mRNA). Montagem do Complexo de Transcrição no Promotor Mínimo TFII D TFII A apói a TFII D TFII B marca posição TFIIF & RNA Pol II TFII H fosforila Pol II TFII E helicas e Transcrição • Características gerais da síntese do RNA: 1. Sintetizado de um modelo de DNA, catalisada por RNA polimerase dependente doDNA; 2. ATP, GTP, CTP e UTP são requeridos, como Mg2+ 3. Primer de RNA não é requerido; 4. A cadeia do RNA é sintetizada na direção 5’3’, o nucleotídeo no término 5’ da cadeia retém seu grupo trifosfato (ppp), 5. A seqüência de base do DNA contém sinais de início e término da síntese do RNA, a enzima liga e move-se ao longo do modelo de DNA na direção 3’ 5’; 6. O modelo do DNA não é alterado. Alongamento do RNA • Alongamento ocorre dentro da bolha de transcrição: • À medida que a RNA pol II se move ao longo do DNA, desenrola o DNA a sua frente e reenrola o DNA que já foi transcrito mantém uma região unifilamentar de DNA bolha de transcrição; • Bolha de transcrição: Ø Filamento-molde exposto; Ø Polimerase monitora a ligação de um ribonucleotídeo livre a base exposta seguinte no molde de DNA complementariedade adiciona a cadeia crescente; Ø Dentro da bolha últimos 8 ou 9 nucleotídeos adicionados à cadeia de RNA formam um híbrido DNA-RNA complementariedade; Ø À medida que a cadeia de RNA aumenta em sua ponta 3’, a ponta 5’ unifilamentar é liberada da polimerase. Alongamento do RNA • A TFIIF permanece ligada a RNA pol II durante todo o alongamento; • Acompanhado pela liberação de muitos TF potenciado por proteínas chamadas fatores de alongamento. Alongamento do RNA Término pela RNA polimerase II PROCESSAMENTO DO PRÉ-MRNA ADICÃO DE UMA CAP 5´ ADIÇÃO DA CAUDA POLI (A) REMOÇÃO DOS ÍNTRONS ADICÃO DE UMA CAP 5´ ADIÇÃO DA CAUDA POLI (A) REMOÇÃO DOS ÍNTRONS Slide 1 O Dogma Central Slide 3 Slide 4 Transcrição: Antecedentes Históricos Slide 6 RNA e Síntese de Proteínas mRNA, Genes e Ribossomos Transcrição Transcrição Transcrição do DNA Slide 12 Slide 13 Transcrição Slide 15 A Unidade de Transcrição A Unidade de Transcrição A Unidade de Transcrição Slide 19 Slide 20 Slide 21 Slide 22 Slide 23 Slide 24 Slide 25 Slide 26 Slide 27 Slide 28 Slide 29 Slide 30 Slide 31 Transcrição Transcrição Slide 34 Slide 35 Slide 36 Slide 37 Slide 38 Montagem do Complexo de Transcrição no Promotor Mínimo Slide 40 Alongamento do RNA Alongamento do RNA Alongamento do RNA Término pela RNA polimerase II PROCESSAMENTO DO PRÉ-MRNA Slide 46 Slide 47 Slide 48
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