Na fermentação, o rendimento energético é menor do que na respiração aeróbica. Na fermentação, ocorre apenas a etapa da glicólise no citosol, resultando na produção de 2 ATPs. Já na respiração aeróbica, além da glicólise no citosol, ocorrem outras etapas na mitocôndria, como o ciclo de Krebs e a cadeia respiratória. Essas etapas adicionais permitem a produção de um saldo total de 36 ATPs. Portanto, na respiração aeróbica, há um rendimento energético maior em comparação com a fermentação.