A possível explicação para a observação de que mutações de sentido trocado podem não ser deletérias, ao contrário das mutações por mudança da matriz de leitura (frameshift), é que algumas mutações de sentido trocado podem ocorrer em regiões não essenciais do gene, onde a alteração do nucleotídeo não afeta a sequência de aminoácidos ou a função da proteína resultante. Por outro lado, as mutações por mudança da matriz de leitura alteram a sequência de aminoácidos produzida, comprometendo a função do produto gênico, independentemente da região em que ocorrem.
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