O término da fermentação pode ser identificado por meio de análises químicas e físicas do meio de cultura, como a medição do pH, da concentração de oxigênio e da produção de metabólitos. Além disso, a observação da diminuição da atividade metabólica dos microrganismos também pode indicar o fim da fermentação. Quando esses parâmetros atingem valores estáveis, é possível iniciar a etapa de separação e purificação.
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