A substância fundamental amorfa é uma mistura complexa altamente hidratada de carboidratos complexos, como os glicosaminoglicanos (GAGs), proteoglicanos e glicoproteínas. Sua função é preencher o espaço entre as células e as fibras do tecido conjuntivo. Além disso, atua como lubrificante e como barreira aos microrganismos devido à sua viscosidade.
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