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Universidade de São Paulo Escola de Engenharia de Lorena Departamento de Biotecnologia Curso Engenharia Química Disciplina Bioquimica [LOT 2004] Aula 1: Metabolismo Prof. Anuj Kumar Conteúdo Conceitos básicos de metabolismo Metabolismo da glicose Glicolise Energia solar é fonte de toda a energia biológica Conversão de Energia Luminosa em Energia Química Fotossíntese: Captura e colhendo da Energia Luminosa Obtemos alimentos através do processo de fotossíntese O funcionamento do cérebro está diretamente relacionado ao metabolismo Metabolismo celular O metabolismo celular é o conjunto de reações químicas que ocorrem nos organismos vivos para manter a vida. O metabolismo celular envolve sequências complexas de reações bioquímicas controladas, mais conhecidas como vias metabólicas. Interação entre proteínas Mais de 30.000 proteínas Diferente Costanzo, Baryshnikova, et al., The Genetic Landscape of a Cell. Science, 2010 Metabolismo celular ‹#› Etanol Antibióticos Queijos, Pães, Vinhos, Iogurtes Metabolismo Celular Produtos do Metabolismo: Interesse industrial Microrganismos para muitos produtos de interesse comercial por metabolismo. Aqui estão alguns exemplos. ‹#› Soma de todas as reações químicas na célula: Obter energia Converter moléculas Polimerização de macromoléculas O que é o metabolismo? ‹#› Fatos da Vida: Princípios da Termodinâmica nas Reações Bioquímicas Equação de Gibbs A célula: Sistema isotérmico: Temp. e pressão constante. Trocam matéria e energia com o ambiente Moléculas mais organizadas Necessitam de fonte de energia livre Termodinâmica +Os processos metabólicos são reações químicas e geralmente envolvem geração de calor. +Organismos vivos, no entanto, não seguem todas as leis da termodinâmica. +Organismos são sistemas abertos que trocam matéria e energia com o ambiente. ... +Em termos termodinâmicos, o metabolismo mantém o equilíbrio. ‹#› Exergônica Equillíbrio Endergônica Reações Acopladas +Na reação exergônica, a energia livre de Gibbs é menor que zero. +Na reação endergônica, a energia livre de Gibbs é maior que zero +No estado de equilíbrio, a energia livre de Gibbs é igual a zero ‹#› Exemplos de reações exergônicas e endergônicas +Nas reações exergônicas, a energia é liberada. +Nas reações endergônicas, a energia é absorvida. +É necessária energia externa para fazer a reação acontecer. ‹#› NADH ATP NAD+ ADP Conexão entre Catabolismo e Anabolismo Sintese de ATP Conexão entre Catabolismo e Anabolismo ‹#› Moeda de energia ATP = $ NADH = FADH2 = Energia Adenosina trifosfato (ATP): Principal moeda energética das células ATP -> ADP + Pi Moléculas Carreadoras Ativadas: ATP ‹#› Hidrólise de ATP Três posições de possível hidrólise do ATP ‹#› ATP Hydrolysis Estabilidade: Velocidade de reação lenta Maior reserva de energia: Energia nas ligações Porque o Fosfato e não os outros? NAD+/ NADH (Carrega de um próton e dois elétrons ricos em energia) OXIDADO NADH REDUZIDO NAD+ H++ 2e NAD+/NADH - Nicotinamida adenina Adenosina fosfato Dinucleótido de nicotinamida e adenina ‹#› Redox reactions involve the transfer of electrons from one molecule to the other. uma coenzima que apresenta dois estados de oxidação: NAD+ (oxidado) e NADH (reduzido) +Reduction is when a molecule gains electrons. [Redução é quando uma molécula ganha elétrons]. +Oxidation is when a molecule loses electrons. [Oxidação é quando uma molécula perde elétrons.] NAD+/ NADH (Carrega de um próton e dois elétrons ricos em energia) NAD+/NADH - Nicotinamida adenina ‹#› +O dinucleotídeo de flavina adenina (FAD) é uma coenzima redox ativa associada a várias proteínas, que está envolvida em várias reações enzimáticas importantes no metabolism +Mononucleotídeo de flavina (FMN) é uma proteína que contém um grupo de flavina +Em sistemas biológicos, o FAD atua como um aceitador de H+ e e- em sua forma totalmente oxidada e um doador na forma reduzida de FADH2. FMN, FAD e FADH2 FMN, FAD e FADH2 ‹#› Saccharomyces cerevisiae Cerca de 500 reações Metabolismo de Glicídios Glicólise Ciclo do Ácido Cítrico Fermentação Catabolismo de Carboidrato: Reação Principal do Metabolismo Principais vias de Utilização da Glicose Energia ATP ‹#› +Glucose is stored in the form of glycogen, sucrose, starch +Oxidation of glucose leads to formation of puruvic acid, which goes to TCA cycle and create energy +Oxidation of glucose via pentose phosphate pathway leads to formation of ribose-5-phosphate +Glucose is also goes for polymerization reaction making plant cell wall polysaccharide or exopolysaccharide by some microorganisms. Principais vias de Utilização da Glicose Respiração Celular Fase aeróbica do catabolismo Captação de O2 e eliminação de CO2 Glicose + O2 CO2 + H2O Respiração Celular x Combustão Combustão Completa: Combustível + O2 CO2 + H2O ‹#› Metabolismo Aeróbico Estágio 1: Produção de acetil-CoA Estágio 2: Ciclo do Ácido Cítrico Estágio 3: Fosforilação Oxidativa Muito Importante!!! Via da Glicólise (via EMP) Embden-Meyerhof-Parnas (EMP) pathway Investimento Energético: Glicose => Gliceraldeído 3 Fosfato e Dihidrocicetona fosfato Glicólise – Fase preparatória Perda de 2 ATP Glicólise – Fase preparatória Gliceraldeído 3 fosfato e Diidrocicetona são moléculas de 3 carbonos, triose. ‹#› Glicólise – Fase preparatória Hidrólise Frutose 1,6 Bifosfato => Gliceraldeído 3 Fosfato e Dihidrocicetona fosfato Geração de energia. Gliceraldeído 3 Fosfato => 2 Piruvato Glicólise – Fase Compensatória Ganho de 4 ATP +2 NADH Cada molécula de Glicose, 2 ATPs são hidrolizados, mas 4 ATPs são produzidos. Ganho de 2 ATPs. Embora não tenha participação de Oxigênio, ocorrem reações de oxidação de NAD. Dois molecule da H2O liberada na equação da glicólise ‹#› Glicólise Reação Geral da Glicólise: Glicose + 2NAD+ + 2ADP + 2Pi 2 Piruvato + 2NADH + 2H+ + 2ATP + 2H2O Rendimento Líquido: 2 ATP +2 NADH (-32,1 kcal mol-1 de glicose consumida) In Glycolysis, 1 molecule of glucose give 2 piruvato, 2 ATP, 2 NADH and 2 H2O molecule. ‹#› Oxidação da Glicose: Vias Principais Leveduras Anaeróbio facultativo Lactobacilos Anaeróbio facultativo Fermentação Lática Piruvato + NADH + H+ Lactato + NAD+ Piruvato é o receptor final de elétrons Redução do piruvato a lactato ‹#› Fermentação Alcólica Piruvato + NADH + H+ Etanol + NAD+ Piruvato é o receptor final de elétrons. TPP – pirofosfato de timaina (vitamina B1). Acetaldeído é tóxico! ‹#› Fábricas Químicas Fermentação no processo Industrial Clotrisdium acetobutyricum Butanol Fermentação Acetona Amido Produtos de Fermentação Ácido Fórmico Ácido Acético Alcoóis Glicerol Metanol Isopropanol
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