Os insetos podem se tornar resistentes aos agrotóxicos devido a uma seleção natural. Quando um inseto é exposto a um agrotóxico, alguns indivíduos podem ter uma mutação genética que os torna resistentes. Esses indivíduos sobrevivem e se reproduzem, passando a resistência para sua prole. Com o tempo, a população de insetos se torna cada vez mais resistente ao agrotóxico, o que pode levar a uma necessidade de aumentar as doses ou trocar o produto utilizado. A aplicação intensiva de agrotóxicos pode afetar a cadeia alimentar de ambientes aquáticos e de solos devido à bioacumulação. Os agrotóxicos são absorvidos pelas plantas e, em seguida, pelos animais que se alimentam dessas plantas. Esses animais são, por sua vez, consumidos por outros animais, e assim por diante. Como os agrotóxicos não são facilmente eliminados do organismo, eles se acumulam ao longo da cadeia alimentar, podendo chegar a níveis tóxicos para os animais que estão no topo da cadeia. Além disso, os agrotóxicos podem contaminar a água e o solo, afetando diretamente os organismos que vivem nesses ambientes.
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