As bactérias Gram-negativas são coradas em vermelho porque durante o processo de coloração de Gram, a parede celular dessas bactérias é mais fina e possui uma camada externa de lipopolissacarídeos que é dissolvida pelo etanol, permitindo que o corante safranina penetre na célula e a corante em vermelho. Já as bactérias Gram-positivas possuem uma parede celular mais espessa e sem a camada externa de lipopolissacarídeos, o que faz com que o corante cristal violeta permaneça retido na célula, colorindo-a em roxo.
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