SIMULADO - BIOINFORMÁTICA

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Disc.: BIOINFORMÁTICA 
 
Acertos: 9,0 de 10,0 03/2023 
 
 
 
1a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
A bioinformática ou biocomputação associa conhecimentos em distintas áreas do 
conhecimento a fim de decifrar o código genético contido nas biomoléculas pelo 
estabelecimento de modelos lógico-matemáticos e estatísticos. Tais estratégias têm 
assegurado a interpretação e elucidação de eventos biológicos gerados a partir do 
sequenciamento de genes e proteínas. Bancos de dados de informações biológicas cada 
vez mais crescentes, o desenvolvimento de novas abordagens para análise e 
apresentação desses dados e a investigação de novas e complexas perguntas são as 
forças motrizes da bioinformática. A partir do advento dos projetos genomas, 
biologistas moleculares passam a empregar ferramentas computacionais capazes de 
analisar grandes quantidades de dados biológicos, a predizer funções dos genes e a 
demonstrar relações entre genes e proteínas. A internet e sua capacidade de 
compartilhar dados, além do desenvolvimento de processadores mais rápidos e com 
maior memória, desempenharam um papel decisivo para a consolidação da 
bioinformática como potencial campo do conhecimento científico. A partir disso, 
diferentes técnicas foram criadas permitindo o reconhecimento da genética atual. Sobre 
as técnicas da bioinformática analise a relação entre as afirmativas a seguir: 
I. A modelagem molecular é a técnica capaz de utilizar um modelo de ajuste induzido, a 
partir de uma simulação molecular. 
PORQUE 
II. Visa mimetizar um ambiente o mais próximo possível do real e com isso obter 
diversas informações sobre a interação entre uma proteína e o receptor. 
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: 
 
 
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. 
 As asserções I e II são proposições falsas. 
 
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira. 
 
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I. 
 
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma 
justificativa da I. 
Respondido em 15/03/2023 16:03:37 
 
Explicação: 
A dinâmica molecular é a técnica capaz de utilizar um modelo de ajusto induzido, a partir de 
uma simulação molecular, onde um sistema é inserido em uma caixa com água visando 
mimetizar um ambiente o mais próximo possível do real e com isso obter diversas informações 
sobre a interação entre um ligante e o receptor. A modelagem molecular visa achar proteínas 
moldes. 
 
 
2a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
(adaptada de IBADE - 2018 - Prefeitura de Presidente Kennedy - ES - Biólogo ) As 
informações genéticas nos seres vivos são codificadas por bases nitrogenadas que 
constituem os ácidos nucléicos. Analise as sequências de nucleotídeos a seguir. 
Fita 1 - CCCTATACGCTAGCATGACTT 
Fita 2 - GGGATATGCGATCGTACTGAA 
A seguir são listadas algumas características sobre as fitas de nucleotídeo 1 e 2. 
Assinale a alternativa correta: 
 
 As fitas 1 e 2 são complementares, formando juntas um segmento do DNA. 
 
As fitas analisadas constituem um segmento de uma molécula de RNA. 
 
Se considerarmos a fita 1 como a fila molde, o RNAm formado por esta 
sequência apresentará as mesmas bases nitrogenadas da fita 2. 
 
Na fita 1 e 2 existem 21 códons e 07 nucleotídeos 
 
Na fita 1 existem 30 códons e 15 nucleotídeos. 
Respondido em 15/03/2023 16:04:16 
 
Explicação: 
Tanto a sequência de nucleotídeos 1 e 2 apresentam 21 nucleotídeos e 7 códons (um códon 
equivale a 3 nucleotídeos). Como ambas as fitas apresentam as bases C, G, A e T elas são 
representativas do DNA e não do RNA. Para ser uma fita de RNA deveria apresentar as bases C, 
G, A e U. Além disso, se observarmos as fitas vemos que 1 e 2 são complementares, ou seja, no 
lugar que temos uma base C na outra fita equivale a G, e no lugar que temos uma base A na 
outra fita equivale a t e vice-versa, representando as duas fitas de DNA, que são 
complementares entre si. 
 
 
3a 
 Questão 
Acerto: 0,0 / 1,0 
 
A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que apresenta diferentes 
aplicabilidades e tem sido bastante empregada para o desenvolvimento de novas 
metodologias de análise e garantindo diferentes avanços científicos. Durante o 
desenvolvimento do seu trabalho de conclusão de curso você estuda todas as possíveis 
interações entre a proteína S do coronavírus (receptor) e possíveis moléculas (ligantes) 
que serão empregadas em estudos clínicos para o tratamento da doença em um modelo 
chave-fechadura. Qual é essa técnica? 
 
 
Dinâmica molecular 
 
Alinhamento molecular 
 Ancoramento molecular 
 
Modelagem molecular 
 QSAR 
Respondido em 15/03/2023 16:05:05 
 
Explicação: 
O ancoramento molecular utiliza o modelo chave-fechadura, pois a variável tempo não é levada 
em consideração. Durante a análise, é fornecida uma pontuação de um ancoramento que 
significa que aquele algoritmo encontrou uma interação favorável dentro dos seus parâmetros, 
não é possível extrapolar que isso signifique uma melhor interação entre ligante e receptor, a 
pontuação é apenas um indicador. O alinhamento molecular visa identificar genes que 
compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também usar o alinhamento 
para encontrar proteínas moldes, durante a etapa de modelagem molecular. O ancoramento 
molecular infere a modelagem molecular, para construir um modelo tridimensional e é utilizado 
para obter uma pose do ligante com o alvo e a dinâmica molecular para analisar como as 
interações acontecem, mimetizando o organismo. O QSAR é uma técnica estatística de 
tratamento de dados a partir de descritores, visa buscar uma equação que quando resolvida 
tenta prever a atividade de uma molécula nova contra determinado receptor. 
 
 
4a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Julgue as afirmativas a seguir sobre a ferramenta BLAST, usada para alinhamento de 
sequências e disponível no portal do NCBI. 
I. Muito usada para sequências com apenas alguns trechos/locais conservados. 
II. Importante utilizá-la quando duas sequências têm tamanhos próximos, pois toda 
extensão da sequência será comparada. 
III. O alinhamento é feito par a par, comparando apenas duas sequências por vez. 
IV. Usada para busca em banco de dados de sequências. 
É correto o que se afirma em: 
 
 
II e IV. 
 
I e II. 
 I, III e IV. 
 
II, III e IV. 
 
II e III. 
Respondido em 15/03/2023 16:06:22 
 
Explicação: 
O BLAST é uma ferramenta utilizada para o alinhamento de sequências simples (duas 
sequências) e local (comparadas regiões de maior similaridade). É indicado para sequências 
mais divergentes e com tamanhos distintos. O BLAST é aplicado em vários bancos de dados de 
sequência de nucleotídeos ou aminoácidos como uma ferramenta de busca. 
 
 
5a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Durante um noticiário na televisão que falava sobre notícias na área de ciência e 
tecnologia, o repórter citou o termo NCBI. Dona Rosângela, curiosa, perguntou a seu 
neto o significado daquele termo. Qual seria a resposta correta que o neto de Dona 
Rosângela deveria dar? 
 
 
O NCBI é um programa on-line para o desenho de primers. 
 
O NCBI se trata apenas de um banco de dados de artigos científicos da área 
biomédica. 
 
O NCBI é uma ferramenta usada para o alinhamento de sequências biológicas. 
 O NCBI é um portal que apresenta bancos de dados e ferramentas 
importantes para a área biotecnológica. 
 
O NCBI é um banco de dados de sequências de nucleotídeos curadas e sem 
redundância. 
Respondido em 15/03/2023 16:07:52 
 
Explicação: 
O NCBI (Centro Nacional para Informação Biotecnológica) é uma organização que controla o 
portal mais famoso da bioinformática. Dentro desse portal, estão disponíveis diferentes bancos 
de dados biológicos e ferramentas para analisá-los. O NCBI se propõe a reunir o resultado 
do trabalho de pesquisadores ao redordo mundo em um só lugar, facilitando o acesso e 
manipulação desses registros. Essa iniciativa impulsiona o avanço do conhecimento na área 
biotecnológica. Dentro do NCBI, temos o GenBank e PubMed, que são bancos de dados 
disponíveis no portal do NCBI, mas esse não é o único propósito desse portal. A ferramenta 
BLAST, usada para o alinhamento de sequências, também está implementada nesse portal. 
 
 
6a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Em uma análise utilizando a PCR, Lucas encontrou como resultado a amplificação de 
várias regiões diferentes do DNA das amostras analisadas. O que ele esperava era 
encontrar apenas uma região amplificada, somente nas amostras positivas. Para 
solucionar o problema, seu chefe sugeriu, então, que ele desenhasse um novo par 
de primers e prestasse atenção no comprimento em nucleotídeos, para melhorar a 
especificidade. Você diria para Lucas desenhar um novo par de primers com um 
comprimento maior ou menor que o par de primers que ele havia usado primeiro? 
 
 
Menor, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na 
região alvo. 
 
Maior, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do 
genoma. 
 
Menor, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo 
do genoma. 
 
Igual, pois o comprimento não interfere na especificidade dos primers. 
 Maior, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na 
região alvo. 
Respondido em 15/03/2023 16:09:22 
 
Explicação: 
A especificidade de um primer garante que a região copiada seja realmente a que você deseja, e 
não outra qualquer. No caso exposto, houve amplificação de várias sequências não desejadas e, 
para melhorar a especificidade, faz-se necessário aumentar o número de nucleotídeos, pois 
quanto maior o comprimento de um primer, mais específico ele é. Sequências pequenas 
de primers podem ocorrer aleatoriamente ao longo do DNA, e não somente na região de 
interesse. Quando você usa mais nucleotídeos, você específica melhor o alvo e permite que ele 
seja amplificado apenas na região desejada. 
 
 
7a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Julgue as afirmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados 
biológicos. 
I - Existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação 
disponível costuma ser diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas. 
II - Os bancos de dados biológicos só podem ser acessados mediante o pagamento de 
uma mensalidade pelo usuário. 
III - Quanto mais detalhado o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um 
banco, mais confiáveis eles são. 
 
 
As afirmativas I e II são proposições verdadeiras, enquanto a III é falsa. 
 
A afirmativa III é uma proposição verdadeira, enquanto I e II são proposições 
falsas. 
 
As afirmativas I, II e III são proposições verdadeiras. 
 As afirmativas I e III são proposições verdadeiras, e a II é uma proposição 
falsa. 
 
A afirmativa I é uma proposição verdadeira, e II e III são proposições falsa. 
Respondido em 15/03/2023 16:09:48 
 
Explicação: 
A maioria dos bancos de dados biológicos mais conhecidos e utilizados são aqueles cujo acesso é 
livre, isto é, qualquer um pode acessar e obter os dados armazenados. Eles são muito úteis para 
o compartilhamento de informações e verificação da veracidade de dados divulgados por 
cientistas. No entanto, existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de 
informação disponível costuma ser diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas, e 
quanto mais detalhado for o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, 
mais confiáveis eles são. 
 
 
8a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
(CESPE/UNB - INMETRO - 2010- Biotecnologia Molecular) 
Microarranjo é uma técnica empregada em biologia molecular que permite medir os níveis 
de expressão de transcritos em larga escala. Com relação a essa técnica, assinale a opção 
correta. 
 
 
A detecção é realizada por meio de eletroforese em gel de agarose. 
 
A técnica em questão é empregada em estudos proteômicos, visto que permite 
a identificação direta das proteínas expressas. 
 
As lâminas de vidro utilizadas são revestidas por moléculas de lipídios. 
 O microarranjo de DNA consiste em um arranjo predefinido de moléculas de 
DNA quimicamente ligadas a uma superfície sólida. 
 
A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas 
com brometo de etídio. 
Respondido em 15/03/2023 16:10:39 
 
Explicação: 
A técnica em questão é empregada em estudos transcriptômicos, visto que permite a 
identificação direta das RNAs expressas. Para a técnica, são utilizadas lâminas de vidro 
revestidas com sondas de DNA. A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de 
sondas marcadas com corantes fluorescentes. A detecção é realizada por meio de detecção da 
fluorescência. 
 
 
 
9a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
Durante uma análise cadeia Markoviana Monte Carlo (MCMC), o que determina 
quando uma cadeia se move da árvore atual para uma nova árvore? 
 
 A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade 
posterior maior do que o estado atual. 
 
A probabilidade de aceitar uma proposta depende da razão entre as 
probabilidades posteriores entre o estado atual e proposto. 
 
A cadeia Markoviana sempre aceitará uma proposta que seja consistente com 
a anterior. 
 
A cadeia Markoviana aceitará uma proposta com uma probabilidade que é 
fixada no início da pesquisa. 
 
A cadeia rejeitará uma proposta que produza uma probabilidade de log maior 
do que o estado atual. 
Respondido em 15/03/2023 16:11:31 
 
Explicação: 
Gabarito: A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior 
maior do que o estado atual. 
Justificativa: Uma geração MCMC sempre aceita o novo estado se a probabilidade, ou log, for 
maior que o estado atual. A geração MCMC não é calculada por uma razão, nem possui uma 
probabilidade fixada de início. Na cadeia Markoviana, o novo estado é sempre aceito quando 
possui melhor probabilidade. As vezes a cadeia Markoviana Monte Carlo pode aceitar um ponto 
pior do que o anterior. Isso ocorre raramente. 
 
 
10a 
 Questão 
Acerto: 1,0 / 1,0 
 
A árvore filogenética é uma hipótese sobre relações evolutivas, mas para construir 
precisamos usar características que sejam indicadores confiáveis de ancestralidade 
comum. Nesse contexto utilizamos para construção das árvores as características 
homólogas. A seguir estão listadas algumas propriedades das características ditas 
homólogas. Analise a alternativa que NÃO se refere a essa característica: 
 
 Linhagens diferentes com traços similares 
 
Desenvolvimento similar 
 
Estrutura e composição similar 
 
Ponto de origem em local similar 
 
Funções similares 
Respondido em 15/03/2023 16:12:25 
 
Explicação: 
Gabarito: Linhagens diferentes com traços similares 
Justificativa: A homologia é o estudo das semelhanças entre a estrutura de diferentes 
organismos que apresentam. Dois caracteres são ditos homólogos quando apresentam a posição 
(ponto) de origem, estrutura, composição, desenvolvimento e função similares. A homologia é 
observada em caracteres, e não em linhagens, por isso que diferentes linhagens com traços 
similares não podem ser classificadas como homólogas.