Vamos analisar cada uma das sentenças: I- A MNase (nuclease microcócica), uma nuclease específica, capaz de clivar o DNA em pequenos fragmentos, é modificada com a adição de uma proteína, a proteína A (pA) no sequenciamento CUT & RUN. Essa afirmação é verdadeira, pois a MNase é utilizada no método CUT & RUN para clivar o DNA em regiões específicas onde a proteína de interesse está ligada. II - A MNase modificada com a pA forma regiões de interação entre a proteína e o DNA que podem ser imunoprecipitadas, formando uma amostra rica de precipitados de regiões de interação da proteína de interesse com o DNA. Essa afirmação também é verdadeira, pois a imunoprecipitação é uma técnica comum para isolar as regiões de DNA que interagem com a proteína de interesse. III - No sequenciamento ChIP, a proteína de interesse é reticulada ao DNA, ou seja, são formadas ligações covalentes entre a proteína e o DNA por meio da adição de anticorpos específicos para essa proteína. Essa afirmação é falsa. No ChIP (Chromatin Immunoprecipitation), a proteína de interesse é ligada ao DNA, mas não por meio de ligações covalentes; a ligação é geralmente não covalente, e os anticorpos são usados para precipitar a proteína ligada ao DNA, mas não para formar ligações covalentes. Com base na análise, as sentenças I e II estão corretas, enquanto a III está incorreta. Portanto, a alternativa correta é: B) As sentenças I e II estão corretas.