Para identificar qual das infrações é de natureza grave, vamos analisar cada alternativa: (A) Deixar de retirar todo e qualquer objeto que tenha sido utilizado para sinalização temporária da via - Essa infração pode causar riscos, mas não é considerada grave. (B) Ultrapassar veículo pela direita - Essa é uma infração grave, pois pode resultar em acidentes e é uma manobra perigosa. (C) Dirigir veículo com calçado inadequado - Essa infração é considerada leve, pois não representa um risco imediato significativo. (D) Conduzir bicicleta em local proibido - Essa infração é considerada leve a média, dependendo do contexto, mas não é grave. (E) Desobedecer às ordens emanadas da autoridade competente de trânsito ou de seus agentes - Essa é uma infração grave, pois desrespeitar a autoridade de trânsito pode levar a situações perigosas. Analisando as opções, as alternativas (B) e (E) são consideradas graves. No entanto, a ultrapassagem pela direita é uma infração mais diretamente relacionada à segurança no trânsito. Portanto, a alternativa correta é: (B) ultrapassar veículo pela direita.