Cópia de ED biomol docx - Documentos Google

Prévia do material em texto

ESTUDO DIRIGIDO – BIOLOGIA MOLECULAR DA CÉLULA 
 1-Quais as principais diferenças estruturais entre as moléculas de DNA e RNA? 
 A principal diferença entre esses dois ácidos nucléicos é que o DNA é o 
 responsável pelo armazenamento da informação genética utilizada no 
 desenvolvimento dos organismos vivos, enquanto o RNA é o responsável por sintetizar 
 proteínas. Além disso, o DNA é formado por uma desoxirribose e pelas bases 
 nitrogenadas A,T, G e C. Enquanto o RNA é formado por uma ribose e pelas bases 
 nitrogenadas A, U, G, C. O. O RNA tem fita simples e o DNA tem fita dupla. A 
 estabilidade química do DNA é maior que a do RNA, dessa maneira o DNA é mais 
 resistente as reações de hidrolise do que o RNA. 
 O DNA é encontrado no núcleo de uma célula. Existe também o DNA mitocondrial, 
 que se encontra na mitocôndria. E o RNA Varia de acordo com o tipo de RNA, podendo 
 ser encontrado no núcleo de uma célula, no citoplasma e no ribossomo. O DNA é 
 auto-replicante e o RNA é sintetizado a partir do DNA. 
 2- As enzimas RNAs polimerases são responsáveis pela transcrição gênica, ou seja, pela 
 síntese de moléculas de RNA com base na informação contida nos genes. Entretanto, 
 apesar de serem capazes de sintetizar longas moléculas de RNA, as RNAs polimerases 
 são incapazes de reconhecer de forma autônoma quais genes devem ser transcritos. 
 Como é possível que as RNAs polimerases encontrem os genes que devem ser 
 transcritos? 
 Quando as RNA polimerases se ligam no DNA, elas procuram regiões chamadas de 
 promotores. Para que isso aconteça, ela necessita das proteínas conhecidas como fatores 
 de transcrição. Essas regiões contêm a sequência exata de aminoácidos que indicam que 
 naquele fragmento deve começar a síntese de RNA. 
 3- O que são promotores gênicos? 
 Os promotores gênicos são regiões que garantem que apenas segmentos de DNA que 
 contêm gene sejam transcritos em RNA, ou seja, essa região tem a quantidade exata de 
 nucleotídeos necessários para indicarem onde deve começar a síntese do RNA. O 
 promotor tem as informações que determinam as condições sobre as quais os genes 
 devem ser transcritos. Os promotores são reconhecidos pelas proteínas conhecidas como 
 fatores de transcrição. 
 4-O que são fatores de transcrição? 
 Os fatores de transcrição são proteínas que se ligam aos promotores do DNA, 
 caracterizando então o local de início da transcrição, e recrutam a RNA polimerase II 
 para esses sítios. TATA BOX, TFIID 
 5- Quais a principais etapas do processamento bioquímico do pré-mRNA em 
 eucariotos? 
 O capeamento da extremidade 5’ fosfato com a adição do grupo metil 
 (7-metilguanosina) e a poliadenilação na extremidade 3’ OH com a adição de uma 
 sequência de adeninas e splicing. 
 6- “Há 15 anos, Projeto Genoma mapeava código genético humano” 
 “Há 15 anos, uma empresa norte-americana anunciava ter conseguido, pela primeira 
 vez, estabelecer a sequência do genoma humano. O genoma humano é o código 
 genético do homem, ou seja, o conjunto dos genes onde está toda a informação para 
 construção e funcionamento do organismo” (http://radioagencianacional.ebc.com.br/ 
 pesquisa-e-inovacao/audio/2015-04/ha-15-anos-projeto-genoma-mapeava-codigo-gene 
 tico-humano). 
 A notícia acima foi retirada de um site de notícias da internet e contém um erro com 
 relação a um dos termos mais importantes da biologia molecular. Aponte e corrija esse 
 erro¹ 
 O genoma e o código genético não configuram a mesma coisa. O genoma é a serie 
 completa de informações do DNA de um organismo, contendo inclusive as informações 
 intergênicas; enquanto o código genético é um conjunto de regras que devem ser 
 seguidas para que haja a tradução do RNAm em proteína. 
 7- O que significa dizer que o ribossomo funciona como uma ribozima? 
 Quer dizer que ele possui uma atividade catalítica. No caso, os RNAr tem função 
 catalítica na formação de ligações polipeptídicas. 
 8- Um ribossomo possui três sítios (ou cavidades) internos importantes para a leitura do 
 mRNA e a síntese proteica. Como chamamos esses três sítios e o que ocorre em cada 
 um deles? 
 Os sítios são: A, P e E. O sítio A é sítio de entrada, onde o anticódon do RNAt se pareia 
 com o códon do RNAm. Eles chegam nesse sítio como amnoacil- tRNA. No sítio P 
 ocorre a ligação peptídica do aminoácido do RNAt que se ligou ao sítio A. O sítio E é o 
 sítio de desligamento do RNAt, que já está descarregado. Esse sítio é também 
 chamado de sítio exit, sítio de saída. 
 9-O que significa dizer quer a replicação do DNA é um processo semi-conservativo? 
 Quando ocorre a replicação do DNA, uma das fitas do DNA é oriunda da fita 
 original. No caso, cada fita parental serve como molde para a síntese de uma nova 
 fita-filha. 
 10- Sabemos que as enzimas DNA polimerases requerem a presença de uma 
 extremidade 3´ OH livre de um nucleotídeo corretamente pareado com a fita molde para 
 poderem atuar. Assim as polimerases do DNA não conseguem iniciar uma síntese de 
 novo de DNA, ou seja, não conseguem adicionar um primeiro nucleotídeo sobre uma 
 cadeia molde de DNA. Então, como esse problema é solucionado no processo de 
 replicação do DNA? 
 O problema é solucionado com os fragmentos de Okasaki, que são sintetizados como 
 pedaços curtos e descontínuos de DNA, no sentido inverso ao sentido da forquilha de 
 replicação. Esses pequenos pedaços são ligados pela DNA ligase, dando origem a uma 
 nova fita intacta. 
 11- Qual a função da enzima DNA ligase durante a replicação do DNA? 
 Elas unem os fragmentos de Okasaki da fita descontínua de DNA, dando origem a uma 
 nova fita. 
 12- O que são e como são gerados os fragmentos de Okasaki? 
 São fragmentos de DNA de cadeia simples, que são formados no momento da 
 replicação do DNA. Podem receber também o nome de “cadeia retardada”. Sua 
 formação tem início com a RNA primase, que cria pequenos primers no sentido 3’ – 5’ 
 e dessa forma a DNA polimerase pode sintetizar os pequenos fragmentos de DNA. 
 Após isso, a exonuclease 5’ faz a retirada dos primers enquanto a DNA ligase une esses 
 fragmentos de DNA. 
 13- Descreva o papel da enzima telomerase na replicação do DNA eucariótico 
 A telomerase tem em seu interior uma fita de RNA que serve como molde para a 
 extensão dos telômeros. Essa enzima faz uma transcrição inversa, pois a parte do molde 
 de RNA constrói um novo fragmento de DNA na extremidade do cromossomo. Sem a 
 telomerase, os cromossomos se tornam menores a cada ciclo de replicação, pois há a 
 perda do final da sequencia do cromossomo, que não conseguiria mais se replicar. 
 14-Descreva os principais componentes e a organização do envoltório nuclear: 
 Os principais componentes: as membranas nucleares e a lamina nuclear. A membrana 
 nuclear é uma bicamada lipídica com uma face interna e outra externa. A face interna é 
 revestida por cromatina e a externa possui polirribossomos inseridos em sua superfície, 
 além de ser contígua ao retículo endoplasmático.A membrana tem poros, organizados 
 pelos complexos do poro, que formam canais de transporte seletivo. Já a lamina nuclear 
 é uma camada deproteínas fibrosas, que formam uma sustentação, que serve também de 
 apoio para os cromossomos.Ela fica junto da membrana interna do núcleo. 
 15-Diferencie eucromatina de heterocromatina com relação à: (i) aspecto na 
 microscopia eletrônica, (ii) grau de empacotamento do DNA, (iii) acessibilidade do 
 DNA à transcrição gênica. 
 A EUCROMATINA na microscopia eletrônica é vista como regiões mais claras. O seu 
 grau de empacotamento é menor e a sua acessibilidade à transcrição gênica pelo DNA é 
 melhor. (eletronlúcidas) 
 A HETEROCROMATINA na microscopia eletrônica é vista como regiões mais escuras, 
 o seu grau de empacotamento é muito maior e por isso não há grande verificação de 
 transcrição nessa região, pois é mais densa e o material genético fica inacessível. 
 (eletrondensas) 
 16-Qual o papel das importinas e exportinas durante o transporte nucleocitoplasmático? 
 Elas são receptoras do transporte nuclear (CARIOFERINAS). As importinas que 
 transportam moléculas do citoplasma para o interior do núcleo, já as exportinas 
 exportam macromoléculas do núcleo para o citoplasma. As exportinas reconhecem o 
 NES e as importinas reconhecem o NLS. 
 17- Qual a função do nucléolo? Cite dois eventos que ocorrem no nucléolo? O Nucléolo 
 pode ser considerado heterocromatina? Justifique. 
 O nucléolo tem a função de produzir as subunidades que vão dar origem aos 
 ribossomos. No nucléolo ocorre a síntese de ribossomos e também o processamento do 
 RNAr. Não. Apesar de a região do nucléolo ser mais eletrondensa em relação ao núcleo, 
 o agregado é de RNAs e proteínas que vão transcrever os RNA ribossomais. Isso sem 
 levar em consideração que sua principal função está na síntese, montagem e maturação 
 dos ribossomos. 
 18-Construa uma sentença que contenha corretamente os seguintes termos: Ribossomo, 
 Retículo endoplasmático, SRP, Complexo Sec61, Sequencia sinal e Peptidase da 
 sequência sinal. 
 Os ribossomos presentes no retículo endoplasmático fazem a tradução das proteínas, 
 essas proteínas só podem ir para os seus respectivos endereçamentos apenas se tiverem 
 uma sequencia sinal. A SRP é quem vai reconhecer um sinal e travar a tradução para se 
 ligar ao ribossomo. Dessa maneira, a sequencia sinal é inserida em um canal de 
 membrana ou translocom, estes canais possuem três proteínas transmembranas 
 chamadas de Sec61. Quando há a saída da SRP, o transporte da proteína para dentro do 
 retículo endoplasmático se inicia, mas acaba acontecendo a peptidase da sequencia sinal 
 por meio de uma clivagem. 
 19. Cite duas funções celulares associadas as regiões lisas do retículo endoplasmático. 
 Síntese de lipídios e detoxificação 
 . 
 20-Qual a importância das vias de glicosilação de proteínas do tipo N e do Tipo O? 
 Descreva cada uma dessas formas de glicosilação de proteínas. 
 Glicosilação é o processo de adição de açúcares a proteínas e lipídios, formando 
 glicolipídios e glicoproteínas. A glicosilação é de grande importância porque uma 
 cadeia de acúcares é bem mais polar e rígida do que uma cadeia de aas. Uma 
 glicoproteína está muito mais protegida da ação de proteases do que uma proteína não 
 glicosilada, o que protege a membrana plasmática como um todo. As vias de 
 glicosilação protegem a proteína das ações enzimáticas e contribuem para o 
 enovelamento correto das mesmas, além de contribuir com o reconhecimento celular. 
 GLICOSILAÇÃO N: Inicia no RE, pois açucares começam a ser adicionados na cadeia 
 polipeptídica quando ela ainda está sendo sintetizada. O primeiro açúcar é adicionado 
 no aminoácido asparagina. O processo é co-traducional e termina no Complexo de 
 Golgi. 
 GLICOSILAÇÃO O: Ocorre no complexo de Golgi do inicio ao fim, quando a proteína 
 já está formada. O primeiro açúcar é adicionado a uma serina ou a uma treonina. 
 21- Qual a importância celular dos processos de glicosilação de proteínas? O que são 
 glicosil transferases e glicosidases? 
 A glicosilação é de grande importância porque uma cadeia de acúcares é bem mais polar 
 e rígida do que uma cadeia de aas. Uma glicoproteína está muito mais protegida da ação 
 de proteases do que uma proteína não glicosilada, o que protege a membrana plasmática 
 como um todo. As enzimas conhecidas como glicosidases são responsáveis pela 
 clivagem hidrolítica das ligações α ou β-glicosídicas, as quais unem dois açúcares 
 simples através de um átomo de oxigênio. Esta família de enzimas atua durante a 
 digestão na degradação dos oligossacarídeos e dos polissacarídeos provenientes da 
 alimentação, liberando as unidades monossacarídicas de carboidratos, as quais são 
 absorvidas e utilizadas pelo organismo como nutrientes. As glicosiltransferases são 
 enzimas responsáveis pela transferência de resíduos específicos de açúcar. Catalisa as 
 reações de transglicolização entre substrato aceptor e o açúcar receptor. 
 22- A Rede Trans do Complexo de Golgi (ou Trans Golgi Network - TGN) é uma das 
 regiões mais importantes das células eucarióticas. Cite dois eventos específicos que 
 ocorram na Rede Trans do Golgi. 
 No complexo de Golgi ocorre a fosforilação dos resíduos de manose na arvore glicídica 
 de hidrolases ácidas (enzimas lisossomais). Na rede Trans do Golgi, receptores de 
 manose-6-fosfato reconhecem o pedaço da glicoproteina e determina o brotamento de 
 vesículas contendo apenas as enzimas que serão encaminhadas aos lisossomos.