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Existem diferentes formas de sequenciar um genoma, sendo que cada uma se aplica dependendo da realidade do pesquisador em questão, podendo ser técnicas recentes, que são mais robustas e sofisticadas, ou então, técnicas mais antigas, que, ainda assim, demonstram um excelente resultado, apesar de serem mais complicadas e menos automatizadas. Sobre essas técnicas, associe os itens, utilizando o código a seguir:
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
( ) Método de primeira geração, mais conhecido por utilizar nucleotídeos terminados de cadeia (ddNTP).
( ) Método que permite a análise da sequência de nucleotídeos em uma única molécula de DNA, sem a necessidade de amplificação dessa molécula, em tempo real.
( ) São métodos de nova geração, que não utilizam nucleotídeos terminadores de cadeia para o processamento das amostras.
A I - II - III.
B I - III - II.
C III - II - I.
D II - I - III.
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Exercícios Para o Aprendizado

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Questao de biologiamolecular 40
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Questao de biologiamolecular 40

UNIASSELVI

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Vamos analisar cada item e suas descrições: 1. Método de primeira geração, mais conhecido por utilizar nucleotídeos terminados de cadeia (ddNTP): Este é o método Sanger, que é uma técnica clássica de sequenciamento de DNA. 2. Método que permite a análise da sequência de nucleotídeos em uma única molécula de DNA, sem a necessidade de amplificação dessa molécula, em tempo real: Este se refere ao sequenciamento de terceira geração, como o sequenciamento por nanopore. 3. São métodos de nova geração, que não utilizam nucleotídeos terminadores de cadeia para o processamento das amostras: Isso se refere ao sequenciamento de nova geração (NGS), que inclui técnicas como o sequenciamento por síntese. Agora, vamos correlacionar as descrições com os métodos: - I: Método de primeira geração (Sanger) - corresponde à descrição 1. - II: Método de sequenciamento em tempo real (nanopore) - corresponde à descrição 2. - III: Métodos de nova geração (NGS) - corresponde à descrição 3. Agora, vamos verificar as alternativas: A) I - II - III: Não está correta, pois I é o método de primeira geração, não o de nova geração. B) I - III - II: Não está correta, pois a sequência não está correta. C) III - II - I: Não está correta, pois a sequência não está correta. D) II - I - III: Não está correta, pois a sequência não está correta. A sequência correta, considerando as descrições, seria: 1 (I) - 2 (II) - 3 (III). Portanto, a alternativa correta é: A) I - II - III.

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Assim como os demais "omas", o exoma compreende todo o conjunto de éxons presentes no DNA de um indivíduo, ou seja, as frações do DNA que codificam para os aminoácidos que irão formar as proteínas. De acordo com o sequenciamento do exoma, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
( ) É importante avaliar com cuidado os resultados obtidos no sequenciamento do exoma, uma vez que fornece informações relativas a diversas mutações, que não necessariamente são ligadas ao quadro clínico do paciente.
( ) Muitas das alterações encontradas no sequenciamento do exoma podem não apresentar relação com patologias, não sendo indicativos de risco até o momento.
( ) Este exame pode ser indicado para casais que apresentem consanguinidade, ou para doenças cujo diagnóstico seja inconclusivo em outros exames moleculares e que sejam suspeitos de doenças causadas por múltiplas alterações gênicas.
A V - V - V.
B V - F - V.
C F - F - V.
D F - F - F.

As endonucleases de restrição são produzidas naturalmente por diversas bactérias.
De acordo com essas enzimas, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) As enzimas de restrição são utilizadas para fragmentar o DNA em regiões específicas, permitindo a manipulação do DNA. ( ) Cada bactéria produz uma enzima de restrição específica, que pode ser isolada e purificada a partir de colônias dessas bactérias. ( ) As enzimas de restrição não reconhecem sequências específicas, apresentando regiões de clivagem aleatórias de 4 a 8 nucleotídeos. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A F - V - F.
B V - V - F.
C V - F - F.
D F - F - V.

A era da genômica iniciou-se através do Projeto Genoma Humano, através do desenvolvimento de tecnologias que pudessem acelerar o processo. De acordo com o Projeto Genoma Humano, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
( ) A técnica do shotgun hierárquico utiliza dois vetores, sendo um deles o BAC (cromossomo artificial de bactéria), que permite a inserção de grandes fragmentos de DNA, sendo clonado para formação da biblioteca de DNA.
( ) A técnica do shotgun hierárquico utilizou o vetor plasmidial na etapa final da clonagem, onde cromossomo artificial de bactéria era fragmentado e inserido em vetores plasmidiais clonados com extremidades sequenciadas.
( ) A técnica do shotgun de genoma inteiro utilizou somente pequena parte do genoma completo de um organismo para formar vetor plasmidiais clonados com extremidades sequenciadas, que formavam os contigs.
a) V - F - F.
b) V - F - V.
c) V - V - F.
d) F - F - V.

As respostas às drogas são influenciadas por múltiplos fatores, incluindo-se estado de saúde, influências ambientais e características genéticas. A farmacogenética é uma área da farmacologia clínica que estuda como diferenças genéticas entre indivíduos podem afetar as respostas às drogas. Sobre a farmacogenômica, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas:
Assinale a alternativa CORRETA:
I- A resposta aos fármacos pode ser diferente entre os indivíduos, em que a eficácia de um medicamento pode não ser a mesma para toda população. Ainda existe a probabilidade de efeitos colaterais ou até mesmo tóxicos, sendo interessante a busca pela medicina personalizada.
II- Tanto a farmacocinética, quanto a farmacodinâmica estão associadas à ação de diferentes enzimas e proteínas, que são codificadas por genes que podem conter diferenças entre os diferentes indivíduos.
A - As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
B - As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
C - As asserções I e II são proposições falsas.
D - A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.

As fases de leitura aberta (ORF) compreendem os códons de início (ATG) e de parada (TAA, TAG ou TGA), que para o RNA são substituídos pela uracila. Sobre o exposto, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas:
Assinale a alternativa CORRETA:
I- ORFs que contenham 100 ou mais códons podem ser indicadas como possíveis genes presentes no genoma que está sendo avaliado.
II- A presença do códon de início no genoma é um indicativo de um gene funcional, pois essa mesma sequência, quando encontrada no RNA (ou seja, na forma AUG), indica o local de início do processo de tradução da proteína codificada pelo RNA.
a) A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
b) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
c) As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
d) As asserções I e II são proposições falsas.

O gráfico a seguir ilustra uma curva de amplificação da PCR em tempo real. De acordo com a interpretação do gráfico, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
( ) A amostra A possui maior quantidade do gene avaliado, uma vez que possui menor Ct.
( ) A amostra C possui maior quantidade de amostra, pois quanto maior o Ct, maior a quantidade de material disponível para iniciar a amplificação do gene de interesse.
( ) A amostra B ultrapassou o Threshold após o ciclo 20, apresentando uma quantidade intermediária de amostra, quando comparadas às amostras A e C.
A V - F - F.
B V - V - F.
C F - F - V.
D V - F - V.

Apesar do avanço nas tecnologias e da possibilidade de expansão da quantidade de enfermidades testadas nos painéis de triagem neonatal, existe uma série de controvérsias em relação à importância de todos esses testes serem aplicados. No entanto, uma série de questões éticas têm sido debatidas sobre essa expansão. Sobre o exposto, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas:
Assinale a alternativa CORRETA:
I- Dentro da bioética, discute-se a importância da expansão desses testes, especialmente, devido a problemas que possam decorrer desses diagnósticos precoces ou resultados falso-positivos, que podem afetar a vida da família do neonato.
II- Muitos testes que poderiam ser incluídos em painéis de testagem neonatal são para doenças ou condições que não são totalmente esclarecidas quanto a sua severidade, nem mesmo quanto ao benefício do diagnóstico precoce para seu tratamento, sendo que muitas dessas doenças, não apresentam tratamento disponível.
a) As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
b) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
c) As asserções I e II são proposições falsas.
d) A asserção I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa.

Os testes de avaliação pré-natal não invasiva (NIPT) são indicados a partir da décima semana de gestação. Após a coleta da amostra, o DNA (materno e fetal) é extraído, amplificado e sequenciado por métodos de sequenciamento NGS (Next Generation Sequencing). Apesar de apresentar elevada precisão, uma pequena porcentagem dos resultados pode apresentar falso negativo ou falso positivo, sendo necessários testes complementares para confirmar o diagnóstico em casos positivos. De acordo com o exposto, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
( ) Dentre as avaliações possíveis com esse método, estão as trissomias dos cromossomos 13, 18 e 21, ou seja, as síndromes de Patau, de Edwards e de Down, respectivamente, a monossomia do cromossomo X (síndrome de Turner) e a síndrome de Klinifelter (XXY).
( ) A sexagem fetal, realizada por muitos casais atualmente, pode ser realizada com essa metodologia, em que a presença do cromossomo Y, indica sexo masculino, e a ausência, indica o sexo feminino.
( ) Essa técnica não consegue avaliar as microdeleções cromossômicas, como perda de pequenas porções do DNA do cromossomo.
a) F - V - F.
b) F - F - V.
c) V - F - F.
d) V - V - F.

As informações obtidas no processo de digestão proteica são relativas à m/z dos diferentes peptídeos. Contudo, é de grande interesse que as sequências de aminoácidos que compõem as proteínas sejam também identificadas. De acordo com a detecção da sequência dos aminoácidos de uma proteína, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas:
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
( ) No processo de fragmentação dos íons peptídicos, são utilizadas técnicas que favorecem a formação de fragmentos que sejam opostos e complementares.
( ) A sequência de aminoácidos dos peptídeos pode ser deduzida por softwares apropriados para o sequenciamento, que podem formar a sequência completa da proteína.
( ) Os processos de dissociação induzida por colisão (CID) ou por transferência de elétrons (ETD) formam íons de massa molecular elevada, que são aplicados ao primeiro ciclo de cromatografia líquida.

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