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Porção da enzima que faz parte do sítio ativo Ligações temporárias formadas pelo sítio ativo da enzima e o substrato, ajudadas pelo cofator Complexo do estado de transição • Sítios ativos: são os locais onde as cadeias laterais de aminoácidos estão ligadas ao substrato e realizam a catálise. • Eficiência catalítica: faixa de 10³ a 10*8 na qual a reação enzimática pode ocorrer mais rapidamente do que quando não catalisadas. • Especificidade: cada enzima específica apenas com um ou poucos substratos e realizam apenas um tipo de reação química. • Holoenzima: enzima ativa com seu componente não proteico (cofator ou coenzima – grupo prostético, ou seja, grupo ligado fortemente a enzima). • Regulação: as enzimas podem ser inibidas ou ativadas • Localização celular: muitas enzimas estão localizadas em organelas específicas dentro da célula. Elas atuam fornecem o ambiente específico onde dada reação é energeticamente mais favorável. Essa reação ocorre no interior de uma cavidade na enzima chamada de sítio ativo. No fim da ligação enzima-substrato, a enzima retorna a sua forma original, liberando os produtos. A formação do complexo enzima-substrato é o ponto de partida para todos os tratamentos matemáticos que definem o comportamento cinético e das descrições teóricas dos mecanismos enzimáticos. A função do catalisador é apenas aumentar a velocidade da reação, sendo assim, ela não altera o equilíbrio da reação. Diagrama da coordenada da reação G = variação de energia livre (eixo vertical) Coordenada da reação: o que ocorre na reação ao longo do tempo (eixo horizontal) S = substrato P = produto G+ = energia de ativação. É a energia necessária para a reação vencer o estado de transição, ou seja, a variação de energia livre do estado de transição. G’º = variação de energia livre padrão. A velocidade da reação reflete a energia de ativação; isto é, quanto maior for a energia de ativação, ela corresponde a uma reação mais lenta. Com o aumento da velocidade da reação pela ação de um catalisador, ocorre um aumento de temperatura e pressão e diminuição da energia de ativação. Catálise Enzimática Propriedades das enzimas Como funcionam as enzimas Reação enzimática simples Por que as enzimas não afetam o equilíbrio? Princípios que explicam o poder catalítico e a especificidade das enzimas Diagrama da coordenada da reação: catalisada e não catalisada Reação catalisada Reação não catalisada O catalisador promove a ação do complexo enzima substrato, diminuindo o estado de transição. A variação de energia não catalisada é muito maior que a catalisada, pois a velocidade da reação é menor. A velocidade da reação depende unicamente da energia de ativação, que corresponde a diferença entre os níveis de energia do estado fundamental e do estado de transição. O Estado de transição(ES*) é o momento molecular transitório no qual os eventos como quebra de ligações, formação de ligações e desenvolvimento de carga ocorrem com a mesma probabilidade para formar um substrato(S) ou para formar um produto(P). Ou seja, o momento em que a reação tem igual probabilidade de regredir ou progredir. EQUILÍBRIO → ligado a variação de energia livre padrão da reação (G’º). VELOCIDADE → ligada a energia de ativação (G+) 𝑆 𝐾′𝑒𝑞 ↔ 𝑃 • 𝐾′𝑒𝑞 = constante de equilíbrio 𝐾′𝑒𝑞 = |𝑃| |𝑆| • Relação termodinâmica entre 𝐾′𝑒𝑞 e G’º 𝐺’º = 𝑅𝑇𝑙𝑛 𝐾′𝑒𝑞 Onde: R = constante dos gases: 8,315J/mol.K T = temperatura absoluta: 298 K (25ºC) 𝑮’º positivo → equilíbrio de reação desfavorável 𝑮’º negativo → equilíbrio de reação favorável • Reação favorável: a energia livre do substrato é maior que a energia livre dos produtos. • Rearranjos das ligações covalentes (substrato → cadeia lateral dos aminoácidos, cofatores e coenzimas) • Interações não covalentes (enzima → substrato): ligações de H, interações hidrofóbicas e iônicas, que são otimizadas no estado de transição. Isso tudo nos reflete a energia de ligação, que é a principal fonte de energia livre usada pelas enzimas para diminuir as energias de ativação das reações. Papel da energia de ligação na catálise É a diferença entre a variação da energia livre catalisada e a variação da energia livre não catalisada (ver diagrama de coordenada). Velocidade e equilíbrio da reação A energia de ligação é usada para ultrapassar barreiras, então ocorre um decréscimo da liberdade molecular no sítio ativo e, consequentemente, redução da entropia. Além disso, há a dessolvatação do substrato através das ligações fracas enzima→substrato. O estabelecimento dessas ligações fracas ocasiona o chamado ajuste induzido. G+ = energia de ativação Gb = energia de ligação