Técnicas de análise em genômica

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6/16/22, 9:37 PM Avaliação II - Individual
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GABARITO | Avaliação II - Individual (Cod.:739225)
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Prova 48973207
Qtd. de Questões 10
Acertos/Erros 10/0
Nota 10,00
No processo de digestão in gel, os spots contendo as proteínas de interesse são submetidos a um 
processo de hidrólise química e enzimática, formando fragmentos proteicos menores, capazes de 
migrar pela malha do gel e se difundir no sobrenadante, formando a amostra que será analisada por 
espectrometria de massas. De acordo com a digestão in gel, classifique V para as sentenças 
verdadeiras e F para as falsas: 
( ) As proteínas são apenas separadas de acordo com sua massa molecular, embora, nesse caso, as 
bandas obtidas do gel representem populações de proteínas com massas similares. 
( ) A análise no espectrômetro de massas necessita que a carga líquida se torne negativa, ou seja, o 
processo de ionização não é necessário. 
( ) A cromatografia líquida é utilizada como método de fracionamento, em que os peptídeos 
presentes na amostra são dissolvidos em uma fase líquida, bombeadas para passar por uma fase 
estacionária e direcionadas para espectrometria de massas. 
( ) As amostras podem ser submetidas a outro fracionamento prévio à análise por MS, com o 
objetivo de reduzir a complexidade da amostra ou apenas complementar o fracionamento já realizado 
na eletroforese. 
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A F - F - V - F.
B V - V - F - V.
C V - F - V - V.
D V - F - F - V.
Durante o Projeto Genoma Humano, duas grandes frentes de trabalho independentes foram 
organizadas, uma formada por cerca de 5.000 cientistas em um consórcio público e a segunda por 
meio da iniciativa privada da empresa Celera Genomics, cujo objetivo era patentear os genes 
sequenciados. Com base nas técnicas utilizadas para o sequenciamento, analise as sentenças a seguir: 
I- O shotgun hierárquico sequenciava através da fragmentação do DNA total, que era clonado a partir 
de diferentes tamanhos de fragmentos de 2 mil, 10 mil e 130 mil pares de base. 
II- O shotgun de genoma inteiro formava três bibliotecas de DNA, com diferentes tamanhos de 
fragmentos. 
III- O shotgun hierárquico utilizava como vetor plasmídeos bacterianos comuns, a fim de sequenciar 
diferentes tamanhos de fragmentos do genoma completo. 
Assinale a alternativa CORRETA:
A Somente a sentença II está correta.
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B As sentenças I e II estão corretas.
C As sentenças I e III estão corretas.
D Somente a sentença III está correta.
Os polimorfismos podem ser diferentes tipos, como polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) 
ou polimorfismos promovidos por inserções ou deleções no DNA, chamadas de polimorfismos indel, 
os quais podem ser do tipo polimorfismo no número de cópias (CNP), polimorfismo repetido em 
tandem curta (STRP) ou polimorfismo de repetição em tandem de número variável (VNTR). Sobre os 
polimorfismos, assinale a alternativa CORRETA:
A O polimorfismo de nucleotídeo único ocorre em um único nucleotídeo.
B As técnicas de PCR e sequenciamento pelo método Sanger conseguem identificar qualquer
polimorfismo.
C O polimorfismo STRP é conhecido como repetição em tandem de número variável, também
denominado como DNA minissatélite, com cerca de milhares de nucleotídeos.
D O polimorfismo VNTR ou DNA microssatélites são difíceis de ser sequenciados, tendo
sequências curtas de DNA, com 10 a 100 nucleotídeos.
As regiões responsáveis por codificar ou regular o DNA são conservadas entre as espécies, 
permitindo driblar um dos grandes desafios do Projeto Genoma Humano, ou seja, a interpretação dos 
dados, já que grande parte dessa informação era não codificadora. Sobre as sequências codificadoras 
e reguladoras de DNA, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas: 
I- Uma estratégia utilizada para conhecer as sequências codificadoras do genoma humano é baseada 
na comparação com outras espécies que sejam evolutivamente relacionadas aos seres humanos, como 
os camundongos, por exemplo. 
PORQUE 
II- A partir da estratégia é possível definir quais regiões são não codificadoras entre as duas espécies, 
indicando que essas regiões estiveram menos sujeitas a mutações ao longo do processo evolutivo. 
Assinale a alternativa CORRETA:
A As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
B As asserções I e II são proposições falsas.
C A asserção I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa.
D As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
A genômica estrutural é o estudo da estrutura propriamente dita do genoma, sendo seu principal 
objetivo atrelado à possibilidade de manipulação de fragmentos do DNA ou de seus genes in loco. 
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Sobre a genômica estrutural, associe os itens, utilizando o código a seguir: 
I- Mapas cromossômicos de alta resolução. 
II- Mapas cromossômicos de baixa resolução. 
III- Mapas cromossômicos físicos. 
( ) A primeira etapa se baseia na ocorrência de um alelo que não esteja presente no mapa 
cromossômico, em uma região com marcadores já mapeados. Dessa forma, pode-se definir em qual 
cromossomo aquele novo alelo ocorre. 
( ) A segunda etapa determina a posição dos genes dentro de cada cromossomo, fornecendo 
informações mais precisas sobre esses gene e marcadores no genoma. 
( ) A terceira etapa aplica diferentes técnicas determinando um mapa físico do genoma e ocorre o 
sequenciamento. 
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A I - III - II.
B I - II - III.
C II - I - III.
D III - II - I.
A interação entre proteínas e o DNA é de extrema importância na genômica funcional, 
especialmente pelo fato de que diversas proteínas são reguladoras da expressão gênica. Com base nas 
técnicas utilizadas para identificar os locais de interação, classifique V para as sentenças verdadeiras 
e F para as falsas: 
( ) A MNase (nuclease microcócica), uma nuclease específica, capaz de clivar o DNA em pequenos 
fragmentos, é modificada com a adição de uma proteína, a proteína A (pA) no sequenciamento CUT 
& RUN. 
( ) A MNase modificada com a pA forma regiões de interação entre a proteína e o DNA que podem 
ser imunoprecipitadas, formando uma amostra rica de precipitados de regiões de interação da 
proteína de interesse com o DNA. 
( ) No sequenciamento ChIP, a proteína de interesse é reticulada ao DNA, ou seja, são formadas 
ligações covalentes entre a proteína e o DNA por meio da adição de anticorpos específicos para essa 
proteína. 
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A F - V - F.
B F - F - V.
C V - F - V.
D V - V - F.
Os polimorfismos genéticos têm se mostrado uma importante descoberta, o que despertou um 
grande interesse no mapeamento desse tipo de variação, bem como no estudo das associações 
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genótipo-fenótipo em que elas possam estar envolvidas. Sobre os polimorfismos, associe os itens, 
utilizando o código a seguir: 
I- Polimorfismos de nucleotídeo único (SNP). 
II- Polimorfismo no número de cópias (CNP). 
III- Polimorfismo repetido em tandem curta (STRP). 
IV- Polimorfismo de repetição em tandem de número variável (VNTR). 
( ) O polimorfismo ocorre em apenas um nucleotídeo. 
( ) É caracterizado por sequências curtas de DNA, entre 2 e 4 nucleotídeos, que podem estar 
repetidas (em tandem) até algumas dezenas de vezes, sendo essas sequências chamadas de 
microssatélites 
( ) Esse tipo de polimorfismo pode ser resumido como uma variação no número de cópias de 
segmentos relativamente extensos do DNA, entre 200 pb até cerca de 2 Mb, os quais podem estar 
ausentes ou presentes em um determinado alelo ou podem estar presentes em variados números de 
cópias em tandem em cada um dos alelos, representando uma vasta gamade alelos possíveis com 
esse tipo de variação. 
( ) Os DNA minissatélites são formados por sequências com cerca de 10 até 100 nucleotídeos 
repetidos em tandem por centenas a milhares de vezes. 
Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA:
A III - IV - II - I.
B I - III - II - IV.
C I - II - III - IV.
D IV - II - I - III.
Conhecendo estes conceitos básicos e sabendo que o processo de recombinação gênica que 
acontece na meiose é um processo ordenado em eucariotos, é possível inferir a frequência em que 
essa recombinação ocorre para cada um dos genes e, assim, determinar sua posição relativa no 
cromossomo. Sobre a recombinação cromossômica, avalie as asserções a seguir e a relação proposta 
entre elas: 
I- Genes heterozigotos não geram nova conformação de alelo, uma vez que ambos os alelos são 
iguais. 
PORQUE 
II- Genes homozigotos apresentam dois genes que podem se apresentar como dominantes ou 
recessivos. 
Assinale a alternativa CORRETA:
A A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
B As asserções I e II são proposições falsas.
C As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
D As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I.
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A determinação da região de um gene no cromossomo pode ser realizada pela técnica de 
eletroforese em gel de campo pulsado. Sobre essa técnica, assinale a alternativa CORRETA:
A Essa técnica identifica a presença ou não de DNA na amostra, não sendo possível indicar sua
localização.
B O campo pulsado se deve à correte elétrica comum aplicada à eletroforese em gel.
C O campo pulsado se deve à corrente elétrica que se alterna perpendicularmente ao gel.
D Essa técnica é utilizada para detecção de grandes cromossomos somente, pois os pequenos
cromossomos não conseguem ser isolados nas bandas do gel.
O proteoma representa todo o conjunto de proteínas expressas em determinado momento, em 
um determinado organismo, tecido, célula ou até mesmo em bio-fluídos, como plasma ou muco. 
Através desta avaliação, é possível conhecer as proteínas que compõem esse proteoma, bem como 
processos biológicos em que elas possam estar envolvidas. Com base na avaliação de proteínas, 
analise as sentenças a seguir: 
I- O método 2D-DIGE (eletroforese de fluorescência diferencial em gel 2D) tornou possível a 
avaliação concomitante das proteínas presentes em duas ou mais amostras, executando as corridas no 
mesmo gel. 
II- O método clássico para a avaliação de proteínas consiste na aplicação da técnica de eletroforese 
bidimensional em gel de acrilamida (2DE), o qual se aplica para a análise da expressão diferencial 
das proteínas entre duas amostras distintas. 
III- Os métodos 2DE e 2D-DIGE são muito eficientes e são capazes de identificar a sequência de 
aminoácidos que compõem uma proteína. 
Assinale a alternativa CORRETA:
A As sentenças I e III estão corretas.
B Somente a sentença II está correta.
C Somente a sentença I está correta.
D As sentenças I e II estão corretas.
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