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Página 1 437 Fenner e White's Medical Virology. DOI: © 2012 Elsevier Inc. Todos os direitos reservados. http://dx.doi.org/10.1016/B978-0-12-375156-0.00031-X 2017 A família Coronaviridae abrange um amplo espectro vírus animais e humanos, todos caracterizados por morfologia distinta. Virions são envelopados e esféricos (coronavírus) ou em forma de disco, rim ou bastonete (torovírus). Cada partícula é cercada por uma franja ou "corona" representando as extremidades distais bulbosas do envelope incorporado glicoproteínas. Antes de 2003, membros dessa família eram acredita-se que cause apenas doenças respiratórias leves em humanos, outros coronavírus então conhecidos como sendo de grande importância apenas para a indústria pecuária. Mas o surgimento de graves vírus respiratório agudo (SARS-CoV) naquele ano estimulou pesquisas importantes sobre esses vírus, no sentido de que muitos novos coronavírus já foram descobertos, alguns com potencial zoonótico de causar surtos graves de doenças em humanos. O surgimento mais recente do MERS-CoV é exemplar. Os coronavírus também são conhecidos por terem o maior genoma do RNA de sentido positivo: os genes do coronavírus são principalmente expresso por um procedimento complexo pelo qual o RNAm aninhado transcrições, cuja regulamentação governa a progressão do ciclo de replicação. PROPRIEDADES DOS CORONAVIRUS Classificação A família Coronaviridae é uma das três famílias de vírus RNA dentro da ordem Nidovirales , sendo o outro o Arteriviridae e os Roniviridae contendo patógenos de pássaros e insetos, respectivamente. A família consiste em duas subfamílias, Coronavirinae e Torovirinae , os últimos contendo vírus causando principalmente infecções entéricas de cavalos, gado, porcos, gatos, e cabras. Embora de importância econômica, os membros da a subfamília Torovirinae ainda não é conhecida por causar infecção humana e, portanto, não são mais tratados. Todos coronavírus compartilham uma morfologia comum e possuem uma genoma de RNA de fita simples de até 30 kb de comprimento. Os membros da subfamília Coronavirinae são subdividida em quatro gêneros. O gênero Alphacoronavirus contém o vírus humano HCoV-229E, outro humano coronavírus (HCoV-NL63) e muitos vírus animais. O gênero Betacoronavirus inclui o protótipo vírus da hepatite do rato (MHV), os três vírus humanos HCoV-OC43, SARS-HCoV e HCoV-HKU1 e o Coronavírus relacionado à SARS, doenças respiratórias do Oriente Médio coronavírus da síndrome de MERS), juntamente com vários de coronavírus animais. O gênero Gammacoronavírus contém vírus de cetáceos (baleias) e aves, e os O gênero Deltacoronavirus contém vírus isolados de porcos e pássaros. Desde 2005, dezenas de novos coronavírus foram isolado de morcegos, e há evidências de que humanos coronavírus respiratórios, coronavírus SARS e MERS coronavírus, cada um pode ter surgido originalmente de vírus morcegos ancestrais ( Tabela 31.1, Fig. 31.1 ). Estrutura e Genoma Os virions de coronavírus contêm três principais estruturas proteínas: a glicoproteína S muito grande (200 K) (para espiga) que forma os peplômeros volumosos (15 a 20 nm) encontrados no envelope viral, uma glicoproteína transmembranar incomum (M) e a proteína nucleocapsídica fosforilada interna (N). Dentro Além disso, existe uma menor proteína transmembranar E, e algumas Capítulo 31 Coronavírus TABELA 31.1 Propriedades dos coronavírus ● Virion é esférico pleomórfico de 80 a 220 nm (coronavírus); ou disco, rim ou bastonete em forma de 120 a 140 nm (torovírus) ● Envelope com peplomers grandes e espaçados em forma de clube ● Nucleocápside tubular com simetria helicoidal ● Genoma de ssRNA linear mais sensível, de 27 a 33 kb, limitado, poliadenilado, infeccioso; sequências não traduzidas em cada extremidade ● Três ou quatro proteínas estruturais: nucleoproteína (N), glicoproteína peplomérica (S), glicoproteína transmembranar (M), às vezes hemaglutinina-esterase (HE) ● O genoma codifica de 3 a 10 outras proteínas não estruturais, incluindo a RNA polimerase dependente de RNA composta de subunidades clivadas de duas poliproteínas traduzidas da 5′-end ● Replica no citoplasma; genoma é transcrito para RNA de sentido negativo de comprimento, a partir do qual é transcrita 3′-coterminaI conjunto aninhado de mRNAs, apenas o único 5 ′ sequências traduzidas ● Os virions são montados e brotam no endoplasmático retículo e cisternas de Golgi; liberação é por exocitose ● Os vírus variantes surgem prontamente, por mutação e recombinação e o uso de diferentes receptores influencia a gama de hospedeiros exibiu Página 2 438 PARTE | II Doenças específicas por vírus em humanos coronavírus contêm uma proteína adicional do envelope com ambos funções de hemaglutinação e esterase (HE) (Fig. 31.2 ). O genoma de RNA de fita simples de sentido positivo de 30 kb é o maior genoma viral de RNA conhecido. Está limitado na extremidade 5 ' e poliadenilado no terminal 3 'e é infeccioso. Vencimento Em seu tamanho, a expressão de genes individuais ocorre através de um processo complexo pelo qual conjuntos de mRNAs aninhados são produzidos, todos compartilhando a mesma sequência de 5 ′. Extenso rearranjos podem ocorrer como resultado de RNA heterólogo recombinação. No extremo 5 'do genoma, há uma tradução não traduzida (UTR) de 65 a 98 nucleotídeos, denominada líder RNA, que também está presente nas extremidades 5 'de todas as subgenômicas mRNAs. Na extremidade 3 'do genoma do RNA está outro sequência não traduzida de 200 a 500 nucleotídeos, seguida de uma cauda poli (A). Ambas as regiões não traduzidas são importantes para regulando a replicação e transcrição do RNA. FIGURA 31.1 Filogenia dos coronavírus. Árvore filogenética de 50 coronavírus construída pelo método de união de vizinhos usando MEGA 5.0 usando sequências nucleotídicas parciais da polimerase de RNA dependente de RNA. A barra de escala indica o número estimado de substituições por 20 nucleotídeos. Espaço não permite fornecer nomes completos de vírus, exceto os vírus humanos, que estão espalhados entre os vírus isolados de muitas outras espécies (principais patógenos mostrados em vermelho): HCoV-229E, coronavírus humano 229E; HCoV-HKU1, coronavírus humano HKU1; HCoV-NL63, coronavírus humano NL63; HCoV-OC43, coronavírus humano OC43; Isolado KSA-CAMEL-363, KSA-CAMEL-363 de coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio; MERS-CoV, Coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio; MHV, vírus da hepatite murina, o vírus prototípico da família; SARS-CoV, coronavírus SARS; SARSr- Coronavírus da civeta da palma relacionado à CiCoV, SARS. Um número notável dos vírus representados aqui são de morcegos, muitas espécies diferentes de morcegos e bastante alguns deles estão intimamente relacionados ao SARS-CoV. Modificado de Chan, JF, Lau, SK, Para, KK, Cheng, VC, Woo, PC, Yuen, KY, 2015. Médio Coronavírus da síndrome respiratória do leste: outro betacoronavírus zoonótico que causa doença semelhante à SARS. Clin. Microbiol. Rev. 28, 465-522, com permissão. Page 3 Capítulo dos coronavírus | 31 439 O genoma do coronavírus contém 7 a 14 leituras abertas quadros (ORFs). A partir do extremo 5 ', o gene 1, que compreende dois terços do genoma, é de cerca de 20 a 22 kb em comprimento. Consiste em duas ORFs sobrepostas (1a e 1b), funcionando coletivamente como a RNA polimerase viral (Pol). A ordem dos outros quatro genes de proteínas estruturais é 5'- S (espiga) –E (envelope) –M (membrana) –N (nucleocápside) -3 ′. Esses genes são intercalados com várias ORFs que codificam proteínas não-estruturais e glicoproteína HE, quando presente. Cada gene difere acentuadamente entre os coronavírus FIGURA 31.2 Morfologia e estrutura do coronavírus. (A) Microscopia eletrônica de contraste negativo do coronavírus SARS (SARS-CoV), mostrando a grandes projeções de superfície em forma de pétala (espigões, peplomers). (B) Microscopia eletrônica de seção fina de SARS-CoV em cultura celular, mostrando aderência típica de virions para a membrana plasmática de uma célula - os virions aderemàs células infectadas e não infectadas. (C) Microscopia eletrônica de seção delgada do Oriente Médio vírus da síndrome respiratória (MERS-CoV) em cultura celular, mostrando montagem típica de virion no lúmen do sistema de membrana de Golgi. (D) Modelo da estrutura do virion do coronavírus, mostrando o superenrolamento do nucleocápside viral sob o envelope. (B) De Sandra Crameri, CSIRO, Geelong, Austrália. (C) Da Public Health Image Library, CDC. (D) Reproduzido de Stadler, K., et al., 2003. SARS - começando a entender um novo vírus. Nat. Rev. Microbiol. 1, 209-218. Tudo com permissão. Page 4 440 PARTE | II Doenças específicas por vírus em humanos em número, sequência nucleotídica, ordem dos genes e método de expressão, embora estes sejam conservados dentro da mesma serogrupo. O genoma SARS-CoV codifica vários ORFs localizadas na região 3 'do genoma não presente em outros coronavírus. Prevê-se que essas ORFs expressem oito novas proteínas denominadas proteínas acessórias. Anticorpos reativos contra todas as proteínas SARS-CoV foram detectados em soros isolados de pacientes com SARS, indicando que essas proteínas são expressas pelo vírus in vivo ( Fig. 31.3 ). As ORF 1a e 1b são primeiro traduzidas em duas poliproteínas, ambos idênticos no terminal N, mas um dos quais tem um Extensão do terminal C devido à mudança de quadro. Esses são precursores de proteínas na transcrição-replicação complexo. Todos os coronavírus codificam uma quimiotripsina- como protease, denominada M pro (protease principal) ou 3CL pro pois compartilha algumas semelhanças com as proteases 3C de picornavírus. Esta protease é responsável pelo processamento o restante da poliproteína, produzindo até 16 proteínas não estruturais. O SARS-CoV contém o maior número dessas proteínas não estruturais. Por exemplo, O nsp3 é uma proteína multifuncional com protease e ADP- atividade da ribose 1 ″ fosfatase. Duas proteínas (nsp 7 e nsp 8) formar uma estrutura semelhante a um cilindro que possa ser importante na síntese de RNA de coronavírus e um RNA- de fita simples proteína de ligação (nsp 9). ORF1b codifica o RNA viral polimerase de RNA dependente e uma helicase multifuncional proteína. Além da atividade da helicase, esta proteína possui Atividades de NTPase e dNTPase, bem como trifosfatase de 5 ′ atividade. Esses produtos gênicos de proteínas não estruturais não são essencial para a replicação do vírus, mas a exclusão de um ou mais freqüentemente causa atenuação viral. Pelo menos um, o produto de ORF3a, agora é reconhecido como uma proteína estrutural. o O produto ORF3a é um produto de membrana tripla O-glicosilada proteína de extensão capaz de se ligar às proteínas N, M e S, sugerindo um papel na biogênese viral. Replicação Viral A metade N-terminal da proteína S contém o receptor domínio de ligação, e a metade do terminal C é de membrana ancorado e possui atividade fusogênica. A especificidade de A ligação é importante para o espectro hospedeiro de indivíduos coronavírus. Logo após o vírus ter sido isolado, o RNA 1b 2a 2b 3 3 4 5 6 7 8 910 11 12 13 14 1516 1 2 45 6 71a A PLPL M pro Pr EMSELECU TMExoN7HelZRpRd Eu 5 ' 5 ' A (n) 3'OH 2 A (n) 3'OH 2-1 A (n) 3'OH 3 A (n) 3'OH 4 A (n) 3'OH 5 A (n) 3'OH 6 A (n) 3'OH 7 A (n) 3'OH 1 A (n) 3'OH Vírus da hepatite de camundongo, MHV (31.526 nts) FIGURA 31.3 Organização e expressão do genoma do coronavírus. (Painel superior) Organização do genoma do vírus da hepatite em camundongos. ORFs são representados por caixas, com um número acima e a sigla de proteína abaixo. A seta diagonal entre ORF 1a e 1b representa o local do desvio de quadro ribossômico. As setas vermelhas indicam os locais das seqüências reguladoras da transcrição (TRSs). (Painel inferior) Mapa dos mRNAs virais, que se sobrepõem e coterminal na extremidade 3 '. Os diferentes mRNAs sub-genômicos são numerados por convenção de grande a pequeno, começando com o genoma como RNA1. As duas enormes poliproteínas de replicase (1a e 1ab) são clivadas por proteases codificadas por vírus, como mostrado por ORFs coloridas e setas coloridas; verde, tipo papaína protease 1 (PL1 pro ); protease vermelha tipo papaína 2 (PL2 pro ); azul, principal protease do tipo 3C (M pro ). Reproduzido de King, AMQ, et al., 2012. Taxonomia de vírus. In: Nono Relatório do Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus, Academic Press, Londres, p. 808, com permissão. Page 5 Capítulo dos coronavírus | 31 441 O receptor de SARS-CoV foi identificado como angiotensina- enzima de conversão 2 (ACE2), uma proteína celular expressa na superfície das células dos pulmões, coração, rim e pequenas intestino, bem como outros tecidos. Outras proteínas, como CD209L (L-SIGN), DC-SIGN e LSECtin, podem suportar a entrada de SARS-CoV nas células, mas não podem por si só conferem suscetibilidade a uma célula sem ACE2. Receptores de outros coronavírus também foram identificados. Por exemplo, o receptor do vírus da hepatite murina (MHV) é um vírus murino glicoproteína biliar pertencente ao carcinoembrionário família de antígeno (CEA) na superfamília Ig (CEACAM1). Cepas individuais de MHV podem exibir preferências diferentes para entrada viral. Por exemplo, apenas a cepa MHV-3 infecta Células T e B, com subsequente linfopenia. Apesar a maioria das cepas de coronavírus exibe rigorosa especificidade de espécie, como outros vírus de RNA, os coronavírus podem sofrer mutações sob pressão seletiva durante a passagem in vitro ou in vivo em resposta às condições ambientais, e uma proteína S com alcance de host estendido é, portanto, selecionado. Essas variantes pode usar eficientemente o CEA humano como receptores para infecção de células humanas. Esse mecanismo pode explicar a desenvolvimento de infecção entre espécies, exemplificado no surto da epidemia de SARS. Após a ligação ao receptor celular, a proteína S viral atua como uma proteína de fusão classe I, submetida a alterações que levam à fusão entre o envelope viral com o plasma ou as membranas endossômicas. SARS-CoV requer um pH ácido para a entrada, mas não para a glicoproteína S fusão célula a célula mediada. Posteriormente, o vírus nucleocapsídeo é liberado no citoplasma e o RNA é sem revestimento antes da transcrição. Durante o primeiro estágio da replicação do vírus, o positivo RNA viral da fita serve como mRNA para a tradução dos dois grandes quadros de leitura abertos (ORF 1a e 1b), cada um codificando unidades da RNA polimerase dependente de RNA. Depois de clivagem, essas proteínas se reúnem para formar o RNA ativo polimerase que transcreve complementar completo RNA (sentido negativo). Isso, por sua vez, é transcrito não apenas em RNA genômico completo, mas também um conjunto aninhado de MRNAs subgenômicos de sobreposição 3′-coterminais descritos acima. Cada espécie de RNAm viral varia em comprimento, mas compartilha uma extremidade 3 'comum e uma líder 5' de nucleotídeo de 70 seqüência. Somente a sequência exclusiva não compartilhada com o próximo menor RNAm do conjunto aninhado é convertido para produzir proteína viral. Devido ao grande tamanho do genoma, recombinação genética ocorre em alta frequência entre os genomas de coronavírus diferentes, mas relacionados. este mecanismo pode ser importante para a geração do gene diversidade de coronavírus na natureza. Durante a maturação e montagem, a proteína S é cotranslacionalmente inserido no endoplasmático rugoso retículo (RER) e glicosilado com glicanos ligados a N. A glicosilação é essencial para o correto dobramento e transporte da proteína S. A proteína S forma trímeros antes de ser exportado para fora do retículo endoplasmático (ER), e depois interage com as proteínas M e E para migrar para o site da montagem do vírus. Nas células infectadas, a proteína M é localizado principalmente no compartimento de criação de vírus, enquanto numa fase posterior da replicação viral, a proteína N é transportada para o site da montagem do vírus. SARS-CoV expressa outra proteína estrutural 3a, que não está apenas associada a intracelular e plasmática, mas também ésecretada e induz apoptose. A proteína S é crucial para a entrada de vírus, mas não necessariamente necessário para a montagem, como vírus partículas semelhantes podem se formar na ausência de proteína S. Patogênese e Imunidade A maioria dos coronavírus se replica primeiro nas células epiteliais da vias respiratórias ou entéricas. Como os coronavírus são envolvidos, os virions são menos estáveis no meio ambiente e amostras clínicas comparadas com a maioria dos vírus não envelopados. Embora a transmissão esteja geralmente associada a SARS-CoV é surpreendentemente estável em termos ambientais superfícies. Não está claro como esses vírus envelopados retêm infecciosidade na presença de enzimas biliares e proteolíticas presente no trato entérico. Talvez os virions possam ser mais resistente à degradação proteolítica porque o coronavírus glicoproteínas de envelope são extensamente glicosiladas. A patogênese e as respostas imunes de coronavírus foram mais estudados em coronavírus animal infecções. Por exemplo, o vírus da hepatite de camundongo (MHV), o protótipo de betacoronavírus, inclui um espectro de cepas com tropismo diferente, causando entérica, hepática, infecções respiratórias ou do SNC. Desde doença neurológica causada pelo MHV simula esclerose múltipla (EM) em humanos, a patogênese e as respostas imunes foram estudadas em detalhe. Altamente neurovirulento, moderadamente neurovirulento, cepas atenuadas causam diferentes manifestações clínicas envolvendo diferentes padrões de infecção de neurônios, oligodendrócitos, microglia e astrócitos. Desmielinização pode ocorrer, que é principalmente imunomediado; irradiado ou camundongos imunodeficientes congênitos não desenvolvem desmielinização após a infecção, mas quando esses ratos, que carecem de células T e B, são reconstituídas com T específico de vírus células, a desmielinização se desenvolve rapidamente. A desmielinização é acompanhada de infiltração de macrófagos e ativada microglia na substância branca da medula espinhal. Ambos CD4 e células T CD8 também são necessárias para a remoção do vírus sistema nervoso central (SNC), com células T CD8 como mais importante neste processo. Por outro lado, a eficácia do sistema imunológico inato A resposta também determina a extensão da replicação inicial do vírus e os níveis de vírus vistos. Os coronavírus desenvolveram estratégias para combater as respostas imunes inatas. Para Por exemplo, a proteína N e as proteínas acessórias SARS-CoV ORF6 e ORF3b impedem a indução de IFN e a proteína N impede a translocação nuclear de proteínas contendo Page 6 442 PARTE | II Doenças específicas por vírus em humanos sinais clássicos de importação nuclear, incluindo STAT1, um componente das vias de sinalização IFNα, IFNβ e IFNγ. INFECÇÕES POR CORONAVIRUS HUMANOS Infecções Respiratórias por Coronavírus Antes de 2003, o interesse em coronavírus humanos era impulsionado principalmente por ter um papel em infecções do trato respiratório superior. Estirpes virais HCoV- 229E e HCoV-OC43 foram isolados de pacientes com infecções do trato respiratório superior na década de 1960. Então, logo após a descoberta do SARS-CoV em 2003, dois novos coronavírus humanos foram isolados, o HCoV-NL63 em Holanda e HKU1 em Hong Kong. A célula hospedeira receptor para HCoV-229E aminopeptidase N, enquanto que para HCoV-NL63 é ACE2. Interesse no possível papel do ser humano coronavírus na esclerose múltipla iniciou uma busca por coronavírus humanos nos tecidos do cérebro humano. Um estudo encontraram sequências de HCoV-OC43 em 36% dos cérebros de EM pacientes e 14% nos controles, mas a significância disso permanece incerto. Recursos Clínicos O típico “resfriado comum” do coronavírus é leve e o vírus permanece localizado no epitélio das vias respiratórias superiores trato e provoca uma fraca resposta imune, daí a alta taxa de reinfecção. Não há imunidade cruzada entre coronavírus humano-229E e coronavírus humano-OC43, e é provável que novas cepas surjam continuamente por seleção de mutação. Estudos voluntários humanos mostraram que esses vírus causam uma doença de cerca de sete dias, com sintomas de dor de garganta, rinorréia, febre, tosse e dor de cabeça, indistinguíveis dos resfriados comuns causados por rinovírus. Infecções assintomáticas são frequentes medido pela detecção de vírus nas vias respiratórias superiores trato. Ocasionalmente, os coronavírus humanos HCoV-229E e O HCoV-OC43 causa infecções do trato respiratório inferior e inflamação na orelha. Não há evidências de nenhum desses vírus causando doença entérica em humanos, apesar da descoberta de partículas semelhantes a coronavírus nas fezes de tais pacientes. Diagnóstico Laboratorial Diagnóstico laboratorial do sistema respiratório humano “comum” os coronavírus geralmente não são necessários, mas às vezes incluídos no painel de patógenos respiratórios incorporados sistemas de ensaio RT-PCR multiplex. Esses vírus são difíceis crescer em células cultivadas, portanto, raramente são recuperadas sistemas clínicos. A exceção é o HCoV-NL63 que, como SARS-CoV, cresce rapidamente em várias linhas de células; isso pode ser ligada à constatação de que HCoV-NL63 e SARS-CoV são único no uso do ACE2 como receptor. Coronavírus humano OC43 e cepas relacionadas foram originalmente isolados em órgãos culturas de traquéia embrionária humana ou epitélio nasal. A cultura de órgãos é uma técnica complexa demais para um diagnóstico laboratório, mas algumas cepas podem ser isoladas diretamente linhas fibroblásticas diplóides do pulmão embrionário humano ou intestino. Os focos de células "granulares" tornam-se evidentes após uma semana e pode progredir para a vacuolização antes da desintegração; sincicios podem se formar em alguns tipos de células. Hemadsorção e hemaglutinação são demonstráveis apenas com OC43. Epidemiologia Como em muitas infecções respiratórias, a disseminação é por contato entre indivíduos infectados ou via fomites. HCoV- Os vírus 229E e HCoV-OC43 são mais frequentemente detectados entre novembro e maio no hemisfério norte, embora a incidência de infecção varie de ano para ano. Pensa-se que estes dois vírus juntos representem 5 a 30% de todos os resfriados comuns. Pouco se sabe em relação a a epidemiologia de HC-V-NL63 e HCoV-HKU1. VÍRUS RESPIRATÓRIO AGUDO GRAVE (SARS-CoV) A infecção por SARS-CoV em humanos é uma grave doença do trato respiratório que emergiu com dramática repentina na China em 2002. Até 20% das infecções cuidados intensivos necessários; a taxa geral de mortalidade inicialmente era cerca de 10%, mas se aproximou de 50% em pacientes idosos e aqueles com doença subjacente. A epidemia foi interrompida em 2003 por um sistema nacional e global de saúde altamente eficaz resposta, e o vírus não está mais circulando em humanos, embora seja endêmico em morcegos-ferradura. Características Clínicas e Patogênese A doença começou inicialmente com um pródromo semelhante à gripe começando dois a sete dias após a exposição. Isso foi seguido depois de mais três ou mais dias pela respiração respiratória fase do trato, incluindo tosse seca, dispnéia e aumento da dificuldade respiratória às vezes exigindo mecânica ventilação. A maioria dos pacientes apresentou linfopenia (70 a 95%), com uma queda substancial nas células T CD4 e CD8. Doenças assintomáticas ou leves eram incomuns, como ilustrado estudos de profissionais de saúde expostos nos quais menos de 1% das pessoas sem doença semelhante à SARS apresentavam sorologia evidência de infecção. No entanto, no ano seguinte ao epidemia de 2003, apenas alguns pacientes com SARS foram encontrados e estes tinham doença leve. SARS-CoV infectou ambos os Page 7 Capítulo dos coronavírus | 31 443 vias aéreas e células epiteliais alveolares, resultando em lesão pulmonar. Vírus ou produtos virais também foram detectados em outros órgãos, como rim, fígado e intestino delgado, bem como em fezes. Embora o pulmão seja reconhecido como o órgão mais severamente afetado pelo SARS-CoV, o mecanismo exato de lesão pulmonar é controverso.Níveis de vírus infecciosos diminuiu à medida que a doença clínica piorou, sugerindo que lesão pulmonar foi devido a um mecanismo imunopatológico. Semelhante a camundongos com desmielinização mediada por MHV, grandes número de macrófagos foi detectado no pulmão infectado. Contudo, esta conclusão derivou de amostras de animais vivos pacientes - de aspirados nasofaríngeos, não da pulmões ou outros órgãos (Fig. 31.4 ). Em comum com outros coronavírus, macrófagos infectados por SARS-CoV e células dendríticas, mas o ciclo de replicação não está completo nessas células. Várias citocinas pró-inflamatórias e quimiocinas, como IP-10, MCP-1, MIP-1, RANTES e MCP-2, TNF-α e IL-6 são expressos por dendríticos infectados células; muitas dessas moléculas também foram expressas em níveis elevados no soro de pacientes infectados. A infecção com SARS-CoV desencadeia uma série de e respostas imunes celulares em pacientes. IgG específica e anticorpos IgM contra SARS-CoV foram detectados aproximadamente duas semanas após a infecção, atingindo um pico 60 dias após a infecção e permaneceu em níveis elevados por pelo menos pelo menos 180 dias após a infecção. Altos títulos de neutralização anticorpos e T citotóxico específico para SARS-CoV linfócitos foram detectados em pacientes que se recuperaram da SARS, com altos níveis correlacionando-se bem com resultado favorável. Isso sugere que tanto humoral quanto respostas imunes celulares são cruciais para a eliminação de infecção por SARS-CoV. FIGURA 31.4 Histopatologia e imuno-histoquímica da síndrome da angústia respiratória aguda por SARS e MERS (SDRA). (A) SARS: lesões têm consistiu em dano alveolar difuso em vários níveis de progressão e gravidade - as alterações incluíram infiltração inflamatória mononuclear intersticial, formação de membrana hialina, descamação de pneumócitos e detritos inflamatórios necróticos em pequenas vias aéreas, hemorragia intra-alveolar focal e como mostrado células sinciciais multinucleadas. ELE. (B) SARS: coloração imuno-histoquímica de células infectadas por SARS-CoV livres no espaço intersticial em pequenas via aérea. Antígenos virais no citoplasma das células, incluindo células sincitais, com imunocoloração mais intensa perto das margens das células. Imunoalcalina sistema fosfatase, substrato vermelho naftol-rápido, contracorante com hematoxilina. (C) MERS: edema pulmonar com células inflamatórias mononucleares nos alvéolos. ELE. (D) MERS: coloração imuno-histoquímica de pneumócitos infectados por MERS-CoV nos alvéolos em um local onde a arquitetura pulmonar normal ainda é intacto. Sistema comercial complexo complexo avidina-fosfatase alcalina com substrato vermelho naftol-rápido. De Thomas Ksiazek, médico da Universidade do Texas Branch, Galveton e Sherif Zaki, Centros dos EUA para Controle e Prevenção de Doenças, e seus muitos colegas nesses estudos: Ksiazek, TG, et al., 2003. Um novo coronavírus associado à síndrome respiratória aguda grave. N. Engl. J. Med. 348, 1953-1966; e Ng, DL, et al. 2016. Clinicopathologic, achados imuno-histoquímicos e ultraestruturais de um caso fatal de infecção por coronavírus por síndrome respiratória no Oriente Médio nos Emirados Árabes Unidos, Abril de 2014. Alt. J. Pathol. 186, 652-658. Page 8 444 PARTE | II Doenças específicas por vírus em humanos Uma questão importante não resolvida é como o SARS-CoV causou uma doença tão grave em humanos. SARS-CoV infecta várias espécies de animais, incluindo camundongos, furões, hamsters, gatos e macacos cynomolgus, mas esses os animais desenvolvem doença leve ou subclínica. este pode ser devido ao fato de esses animais já terem infecção subclínica experimentada por um coronavírus de o mesmo grupo que o SARS-CoV. Consistente com isso, o curso clínico de SARS-CoV em pacientes em Guangzhou, China, foi moderado no ano seguinte ao surto de casos graves de SARS. Diagnóstico Laboratorial Freqüentemente uma combinação de sorologia e RT-PCR ensaios foram utilizados para detectar e confirmar a infecção. Com muito ensaios de PCR sensíveis (por exemplo, um ensaio de PCR aninhado ou em tempo real) extração de RNA e RNA que aumentaram a quantidade de amostra utilizada no ensaio, a taxa de positividade nas vias respiratórias as amostras aumentaram de menos de 40% para mais de 80% durante o segundo ou terceiro dia da doença. Resultados por EIA mostrou a presença de anticorpos SARS-CoV contra o Proteína N em 50% a mais de 80% dos soros coletados durante na primeira semana de doença e em mais de 50% das doenças respiratórias e amostras de fezes coletadas durante o segundo e terceiro semanas de doença. Os anticorpos contra a SARS foram detectados seis dias após início da doença, mas quase sempre 14 dias após o início da doença (em casos raros, os anticorpos não apareceram até quatro semanas após o início da doença). Porque SERA de pessoas não infectadas com SARS entre 2002 e 2003 raramente surto positivo para anticorpos SARS-CoV, uma única amostra positiva para anticorpos SARS-CoV foi geralmente considerado diagnóstico de infecção, e um resultado negativo teste em uma amostra de soro coletada tardiamente na doença (28 dias ou mais tarde após o início da doença) poderia ser usado para descartar Infecção por SARS-CoV. Porque o diagnóstico de reemergência SARS-CoV teria substancial saúde pública, social, econômico e econômico, um caso futuro diagnosticado como A SARS teria que ser confirmada por uma referência nacional laboratório antes que ações internacionais de resposta possam ser iniciado - falsos positivos ocorrem. Durante o surto de SARS-CoV, o diagnóstico rápido foi melhor realizado por RT-PCR usando primers definidos, geralmente derivado da sequência N viral. Para diagnóstico precoce, amostras de swabs da garganta ou da faringe nasal podem ser para RT-PCR, e amostras de soro também foram usadas para detectar RNA viral durante a primeira semana da doença. Ambas as fezes e amostras respiratórias foram analisadas quanto ao RNA viral durante a segunda semana de doença. Em contrapartida, as ensaios geralmente fornecem a melhor maneira de confirmar ou descartar infecções ex post facto . EIAs para antígenos virais N e S também foram desenvolvidos para rastrear pacientes suspeitos em áreas rurais áreas. Epidemiologia A alta mortalidade e rápida disseminação intercontinental de casos clínicos de SARS levaram a epidemiologia intensiva e investigações virológicas. Causou interrupção significativa cidades afetadas e muitas atividades que envolvem viagens. Ansiedade e avisos impactados em muitas partes do mundo (Fig. 31.5) Análise molecular e epidemiológica de campo estudos para identificar a fonte de SARS-CoV revelaram que os morcegos-ferradura eram provavelmente o reservatório natural deste vírus. Sequências de vários tipos distintos de SARS coronavírus foram amplificados a partir de morcegos-ferradura de Hong Kong e várias províncias da China, e 30% 85% desta espécie de morcego possuía anticorpos para uma doença semelhante à SARS coronavírus. Inicialmente, pensava-se que o SARS-CoV originava em gatos da civeta, mas estes foram posteriormente encontrados para agir como intermediários hosts que fornecem uma fonte de transmissão para seres humanos. Vários estudos sorológicos demonstraram que SARS-CoV não havia circulado de maneira significativa em humanos antes surto em 2002 e 2003. Algumas pessoas que trabalham nos mercados de animais selvagens na China tinham evidências sorológicas FIGURA 31.5 O surgimento repentino de casos humanos de SARS, com seus alta mortalidade e rápida disseminação intercontinental, causaram significativa interrupção de muitas atividades internacionais e levou a uma maior conscientização e respeito pela possibilidade de novas epidemias no século XXI. A partir de um pôster na parede, Departamento de Imigração, Camboja. Page 9 Capítulo dos coronavírus | 31 445 de uma infecção semelhante à SARS-CoV adquirida antes de 2003 surto, mas não relatou nenhuma doença respiratória semelhante à SARS. Embora os animais fossem a fonte original da SARS, seus disseminaçãoglobal ocorreu pela transmissão de humano para humano. A transmissão parece ocorrer através de contato próximo ou gotículas infecciosas e provavelmente aerossóis em alguns casos. Houve também uma variação substancial de paciente para paciente na eficiência da transmissão, que em parte estava associada com grau de gravidade da doença e possivelmente associado com a virulência de cepas virais. Desde o surto de SARS foi controlado em junho de 2003, apenas 17 casos de SARS foram foi confirmado e nenhum deles ocorreu após junho de 2004. A base subjacente para o misterioso surto e desaparecimento repentino de SARS ainda não foi totalmente explicado. Tratamento e Prevenção A prevenção foi baseada em cuidadosa identificação e isolamento de casos e contatos até dez dias após os sintomas tinha compensado, combinado com a investigação de circunstâncias ambientais responsáveis por grupos de casos. Essa abordagem interrompeu com sucesso o surto dentro de quatro meses após o início de seu spread global. Para o tratamento da SARS, vários medicamentos foram tentados clinicamente sem benefício claro e, desde então, vários drogas, incluindo inibidores de protease usados no HIV, foram investigado quanto à eficácia in vitro. A proteína S viral tem sugerido como candidato ao desenvolvimento de um plano preventivo vacina contra SARS ou outros coronavírus. No entanto, o variabilidade genética desses vírus e baixa imunidade após a infecção natural, indique os desafios envolvidos. VÍRUS RESPIRATÓRIO DO MÉDIO ORIENTE (MERS-CoV) O número crescente de coronavírus isolados de animais e pássaros ilustram que é provável que mais membros dessa família surgirão nos próximos anos, colocando novas ameaças à saúde pública nas áreas afetadas. O primeiro caso de MERS-CoV ocorreu em Jeddah, na Arábia Saudita Arábia em junho de 2012 com um paciente apresentando-se com pneumonia e insuficiência renal. Em maio de 2016, 1733 casos confirmados laboratoriais de MERS foram relatados à OMS, incluindo pelo menos 628 mortes (taxa de mortalidade de casos 36%). Evidências da presença de coronavírus MERS foi relatado em 27 países, mas ainda principalmente na Arábia Saudita Arábia e Coréia. Características Clínicas e Patogênese A apresentação clínica varia de infecção assintomática, doença leve semelhante à gripe ou pneumonia grave acompanhada pela síndrome do desconforto respiratório agudo (SDRA), choque e falência de múltiplos órgãos antes da morte. O curso de infecção é mais grave entre imunocomprometidos indivíduos e pessoas com condições médicas subjacentes, especialmente insuficiência renal crônica, doença cardíaca e diabetes. A doença começa com febre e tosse, dor de garganta, calafrios, artralgia e mialgia, logo seguidos por dispnéia. A infecção progride rapidamente para pneumonia grave (Fig . 31,4) Cerca de um terço dos casos também mostra sintomas gastrointestinais. sintomas como diarréia e vômito. O curso da doença é relativamente curto, com o doença progride rapidamente através de vários estágios 7 a 11 dias após a apresentação. O trato respiratório inferior está envolvido precocemente na infecção aguda. As radiografias de tórax são consistente com pneumonite viral, com infiltrados bilaterais, opacidades segmentadas ou lobulares e derrames pleurais. Em comum com outros coronavírus humanos, o MERS- CoV evita a resposta imune inata do hospedeiro e causa uma rápida desregulação das vias de transcrição celular. O resultado é uma extensa apoptose de células espectadoras, até maior extensão do que é o caso da SARS. O receptor celular para MERS-CoV foi identificado como CD26, uma dipeptil peptidase, em contraste com a angiotensina- enzima de conversão 2 (ACE2) usada pelo SARS-CoV. este receptor está envolvido na regulação das respostas de citocinas bem como o metabolismo da glicose. Anticorpos contra a ligação S O domínio do MERS-CoV neutraliza eficientemente a infectividade. Diagnóstico Laboratorial O RNA do MERS-CoV pode ser detectado no sangue, urina e fezes bem como em aspirados respiratórios por RT-PCR. Ao investigar e controlar um novo surto como esse, é essencial que uma política consistente para testar e interpretar os resultados do teste é aplicada ao diagnóstico, gerenciamento, quarentena e notificação de casos. A OMS fornece tais recomendações sobre o site deles www.who.int.csr . Epidemiologia Camelos dromedários têm sido implicados como o principal fonte de infecção para humanos, com alta porcentagem possuindo anticorpos virais. No entanto, a rota exata de transmissão de camelos não é clara. Um relatório recente de Sequências MERS-CoV em morcegos presos na Arábia Saudita adicionam para o quebra-cabeça. Embora a maioria dos casos hospitalizados são considerados casos secundários resultantes de transmissão humana ao ambiente de saúde, MERS- O CoV não é considerado altamente transmissível com um R 0 a <1 - não há evidências de propagação contínua dentro comunidade (consulte o Capítulo 13: Epidemiologia das doenças virais). Infecções para obter mais detalhes sobre a transmissibilidade do vírus). A análise filogenética de seqüências relacionadas sugere MERS-CoV divergiu de um ancestral comum em 2007 a 2010. A descoberta de outro Page 10 446 PARTE | II Doenças específicas por vírus em humanos coronavírus em camelos intimamente relacionados ao coronavírus bovino sugere que os camelos possam estar agindo como hospedeiros intermediários. Vírus intimamente relacionados foram recuperados de morcegos e duas alterações de aminoácidos na proteína spike de um desses vírus permite que seja ativado por proteases humanas e infectar células humanas. Isso sugere um mecanismo para esse vírus pular espécies de morcegos para humanos. Tratamento e Prevenção Até o momento, o tratamento tem sido focado na terapia de suporte na ausência de medidas de intervenção específicas. o uso de antimicrobianos para minimizar o risco de oportunismo infecção foi empregada. Tentativas de reverter o progressão do desconforto respiratório e fibrose através da o uso de corticosteróides não teve sucesso. A prevenção da infecção envolve evitar a exposição camelos, incluindo o consumo de leite cru e carne inadequadamente cozida, principalmente para diabetes, doença pulmonar crônica, insuficiência renal, imunocomprometidos ou idosos. Casos confirmados deve ser isolado para evitar a disseminação hospitalar. LEITURA ADICIONAL Coleman, CM, Frieman, MB, 2014. Os coronavírus: importante Emergin g patógenos humanos. J. Virol. 88, 5209–5212. Graham, RL, Donaldson, EF, Baric, RS, 2013. Uma década após a SARS : estratégias para controle de coronavírus emergentes. Nat. Rev. Microb . 11, 836-848. Pyrc, K., Berkhout, B., van der Hoek, L., 2007. O romance humano corona- vírus NL63 e HKU1. J. Virol. 81, 3051-3057. Grupo de Pesquisa MERS-CoV da OMS, 2013. 12. Nov. State of Knowledge e lacunas de dados do coronavírus da síndrome respiratória no Oriente Médio (MERS-CoV) em Humans, Edição 1. PLOS Surtos de Correntes. Disponível em: http://dx.doi.org/10.1371/currents.outbreaks.0bf719e 352e7478f8ad85fa30127ddb8 .
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