Já na regulação alostérica a ligação do afetor ou modulador ao sítio enzimático ocorre através de ligação não covalente. Essa ligação pode aumentar ou reduzir a atividade enzimática.
Na regulação covalente há a ligação no sítio ativo do agonista, sendo que o antagonista se liga covalentemente a esse sítio. Assim, mesmo aumetando a quantidade de agonista, o efeito não é retardado.
Na regulação alostérica, o antagonista, ou um agonista, se ligará a outro sítio, que não seja o sítio ativo, mas um sítio alósterico, o qual irá interferir na ação do agonista no sítio ativo. Como não se trata do sítio ativo, o aumento do agonista também não irá afetar a ação do fármaco alostérico. Entretanto, por não se tratar de uma ligação covalente, ele pode se desligar do sítio, revertendo a ação de regulação.
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