porque medidas provisorias trancam a pauta na camara dos deputados

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O "trancamento da pauta" dá em virtude do disposto no art. 62, §6º, da Constituição Federal:

§ 6º Se a medida provisória não for apreciada em até quarenta e cinco dias contados de sua publicação, entrará em regime de urgência, subseqüentemente, em cada uma das Casas do Congresso Nacional, ficando sobrestadas, até que se ultime a votação, todas as demais deliberações legislativas da Casa em que estiver tramitando

Na verdade, a medida provisória não apreciada não tranca somente a pauta da Câmara, mas sim da Casa em que estiver tramitando, podendo "trancar" tambem a pauta do Senado Federal, portanto.

Não se pode esquecer que somente em casos de relevância e urgência é que o Presidente da República poderá editar medidas provisórias, as quais devem ser apreciadas pelo Congresso Nacional em até 45 dias. Trata-se de uma espécia de coerção definida pelo constituinte para que as Casas Legislativas não fiquem inertes à apreciação da MP; é uma forma de obrigar as Casas a cumprirem o disposto na Constituição.