Na herança monogênica polialélica temos a participação de:
O número de marcadores empregados, a presença de subestruturas na população e a mistura de amostras podem interferir nos resultados em determinadas situações.
O fato de duas ou mais amostras terem o mesmo perfil para um grupo de marcadores genéticos em especial não significa, obrigatoriamente, que elas tenham a mesma origem (mesmo doador).