Nas fontes terciárias consultadas, é descrito que estudos em animais e in vitro demonstraram que pantoprazol é comparável ou mais potente do que o omeprazol1 , com menor potencial para interações com fármacos substratos das enzimas do citocromo P4501,2 e melhor estabilidade em meio ácido. Entretanto, doses de 20mg de omeprazol e de 40mg de pantoprazol são descritas como equipotentes para as indicações em comum