Para identificar o que caracteriza um gene silenciado epigeneticamente, precisamos entender o conceito de silenciamento gênico. O silenciamento epigenético geralmente ocorre por meio de modificações que não alteram a sequência do DNA, mas que afetam a expressão gênica. Analisando as alternativas: a) O gene possui uma mutação que o torna inativo - Isso se refere a uma alteração na sequência do DNA, não ao silenciamento epigenético. b) O gene não é expresso devido à metilação do promotor ou compactação da cromatina - Esta opção descreve precisamente o silenciamento epigenético, onde a metilação e a compactação da cromatina impedem a expressão do gene. c) O gene está sempre ativo, mas sem produzir proteínas - Isso não é correto, pois um gene silenciado não está ativo. d) O gene é removido do genoma - Isso se refere a uma deleção, não ao silenciamento epigenético. Portanto, a alternativa correta é: b) O gene não é expresso devido à metilação do promotor ou compactação da cromatina.