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Um técnico acabou de sequenciar um fragmento de uma região codificadora de uma enzima para quatro espécies de roedores. Examinando o alinhamento múltiplo final, a explicação mais provável para o padrão encontrado é: 
Seq. 1: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC
Seq. 2: ATG GAA GAA ATT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC
Seq. 3: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC
Seq. 4: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC
A explicação mais provável é que: 
Alternativas
a sequência 2 é de uma espécie diferente das outras três.
a reação de sequenciamento da espécie 2 deve estar contaminada.
ocorreu um erro na leitura do eletroferograma da espécie 2.
entre o terceiro e o quarto aminoácido deve haver uma dobra na proteína que aumentou a probabilidade de uma mutação.
o genoma da espécie apresenta um pseudogene para a proteína de modo que uma mudança no quadro de leitura não afetou a viabilidade do organismo.