Embora os protozoários possam se reproduzir de forma sexuada e assexuada, a reprodução assexuada é mais comum.

A principal diferença é que na divisão binária são formados organismos idênticos à célula original e na conjugação há novas combinações genéticas.A divisão binária é um tipo de reprodução assexuada e ocorre quando um ser se divide e origina duas células idênticas.A conjugação é considerada por alguns autores como um tipo reprodução sexuada, pois ocorre quando dois indivíduos se unem parcialmente, trocam material genético e geram descendentes após se separarem e realizarem divisão binária.

A principal diferença é que na divisão binária são formados organismos idênticos à célula original e na conjugação há novas combinações genéticas.A divisão binária é um tipo de reprodução assexuada e ocorre quando um ser se divide e origina duas células idênticas.A conjugação é considerada por alguns autores como um tipo reprodução sexuada, pois ocorre quando dois indivíduos se unem parcialmente, trocam material genético e geram descendentes após se separarem e realizarem divisão binária.