Qual a localização dos aminoácidos apolares nas proteínas localizadas em ambiente hidrofóbico, como por exemplo nas membranas plasmáticas das células?

Em soluções aquosas, as cadeias tendem a agrupa-se no interior da proteína. Acopladas na superfície da membrana.

Os aminoácidos apolares apresentam radicais de hidrocarbonetos apolares ou hidrocarbonetos modificados, exceto a glicina. São radicais hidrofóbicos. É um grupo de aminoácidos com cadeia laterias apolares. Desse grupo fazem parte alanina, glicina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, triptofano e metionina.

Em vários elementos do grupo - isto é, alanina, valina, leucina, e isoleucina - a cadeia lateral é um grupo hidrocarboneto alifático. A prolina tem uma estrutura cíclica alifática e o nitrogênio está ligado a dois átomos de carbono. Na terminologia de química orgânica, o grupo amina da prolina é uma amina secundária.

Em contraste os grupos amina de todos os outros aminoácidos são aminas primárias. Na fenilalanina, o grupo hidrocarboneto é aromático (contém um grupo cíclico semelhante ao anel de benzeno) em vez de alifático. No triptofano, a cadeia lateral contém um átomo de nitrogênio adicionado ao grupo hidrocarboneto alifático.

Fonte:

http://www.ebah.com.br/content/ABAAAAt68AB/aminoacidos