Sim elas são encontradas em ambientes de água doce rico em matéria orgânica; poucas espécies foram registradas em ambientes marinhos, em água salobra e solos úmidos.
Espécies de Euglena são encontradas em água doce e salgada. São muitas vezes abundantes em águas calmas do interior, onde podem florescer em número suficiente para colorir a superfície das lagoas e valas verdes ou vermelhas.
A espécie Euglena gracilis tem sido amplamente utilizada no laboratório como um organismo modelo. A maioria das espécies de Euglena possui fotossíntese de cloroplastos dentro do corpo da célula, o que permite que eles se alimentem por autotrofia , como plantas.
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