As bases raras são incorporadas aos tRNAs por mudanças químicas em uma das bases padrão. Essas mudanças são realizadas por enzimas específicas que modificam a estrutura da base padrão, transformando-a em uma base rara. Essas bases raras são importantes para a regulação da expressão gênica e para a manutenção da estabilidade estrutural dos tRNAs.
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