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Bioinformática Aula 5

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1.
		Assinale a alternativa CORRETA:
 
	
	
	
	O método de Sanger e Coulson (1977) para sequenciamento de DNA também é conhecido como método de sequenciamento por interrupção de cadeia.
	
	
	O método de Sanger e Coulson (1977) foi o primeiro método que permitiu aos cientistas determinar a sequência de nucleotídeos de uma determinada molécula de DNA.
	
	
	O projeto original e, na verdade, o primeiro método de sequenciamento de DNA por interrupção de cadeia, data de 1976, cujos autores são Allan Maxam e Walter Gilbert.
	
	
	É atribuído a Sanger e Coulson o mérito do sequenciamento do DNA por interrupção de cadeia, porque a técnica foi desenvolvida em 1975 e demorou 2 anos para ser publicada.
	
	
	O método de sequenciamento de DNA por interrupção de cadeia é idêntico ao modelo original descrito por Sanger e Coulson (1977) e também se mantém o método confiável em termos de qualidade das sequências.
	
Explicação:
Primeiro método se sequenciamento de primeira geração.
	
	
	 
		
	
		2.
		A respeito dos sequenciadores, marque a alternativa INCORRETA.
	
	
	
	O Ion Torrent que é um equipamento entre 2º e 3º geração utiliza a variação do pH como mecanismo de detecção.
	
	
	 O pirossequenciador mede a liberação do pirofosfato por quimioluminescência
	
	
	O Ilumina assim  como o método de Sanger realiza síntese usando DNA polimerase e dideoxinucleotídeos marcados e não constrói biblioteca.
	
	
	No SoLiD, a reação de sequenciamento é catalisada por uma DNA ligase e não pela DNA polimerase
	
	
	Os sequenciadores de 1º geração produzem fragmentos sequenciados maiores, porém os de 2º geração são muito mais rápidos.  
	
Explicação:
Resposta letra D. O Ilumina utiliza didesoxinucleotídeos assim como o sequenciamento por Sanger, porém ele constrói bibliotecas a a partir do PCR de emulsão.
	
	
	 
		
	
		3.
	A respeito do sequenciamento de Sanger e o Pirossequenciamento, marque V para as verdadeiras e F para as falsas.
	
	
	
	          
	O Pirossequenciador e o Sequenciador automático de Sanger pertencem a 1º geração dos sequenciadores.
	
	          
	No pirossequenciamento a liberação do pirofosfato proveniente da formação da ligação fosfodiester, é convertido em luz e lido no sequenciador.
	
	          
	O Pirossequenciador é um aparelho classificado na segunda geração
	
	          
	O pirossequenciador é classificado como de 3º geração e o sequenciamento automático de Sanger como 1º geração.
	
	          
	No sequenciamento automático de Sanger, a reação da fita complementar é interrompida pela adição dos didesoxirribonucleotídeos.
	
Explicação:
O pirossequenciador é um aparelho classificado como de 2º geração
	
	
	
	 
		
	
		4.
		Uma fita de DNA apresenta a seguinte sequência:
TCAAGT
Marque a alternativa que indica corretamente a sequência encontrada na fita complementar:
	
	
	
	AGTTCA
	
	
	ATAAUA
	
	
	UCTTGU
	
	
	AGUUGA
	
	
	AGUUCA
	
Explicação:
 É importante perceber que o DNA é composto por duas fitas e que uma complementa a outra. Sabemos que na molécula de DNA a adenina sempre se une à timina e que a citosina sempre se liga à guanina. Sendo assim, uma sequência TCAAGT liga-se a uma sequência AGTTCA.
	
	
	
	 
		
	
		5.
		(PCERJ) O DNA (ácido desoxirribonucléico) é constituído por uma longa fita dupla de nucleotídeos. O sequenciamento de DNA é um processo que determina a ordem desses nucleotídeos. A fita dupla é formada pelo pareamento das bases. Desta forma, referente ao pareamento desses nucleotídeos, não é correto afirmar:
	
	
	
	As bases dos nucleotídeos são adenina (A), timina (T), guanina (G) e citosina (C)
	
	
	Adenina se pareia com timina
	
	
	A sequência desse pareamento é responsável pelas características genéticas do homem e de todos os seres vivos
	
	
	A guanina se pareia com adenina
	
	
	A guanina se pareia com citosina.
	Explicação:
Retornar na aula 5, no topico de sequenciamento
	
	
	
	 
		
	
		6.
		Marque a alternativa que melhor define um gene.
	
	
	
	O gene é uma porção da molécula de RNA que determina uma característica.
	
	
	O gene é uma sequência de nucleotídeos em que está contida a informação que será usada para a síntese de proteínas.
	
	
	O gene é uma porção da célula.
	
	
	 O gene é uma região do DNA que é responsável pela síntese de carboidratos, determinando nossas características.
	
	
	Trecho do RNA que contém sequências de nucleotídeos que são usados para a síntese de proteínas.
	Explicação: O gene é uma porção de DNA (sequência de nucleotídeos) onde estão contidas as informações que serão essenciais para a formação das proteínas.
	
	
	 
		
	
		7.
		(MPU2007) Um pesquisador deseja isolar um gene de uma espécie de planta hipotética que codifica uma proteína capaz de inibir a proliferação de fungos que crescem sobre a superfície das suas folhas. O pesquisador tem disponível em seu laboratório uma biblioteca genômica, várias bibliotecas de cDNA, uma biblioteca de expressão dessa espécie de planta e a proteína purificada. O pesquisador encontrará mais rapidamente o gene desejado se:
	
	
	
	seqüenciar o DNA da biblioteca de cDNA e pesquisar os quadros de leitura.
	
	
	seqüenciar o DNA da biblioteca genômica e procurar os ESTs.
	
	
	clonar o cDNA da espécie e com ele triar a biblioteca genômica.
	
	
	seqüenciar os aminoácidos das proteínas produzidas na biblioteca de expressão até identificar a proteína desejada.
	
	
	produzir um anticorpo específico para essa proteína e com ele triar a biblioteca de expressão.
	
Explicação:
Aula 5, retornar em sequenciamento.
F
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