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1 @vireicientista reação em cadeia da polimerase Testes moleculares servem para indicar com certeza qual é o diagnóstico de um paciente, assim como testes sorológicos. TESTE SOROLÓGICO TESTE MOLECULAR + sensível + específico Anticorpos Segmento de DNA METODOS DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR Transcription-mediated amplification (TMA); Microarray; Next generation sequencing (NGS); Hibridização; Polymerase Chain Reaction (PCR) e suas variações; o RT-PCR; o qPCR (ou real time); o Nested PCR; o Multiplex PCR. INTRODUÇÃO AO DNA DOGMA CENTRAL DA BIOLOGIA MOLECULAR: Uma porção de gene de DNA vai ser transcrito em RNA e depois traduzido em proteína. TRANSCRIÇÃO: primeira etapa da expressão de um gene; A transcrição é realizada por enzimas chamadas RNA polimerases, que ligam nucleotídeos para produzir uma cadeia de RNA (usando uma cadeia de DNA como modelo). Porque transcrever? É preciso transcrever o DNA porque o DNA localizado no núcleo não pode entrar em contato com o citoplasma, por isso é transcrito em forma de RNA para fora do núcleo. APENAS VÍRUS FAZEM TRANSCRIÇÃO REVERSA! ENZIMA: TRANSCRIPTASE REVERSA, encontrada no HIV, hepatite, entre outros vírus. NUCLEOTÍDEO DNA é característico por apenas um OH no carbono 3. O fato do RNA ser mais instável é por conta do seu OH a mais no carbono 2. Não existe tradução reversa porque o codigo genético é degenerado. Significa que um mesmo aminoácido pode ser codificado por mais de um códon, mas o contrário não ocorre. 2 @vireicientista Adenina e guanina são purinas: Dois aneis carbono-nitrogênio. Citosina e timina são pirimidinas: Um anel carbono-nitrogênio. Uracila também é pirimidina: com apenas um anel carbono-nitrogênio. REPLICAÇÃO Helicase: promove a abertura da fita de DNA -> forquilha de replicação; Topoisomerase: desenrola a cadeia de DNA à frente da helicase, promovendo a diminuição na tensão da fita; RNA primase: sintetiza os primers (iniciadores) da reação; DNA polimerase: síntese da nova cadeia de DNA (sempre no sentido 5’-> 3’); Replicação semiconservativa; Cadeia contínua (mesmo sentido da replicação) e replicação fragmentada (Fragmentos de Okazaki); DNA ligase. REAÇÃO EM CADEIA DA POLIMERASE A PCR possibilita a amplificação de sequências de DNA que estejam presentes em misturas complexas para obtenção de grandes quantidades de DNA para sequenciamento e análises sobre a diversidade genética de populações. A extração de DNA inclui basicamente dois procedimentos principais: a lise das células presentes na amostra e a purificação do DNA. Após a lise das células, o DNA deve ser separado dos restos celulares e das proteínas, precipitado e suspenso em volume adequado de água ultrapura ou soluções-tampão adequadas. a) Desnaturação • DNA perde sua estrutura de dupla hélice • 94°C a 95°C • Primers se ligam à região complementar à sua sequência na amostra de DNA. • O DNA permanece desnaturado por todos os ciclos subsequentes, porque as fitas complementares estão em concentrações muito baixas, o que impede a sua reunião. b) Anelamento • A temperatura é reduzida (específica para cada par de primers). • Cada primer se encaixa nas respectivas sequências complementares à região-alvo da amplificação. c) Extensão • A temperatura é elevada até cerca de 272°C, 3 @vireicientista • A enzima DNA-polimerase (Taq-DNA- polimerase) se posiciona junto aos primers e com o auxílio do magnésio, inicia a síntese da nova fita. • A síntese se dá por meio da utilização dos nucleotídeos (dNTPs) que foram adicionados ao tampão e que são sempre complementares à fita-molde.
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