Para identificar os principais problemas ambientais em ecossistemas aquáticos no Brasil, é importante considerar os elementos que frequentemente estão associados à poluição e à degradação desses ambientes. Analisando as opções: A) Fósforo, enxofre e carbono - O fósforo é um elemento importante, mas o enxofre não é um dos principais problemas em ecossistemas aquáticos. B) Carbono, enxofre e nitrogênio - O nitrogênio é relevante, mas o carbono e o enxofre não são os principais focos de problemas em ecossistemas aquáticos. C) Carbono, nitrogênio e cálcio - O cálcio não é um dos principais problemas em ecossistemas aquáticos. D) Fósforo, carbono e nitrogênio - O fósforo e o nitrogênio são frequentemente associados à eutrofização, que é um problema significativo em ecossistemas aquáticos. O carbono, embora importante, não é um foco principal. E) Nitrogênio, nitrato e nitrito - O nitrogênio, especialmente na forma de nitrato e nitrito, é um dos principais problemas em ecossistemas aquáticos, contribuindo para a poluição e eutrofização. Diante dessa análise, a opção que melhor representa os principais problemas ambientais em ecossistemas aquáticos no Brasil é: E) Nitrogênio, nitrato e nitrito.