O Senecavírus A pode causar Perdas Neonatais Epidêmicas Transientes (PNET) em suínos. As manifestações clínicas incluem diarreia, vômito, anorexia, letargia e desidratação em leitões recém-nascidos. Além disso, pode haver aumento da mortalidade neonatal e diminuição do ganho de peso.
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