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Scalidophora (Kinoryncha; priapula; loricifera)
Sistema respiratório 
Nestes animais o sistema respiratório é pouco definido, onde temos o
Kinoryncha- fazendo trocas gasosas a partir de difusão através das paredes do corpo
Priapula- Se tem a presença de um pigmento respiratório hemeritrina nas células do fluido do corpo sugere um transporte de oxigênio ou função de estoque.
Loricifera- não apresentam troca de gases aparente
Sistema circulatório (apresentam hemocele)
Estes grupos não apresentam sistema circulatório, e a circulação se da nos:
Kin- será feita pela difusão através da cavidade corporal, que neste caso seria a hemocele
Pria- não apresenta sistema circulatório, seu transporte interno é feito por difusão e movimento do fluido da cavidade do corpo.
Lor- não apresenta sistema circulatório, ou circulação aparente
Sistema digestório (apresentam trato digestivo completo)
Todos estes grupos apresentam um trato digestivo completo, onde os
Kin- apresentam uma boca que conduz uma cavidade bucal localizada dentro do cone oral e dai uma faringe muscular, a cavidade bucal+ faringe+ esôfago estão revestidos por cutícula e representam um estomodeu, o esôfago vai se conectar a um trato digestivo médio, reto ou alongado, que leva a um curto trato digestivo posterior e o anus no último segmento.
Pria- o sistema digestivo deste grupo é completo e reto ou ligeiramente enrolado, eles também apresenta tubo bucal, faringe e esôfago revestidos por cutícula formando um estomodeu.
Lori- apresenta trato digestivo completo, canal bucal longo e tubular que conecta a boca a uma faringe muscular bulbosa e esôfago, anteriormente ao esôfago há um longo trato digestivo médio levando a um reto curto e revestido por cutícula, e o anus está localizado em um cone anal.
Sistema excretor (protonefrídios)
Na parte excretora estes grupos apresentam protonefrídios, onde os
Kin- estes apresentam um par de protonefrídios solenocitos no decimo segmento, cada um com um curto nefridioduto que se abre para o decimo primeiro segmento.
Pri- apresenta agrupamentos de protonefrídios com solenócitos, que estão na porção posterior da cavidade do corpo e estão associados com as gônadas, como um sistema ou complexo urogenital, os protonefrídios de priapulos são possivelmente únicos por serem compostos de duas ou mais células terminais, e um par de poros urogenital que se abre próximo ao ânus.
Lori- apresenta um par de protonefrídios monoflagelados situados dentro das gônadas 
Sistema nervoso (simples)
Kin- o sistema nervoso central associado a epiderme, onde uma serie de 10 ganglios conectados estão arranjados em um anel ao redor da faringe, e cada gânglio dará origem a um cordão nervoso longitudinal, os dois cordoes médio-ventral que vão ser mais predominantes em determinadas espécies, eles também vão sustentar gânglios em cada segmento, e no caso dos kinorynchas os receptores sensoriais incluem cerdas, espinhos e flósculos no corpo
Pri- apresentam um sistema nervoso intradérmico e construído em grande parte sobre um plano radial dentro do corpo cilíndrico, e embora um gânglio cerebral típico esteja ausente, existe um anel nervoso circum-etérico dentro do epitélio do tubo bucal, e o cordão nervoso ventral se origina deste anel e da origem a uma serie de anéis de nervos e nervos periféricos ao longo do corpo, neste grupo os nervos longitudinais se estendem do anel nervoso, ao longo do revestimento interno faríngeo e são conectados por anéis de comissuras, e o apêndice caudal é onde irá conter alguns receptores táteis.
Lori- sistema nervoso central deste grupo inclui um grande gânglio circunfaringeo e inúmeros gânglios menores associados com as várias régios e partes do corpo, um grande cordão nervoso ventral também possui gânglios. 
Cycloneuralia Nematoida
Sistema respiratório (Por difusão e movimentação dos fluidos corporais)
Nematoda : não há a presença de estruturas de trocas gasosas neles, estas funções também seram feitas por difusão e movimentos dos fluidos das cavidades corporais, como a gente viu nos grupos anteriores
Nematomorpha: também não apresenta estruturas próprias de trocas gasosas, sendo feita provavelmente por difusão
Sistema circulatório (Hemocele)
Nematoda: sem estruturas de circulação, são feitas através da difusão e movimentos dos fluidos das cavidades corporais
Nematomorpha: o transporte interno é feito por difusão pelo blastoceloma e do mesênquima, que é auxiliado pela movimentação dos fluidos
Sistema digestório 
Nematoda:. O trato digestivo deles vão variar de acordo com a complexidade e especialização da espécie, onde temos a boca localizada anteriormente que conduz uma cavidade bucal curta conectada a um esôfago estomodeal, revestido por cutícula, o esôfago neste caso é alongado e pode ser subdividido em regiões muscular e glandular, logo em seguida o intestino e o ânus na superfície ventral do corpo, em machos o reto é a cloaca, assim também recebem produtos do sistema reprodutivo.
Nematomorpha: ate recentemente acreditava-se que os nematomorphas se alimentavam apenas em seu estágio larval parasita,, mas atualmente se sabe que os adultos se alimentam a partir de nutrientes por absorsam de pequenas moléculas orgânicas através da parede do corpo e pelo trato digestivo diminuído.
No caso dos nematomorphas o trato digestivo é reduzido em vários graus, mas é fucional, nos indivíduos adultos é um tubo simples e alongado correndo pelo comprimento do corpo, o trato digestivo está ativamente envolvido com a tomada e armazenamento de nutrientes, transportados para ele pela parede bucal, e a região faríngea é tipicamente solida, o intestino é de parede fina e pode ter função excretora além da função digestiva. O trato digestivo anterior é proctodeal, funciona como cloaca e recebe os dutos reprodutivos
Sistema excretor 
Nematoda: a maioria apresenta sistema excretor únicas e aparentemente não homologas a qualquer um dos tipos de protonefrídios encontrados em metazoa. Existe uma sequencia evolutiva bem clara das diferentes estruturas excretoras entre os nematodes, a condição supostamente plesiomorfa ocorre em certos táxons de vida livre e tem sido modificada entre outros grupos.
Nematomorpha: funções excretoras e osmorreguladoras provavelmente operam a nível celular não existindo protonefrídios ou outra estrutura especializada, alguns pesquisadores acreditam que o trato digestivo deste animal pode se apresentar com função escretora.
Sistema nervoso
Nematoda: com alguma variação, a estrutura do sistema nervoso central é similar em todo filo, o gânglio cerebral é composto de um anel nervoso circum-esofagico e vários gânglios associados que contém a maioria das células nervosas do corpo. Uma coroa de nervos sensoriais e motores estende-se anteriormente a partir do anel nervoso e serve os órgãos sensoriais cefálicos e estruturas bucais. Via uma série de gânglios associados, nervos longitudinais estendem-se posteriormente, através dos cordões epidérmicos. O maior nervo do tronco é ventral e inclui ambas as fibras motoras e sensoriais. É formado pela união de tratos nervosos pareados que chegam mentalmente no anel nervoso e fundem-se posteriormente, onde o tronco principal possui gânglios. O cordão nervoso dorsal é motor e os tratos nervosos laterais menos desenvolvidos são predominantemente sensoriais. Comissuras laterais conectando alguns ou todos os nervos longitudinais ocorre em muitos nematódeos. Os órgãos sensoriais mais abundantes nos nematodes são as papilas e cerdas, que servem como receptores táteis, neste mundo dos vermes fortemente orientado pelo tato. Alguns nematodos de vida livre de água doce ou marinha, possui um par de ocelos pigmentados anteriores e ao menos alguns nematodos possuem células próprioceptoras nos cordões epidérmicos laterais, essas células sensoriais contém um cílio e aparentemente monitoram o povoamento do corpo durante a locomoção.
Nematomorpha: o sistema nervoso dos nematomorphos está ligado diretamente com a epiderme. O gânglio cerebral é uma massa de tecido nervoso circunfaringeo,localizado em uma região da cabeça chamada de calote, todos os nematomorphos são sensíveis ao toque, e alguns são quimiosensiveis