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BCM 1 - Prof: Hagamenon e Tabata @medbyrafap 16/09/2021 Peptídeos e Proteínas BasesCelulares e Moleculares Aminoácidos são o monômeros das proteínas. Ligação Peptídica: - Ligação de 2 aminoácidos no mínimo; - Os aminoácidos podem formar polímeros lineares pela ligação do grupo carbonila de um aminoácido com o grupo amino de outro; - Esta ligação carbono-nitrogênio é uma ligação amídica, no caso das proteínas, chamada de ligação peptídica; O = C - N - É obtida por remoção - Toda vez que o aminoácido se ligar vai ter a condensação de uma molécula de água ( remoção ) ; OBS = Processo de desidratação na ligação peptídica é chamada de condensação. Um terceiro aa. se ligará ao grupo carboxila livre a direita e nunca ao grupo amino livre da esquerda. - Extremidade amino livre (N-terminal) = à esquerda da cadeia peptídica; - Extremidade carboxila livre (C-terminal) = à direita da cadeia peptídica; - Dessa forma, todas as sequências de aa são lidas da extremidade N para C-terminal do peptídeo, ou seja, da esquerda para a direita; - Cada aa que compõe um peptídeo é denominado “resíduo”, pois teve saída de alguns átomos, logo o que sobra recebe esse nome. mRNA (no ribossomo na síntese proteica) que 1 BCM 1 - Prof: Hagamenon e Tabata @medbyrafap 16/09/2021 designa o tipo de aa que vai ligar, essa ligação acabam quando tem “stop" = códon de parada. - Sai o “ina" e fica o “il”. Ex: glicina -> clicil, exceto o último aminoácido. - Imagem: seril-glicil-tirosil-alanil-leucina (último aa mantém o “ina”); - As ligações entre os carbonos α e os grupo α-amino ou α- carboxila podem rotar livremente, embora sejam limitadas pelo tamanho e pelo caráter dos grupos R ( ligação peptídica não gira, pois tem uma nuvem de elétrons que deixa ela rígida, o carbono α tem rotação livre, logo importante pois numa ligação peptídica as cadeias laterais vão estar em vários sentidos - em cima ou em baixo- essa rotação livre permite uma ligação química a q ua l pe rm i te uma es t r u t u r a tridimensional à proteína); - A ligação peptídica geralmente é uma ligação trans (em vez de cis), em grande parte devido à interferência estética dos grupos R quando em posição cis. - Em todas as ligações amidas, os grupos - C=O e -NH da ligação peptídica nao possuem carga (pois já estão interagindo) e nem aceitam ou fornecem prótons na faixa de pH de 2 a 12 (as cadeias laterais e o COOH- podem); - Os grupos -C=O e -NH da ligação peptídica são polares e estão envolvidos em ligações de hidrogênio. OBS: proteína não teria função se não tivesse essa rotação que dá estrutura às proteínas. Para que haja as ligações peptídicas trans, os aminoácidos adjacentes precisam possuir cadeias laterais hidrofílicas intercaladas com cadeias laterais hidrofóbicas. Uma vez que a 2 BCM 1 - Prof: Hagamenon e Tabata @medbyrafap 16/09/2021 rotação do carbono alfa depende da polaridade da cadeia lateral, ou seja, depende das cargas das cadeias laterais. Nomenclatura de peptídeos e proteínas: - 2 aa = dipeptídeo - 3 aa = tripeptídeo - 4 aa = tetrapeptídeo - Até 30 aa = oligopeptídeo - > 30 aa aminoácidos = polipeptídeo Funções dos peptídeos: - Muitos peptídeos encontrados na natureza desempenham funções importantes, atuando como hormônios (encefalinas, ocitocina - durante o parto-, vasopressina -ADH anti-diurético-, glucagon- períodos de jejum-), agentes redutores (glutationa), etc. - Existem também os peptídeos sintéticos. • Aspartame: - 2 aminoácidos; - Adoçante Proteínas: - São fundamentais para qualquer ser vivo; - Toda manifestação genética é dada por meio de proteínas; - Grande parte dos processos orgânicos são mediados por proteínas (enzimas) - Toda enzima é uma proteína, mas nem toda proteína é uma enzima; - Existem muitas espécies diferentes de proteínas, cada uma especializada para uma função biológica diversa (depende da posição); - Independentemente da sua função ou espécie de origem, são construídas a partir de um conjunto básico de vinte aminoácidos. - As proteínas podem ser formadas por uma ou mais cadeias polipeptídicas e contêm, geralmente, mais de 50 aminoácidos; - Desempenham uma função específica e, com poucas exceções (colágeno), contêm todos os 20 aminoácidos ( outras com excessão do colágeno), em proporções que variam muito de proteína para proteína. - Maior proteína do organismo humano: Titina (muscular), 34.530 aa / cadeia única, proteína muscular que confere elasticidade às fibras A variação das proteínas varia de acordo com alguns aspectos: 3 BCM 1 - Prof: Hagamenon e Tabata @medbyrafap 16/09/2021 • Composição: - Proteínas simples: só tem aminoácido. A hidrólise produz apenas aminoácidos. - Ex: albumina - OBS: Se pegar a albumina e quebrar ela toda, no final só irá encontrar aminoácido, logo é uma proteína simples. - Proteínas conjugadas: tem uma parte proteica e outra não. Apresentam a cadeia de aminoácidos ligada a um grupo prostético (composto não protéico ou seja, não é proteína. Ex: Hemoglobina. • Forma: - Proteínas fibrosas: insolúvel, tem forma alongada e desempenham papel estrutural, de suporte e proteção nos sistemas biológicos; proporcionam resistência e flexibilidade. Ex: queratina, colágeno - Queratina: - As α-queratinas foram desenvolvidas para força/ resistência. Encontradas somente em mamíferos, essas proteínas constituem praticamente todo o peso seco de cabelos, pelos, unhas, garras, penas, cascos e grande parte da camada mais externa da pele. - Colágeno: - Dá resistencia aos tecidos, além de ser a proteína mais abundante no corpo humano, alto conteúdo de glicina, prolina e de hidroxiprolina (prolina ligada a uma hidroxila). São 3 cadeias formando uma hélice tripla, o tropocolágeno, módulo estrutural básico do colágeno. - Polipeptídeos precursores de colágeno são formados nos fibroblastos (ou nas células relacionadas - osteoblasto dos ossos e condroblastos da cartilagem) e são secretos na matriz extracelular. - Ma is de 20 t ipos de co lágeno ; componentes estruturais de tamanho semelhante, com aproximadamente 1000 aa. - Escorbuto = deficiência de vitamina C (acerola) 4 BCM 1 - Prof: Hagamenon e Tabata @medbyrafap 16/09/2021 - Proteínas globulares: solúveis, apresentam uma ou mais cadeias polipeptídicas organizadas em uma forma final aproximadamente esférica, apresentam funções dinâmicas (enzimática, reguladoras e de defesa); os grupos hidrofóbicos ficam no interior e os hidrofílicos no exterior - pontes de H com água- solúveis. • Número de cadeias: - Proteínas mgnoméricas (única cadeia); - Proteínas oligoméricas (1 ou mais cadeia unidas). • Interação com a MP: - Proteínas integrais; - Proteínas periféricas OBS = Se pegar a albumina e quebrar ela toda, no final só irá encontrar aminoácido, logo é uma proteína simples. Na proteína conjugada se tem uma proteína ligada a uma porção que não é proteica, ou seja, grupo protesto (composto não proteico). Com o aumento da tempo quebra as lig química e dai de estrutura terciárias passa a ser primaria e a proteína perde função. Classificação das proteínas: - A organização espacial da proteína é resultante do tipo de aminoácido que a compõem e de como eles estão dispostos uns em relação aos outros; - A sequencia dos aa irá determinar o tipo de interação possível entre as cadeias laterais, que apresentam características de carga, volume e reatividade com a água muito variáveis (hidrofóbico, apolar se repelem e quase não tem interação). - A estrutura do proteína depende da sequencia de aminoácidos; - A organização tridimensional de uma proteína pode ser descrita em níveis estruturais de complexidade crescente EstruturaPrimária de proteína: - É a sequencia de aa ao longo da cadeia po l i pept íd i ca , que é determ inada geneticamente, sendo específica para cada proteína (mRNA que determina a sequencia de aminoácidos de uma proteína); - A compreensão de estrutura primária (sequencia) das proteínas é importante, pois muitas doenças genéticas resultam em proteínas com sequencias anormais de aminoácidos, ocasionando organização irregular, com perda ou prejuízo da função normal. - Por convenção, a estrutura primária é escrita na direção: amino-terminal -> carboxi-terminal 5 BCM 1 - Prof: Hagamenon e Tabata @medbyrafap 16/09/2021 Estrutura Secundária de proteína: - Descreve as estruturas regulares tridimensionais formadas por segmentos da cadeia polipeptídica; - Duas conformações são particularmente estáveis: α-hélice e folha β-pregueada. •α- hélice: aa próximos - Estrutura mantida por ligações de hidrogênio; - As cadeias laterais dos aminoácidos estão projetadas para o lado exterior da hélice (lado de fora da proteína). •Folha β-pregueada: aa n 1 com n 30, aa distantes - Estrutura mantida por l igação de hidrogênio; - As ligações isso estabelecidas entre cadeias polipeptídicas diferentes ou entre segmentos distantes de uma mesma cadeia; - A orientação das cadeias adjacentes (setas), do amino-terminal para carboxi- terminal, pode ser a mesma ou oposta. Estrutura Terciária de proteína: 6 BCM 1 - Prof: Hagamenon e Tabata @medbyrafap 16/09/2021 - Descreve o dobramento final da cadeia polipeptídica por interação de regiões com estrutura regular (α-hélice e folha β- pregueada) ou de regiões sem estrutura definida; - Segmentos distantes de estruturas primárias pode aproximar-se e interagir, através de ligações entre as cadeias laterais dos aminoácidos: •Ligação de hidrogênio; •Interações hidrofóbicas; •Ligações iônicas ou salinas; •Ligação dissulfeto (-S-S); - O que determina a estrutura terciária são as cadeias laterais dos aminoácidos. Algumas cadeias são longas e hidrofobia e agrupam-se no interior da proteína provocando uma dobras ou looping deixando as partes hidrofílicas expostas na superfície da proteína. Estrutura Quaternária de proteína: - Descreve a associação de duas ou mais cadeias polipeptídicas (subunidades) para compor uma proteína funcional; - Mantida por ligações não vocalmente entre as subunidades, dos mesmos tipos que mantêm a estrutura terciária. Desnaturação proteica: Perda de estrutura da proteína devido a: - Temperatura (mais a alta temperatura que desnatura, a baixa temperatura é menos); - pH (pode interferir na ionização da cadeia lateral, fazendo com que a proteína volte a ser primária); - Força iônica; - Radiação ionizante; - Solventes orgânicos; - detergentes; - Agentes que desfazem ligação dissulfeto (formol). 7 BCM 1 - Prof: Hagamenon e Tabata @medbyrafap 16/09/2021 OBS: uma proteína desnaturada perde o seu poder funcional (atividade biológica). A ligação peptídica não é desfeita. • Desnaturação reversível e irreversível: - pode desnaturar e renaturar (depende da exposição e e temperatura a qual foi exposta) - Ex: albumina do ovo não se renatura, pois foi exposta a alta temperatura a ela. • Enovelamento da proteína: - Algumas proteínas in ic iam o seu dobramento ainda durante a síntese (N- terminal para o C-terminal); - As chaperonas moleculares auxiliam no enovelamento da maioria das proteínas. • Forças que promovem e mantém o enovelamento: - Ou seja, a estrutura tridimensional (na secundária, terciária e quaternária); - Pontes dissulfetos (covalente); - Ligação de hidrogênio;Interação iônica; - Interação hidrofóbica • Hsp 70: Enovelamento de proteínas É um exemplo de chaperona, ele impede interação química entre aminoácidos que não deveriam estar interagindo, através de ATP. - Atua precocemente sobre muitas proteínas, ligando-se a aminoácidos hidrofóbicos antes que a proteína deixe o ribossomo; - Ligando-se a uma cadeia de cerca de quatro ou cinco aminoácidos hidrofóbicos, mantendo a proteína desenovelada; - Transferida através de translocadores para a mitocôndria ou RE; - Quando da ligação ao ATP, a Hsp70 libera a proteína em solução dando-lhe uma nova oportunidade de enovelamento. • Hsp60: Controle de qualidade (chaperoninas) Ela consegue desfazer a ligação errada e refazer a correta do enovelamento da proteína. - Age após a proteína ter sido totalmente sintetizada; - Reconhecendo aminoácidos hidrofóbicos expostos erroneamente (proteína mal 8 BCM 1 - Prof: Hagamenon e Tabata @medbyrafap 16/09/2021 formada); - Forma uma “câmara de isolamento” (barril) do citosol, fornecendo um ambiente favorável no qual possam tentar um novo dobramento utilizando a energia do ATP hidrolisado. - Geralmente, usam vários ciclos de hidrólise de ATP para promover o dobramento correto. • Proteassomo: - Complexo enzimático presente no citosol; - Degrada proteínas mal formadas ou mal enoveladas, pois não pode ter acúmulo delas no organismo; - Funcional em pH fisiológico; - Formado por múltiplas subunidade polipeptídicas. • O que ocorre de proteínas mal formadas não forem destruídas pelo proteossomas? -Novelos neurofibrilares são proteínas que mal formadas podem levar a disfunção do neurônio, assim causando doenças como, por exemplo, Alzheimer. •Príons: -Agente infeccioso sem material genético, ou seja, sem DNA e RNA; -São proteínas mal dobradas; -Tem-se uma proteína parecida e dai esse príon vai lá e pega essa proteína e defeitua ela, que antes era normal no nosso organismo. -Ela causa a doença da vaca loca, onde ela degenera o SNC. -Em humanos pode ocorrer pe la contaminação da carne, por exemplo. -Essa doença em humano recebe o nome de Creutzfeld Jakob. 9
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