São classificados quatro tipos de infecção por fungos, embora se saiba pouco sobre os mecanismos precisos de como o sistema imune reage neste tipo de infecção, parece que as reações são parecidas com aquelas que acontecem com as bactérias. Abaixo estão listadas as principais categorias das infecções por fungo, exceto:

• Micoses subcutâneas;
• Micoses respiratórias;
• Micoses cutâneas;
• Candidíase.