O tronco cerebral é composto pelo mesencéfalo, ponte e bulbo. Suas funções incluem o controle do ciclo sono-vigília, da consciência e do ritmo cardíaco e respiratório. O mesencéfalo é responsável pela visão, audição, movimento dos olhos e do corpo. A ponte é responsável por funções como sono, respiração, deglutição, audição, controle da bexiga, equilíbrio e paladar. O bulbo é responsável pelo controle de funções vegetativas, como o ritmo cardíaco, respiração, pressão arterial, reflexos, tosse, espirro e deglutição, e pela transmissão de sinais entre o cérebro e a medula espinhal.
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