OMICS

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OMICS
Splicing alternativo: gera vários RNAs mensageiros a partir de um único gene
Como eu analiso os RNAs mensageiros produzidos por um indivíduo? 
RT – POLYMERASE CHAIN REACTION / transcriptase reverse
Técnica: a partir de um RNA > consiga dar origem a uma molécula cDNA > fazer a análise do PCR
E para analisar o transcriptoma eu preciso trabalhar com a sequência transcrita, ou seja, apenas a sequência de éxons do gene! 
NÃO POSSO DESENHAR PRIMERS PARA AS SEQUÊNCIAS INTRÔNICAS!!!!!!!!!!!
Proteômica
Ciências que estuda os compostos complexos do nosso organismo, focado na área das proteínas. 
As proteínas são a última etapa do processo da expressão genica. Ou seja, para que eu produza a proteína é necessário o processo de tradução e transcrição, se houver qualquer falha nesse processo há impacto direto na proteína. 
É possível avaliar presença e abundância de moléculas de mRNA e deste modo realizar inferências sobre a presença de proteínas. 
Os dados de mRNA dão indicação de presença de uma proteína, mas não dão nenhuma informação sobre a localização da proteína dentro da célula. 
PORQUE? 
Existem mecanismos pós-transcrionais e pós traducionais que podem afetar o nível de proteínas e que não são levados em conta quando medimos o nível de mRNAs. 
- Peptideo sinal 
- Micro-RNA 
- Proteólise
Genética x Genômica
Genética
- O estudo do conjunto completo de informações genéticas de um organismo
- O genoma inclui genes (codificação) e DNA não codificante
- Genoma: a informação genética completa de um organismo
Genoma 
- O estudo da hereditariedade
- O estudo da função e composição de genes individuais
- Gene: sequência específica de DNA que codifica uma molécula funcional
Resumidamente: genômica se propõe a fazer uma análise do material genético completo do indivíduo identificando os principais pontos desses conjuntos de informações genéticas e vão ter relações com certos fenótipos.
Transcripção
· O RNA pode sofrer splicing errado
· Pode não receber cap 5’
· Antes de receber calda poli A pode sofrer degradação
 
Se isso acontece o que acontece
Se você perde o RNA no caminho o RNAmensageiro não reflete em uma proteína, pois o RNA não é capaz de originar uma proteína 
Transcriptômica – Análise dos RNAs produzidos pelo processo de transcrição 
Em um organismo somente o genoma permanece constante, independente do estágio de desenvolvimento, tecido e ou condição ambiental
Diferentes estímulos podem afetar diretamente o trasncriptoma, o proteoma e o metaboloma. 
Existem metodologias utilizando espectrometria de massa que permitem a identificação de sequências proteicas a partir da medida de sua massa 
A conjunção desta metodologia com técnicas 
de separação de proteínas permitem o estudo do conteúdo proteico de um organismo, constituindo assim a chamada proteomica 
Técnicas de fracionamento celular permitem que diferentes porções da célula sejam separadas e que seu conteúdo seja determinado
Espectrometria: extração da proteína, digestão de proteínas com enzimas de degradação, produzindo peptídeos que são separados por cromatografia liquida que separado
peptídeos pela carga elétrica e pelo tamanho (LC-MS/MS)
A partir dos dados experimentais das massas detectadas para os peptídeos é possível realizar analises comparando o espectro obtido com os espectros teóricos de proteínas depositadas em bancos de dados
 Genomica (GENES) > Transcriptômica (RNA)> Proteômica (Proteínas) > Metabolômica (metabolitos) = Biologia Sistêmica